e-Ciência Notícias Prémio Atribuído a Curta Metragem sobre Projecto Baseado em Computação Voluntária IBERCIVIS Prémio Atribuído a Curta Metragem sobre Projecto Baseado em Computação Voluntária IBERCIVIS
Uma curta-metragem sobre o projecto AMILOIDE, da autoria de Carlos Simões, do Laboratório Associado CNC - Centro Centro de Neurociências e Biologia Celular e da Universidade de Coimbra, recebeu o Prémio SPB/TTW – Connecting Science to People, atribuído no XVII Congresso Nacional de Bioquímica, em 15-17 de Dezembro de 2010. O projecto AMILOIDE visa a procura computacional, em bibliotecas de milhões de compostos de potenciais fármacos capazes de interferir com a formação de agregados e fibras amilóides em doenças neurodegenerativas, e tem como principais alvos a Polineuropatia Amilóide Familiar (PAF, vulgarmente conhecida por “doença dos pezinhos”) e a doença de Alzheimer. As simulações computacionais realizadas no âmbito do projecto, as quais envolveram mais de 2,3 milhões de compostos testados em 3 configurações-alvo, ou seja cerca de 7 milhões de ensaios, foram realizadas com base na doação voluntária de tempo de computadores pessoais para fins científicos no âmbito da iniciativa IBERCIVIS – O seu Computador Faz Ciência. Um trabalho que num único computador pessoal em permanente utilização levaria cerca de 50 anos a realizar foi efectuado em menos de seis meses em computadores disponibilizados em tempo parcial por cidadãos. Foram identificados vários compostos com potencialidades para possíveis fármacos cujos ensaios em laboratório já estão a ser realizados.
Este projecto é da responsabilidade dos cientistas do Grupo de Biologia Estrutural e Computacional do Centro de Neurociências e Biologia Celular (CNC) da Universidade de Coimbra.
A iniciativa IBERCIVIS – O seu Computador Faz Ciência, lançada em Julho 2009 em cooperação com Espanha (ver Iniciativa IBERCIVIS: Cidadãos Podem Doar Tempo dos Seus Computadores à Ciência), é parte de um movimento de cidadania científica que dá a cada pessoa a possibilidade de intervir em projectos de investigação nacional e internacional mediante cálculos realizados no seu computador pessoal por técnicas de computação distribuída semelhantes às da Computação Grid.
O computador transforma-se numa janela aberta para a ciência, criando um canal para o diálogo directo entre os investigadores e a sociedade.
As escolas também podem estar envolvidas na plataforma IBERCIVIS através da ligação dos seus computadores, o que permite a alunos e professores não só contribuírem para o avanço científico, como tomarem contacto com a investigação que está a ser feita nos laboratórios nacionais e estrangeiros.
A colaboração entre Portugal e Espanha nesta iniciativa ficou prevista nos acordos de cooperação assinados na XXIV Cimeira Luso-Espanhola, em 22 de Janeiro de 2009, em Zamora, Espanha, com vista ao alargamento a Portugal da iniciativa que tinha sido iniciada em Espanha em 2008, que, em Portugal, tem o apoio da UMIC – Agência para a Sociedade do Conhecimento, IP, da FCCN – Fundação para a Computação Científica Nacional e da Ciência Viva – Agência Nacional para a Cultura Científica e Tecnológica.
A colaboração empenhada do BIFI – Instituto para a Biocomputação e a Física dos Sistemas Complexos da Universidade de Saragoça permitiu a uma equipa que também envolveu investigadores e técnicos dos Laboratórios Associados CNC – Centro de Neurociências e Biologia Celular e do LIP – Laboratório de Instrumentação e Física Experimental de Partículas, sob a coordenação do Professor Rui Brito do CNC, instalar em tempo recorde os sistemas que permitiram alargar a iniciativa IBERCIVIS com o projecto AMILOIDE, dedicado à Polineuropatia Amilóide Familiar (PAF, vulgarmente conhecida por “doença dos pezinhos”) e à doença de Alzheimer.
Quem pretender aderir à iniciativa IBERCIVIS – O seu Computador Faz Ciência pode fazê-lo na Internet, em http://www.ibercivis.pt/, e podem escolher colaborar com o projecto AMILOIDE que visa o estudo de possíveis tratamentos da paramiloidose (doença dos pezinhos) ou com qualquer dos projectos já desenvolvidos por cientistas espanhóis no âmbito da IBERCIVIS, nomeadamente para: simulação de trajectórias no futuro reactor de Fusão Nuclear ITER – International Thermonuclear Experimental Reactor (Cadarache, França); acoplagem de ligandos a proteínas na procura de remédios para certos tipos de cancro; simulação do comportamento de materiais magnéticos com impurezas; análise de propriedades estruturais de aminoácidos e pequenos péptidos (sequências de algumas dezenas de aminoácidos) que actuam no cérebro e no sistema nervoso; simulação do comportamento da luz à escala nanométrica importante para construção de novos materiais; estudo das propriedades de adsorção de argilas PILCS (argilas pilarizadas) que têm grande importância industrial para catalização, armazenamento de gases e separação de substâncias, nomeadamente na produção de biocombustíveis a partir de gorduras vegetais, no armazenamento de gás natural à temperatura ambiente e no armazenamento de gases de efeito de estufa produzidos pelas indústrias; estudo da eficiência de radiações ionizantes em diagnóstico e terapêutica do cancro; estudo das propriedades de sistemas desordenados e da fractalidade na transição metal-isolador nas propriedades do transporte de electrões através de sistemas na transição de fase metal-isolador devida à alteração da amplitude da desordem. Todos estes projectos são descritos no portal da IBERCIVIS na Internet (http://www.ibercivis.pt/).
Esta iniciativa estende a já muito activa e particularmente bem sucedida cooperação entre Portugal e Espanha em e-Ciência, coordenada em Portugal pela UMIC – Agência para a Sociedade do Conhecimento, IP, nomeadamente no âmbito da Computação Grid através da iniciativa IBERGRID lançada há três anos e que visa gerir como infraestrutura comum as instalações das iniciativas de Computação Grid dos dois países, da Supercomputação, e da ligação em anel redundante das dorsais em cabo de fibra óptica das próprias redes de investigação e ensino dos dois países (RCTS – Rede Ciência Tecnologia e Sociedade em Portugal e Rede Iris em Espanha) nas fronteiras em Valença e Badajoz.
Publicação científica relacionada:
Carlos J. V. Simões, Trishna Mukherjee, Rui M. M. Brito, and Richard M. Jackson, Toward the Discovery of Functional Transthyretin Amyloid Inhibitors: Application of Virtual Screening Method, J. Chem. Inf. Model., 2010, 50 (10), pp 1806–1820.