- Fornecer a percepção de que a adaptabilidade é um dos principais factores que caracterizam os microrganismos e a essência do seu sucesso evolutivo. Fornecer uma visão integrada da biologia microbiana com a biologia molecular. Procura-se colocar a tónica na flexibilidade da resposta dos microrganismos a estímulos ambientais, utilizando a linguagem da biologia molecular, a qual é indispensável para o entendimento dos mecanismos sobre os quais se alicerça essa flexibilidade.

- Aquisição de conhecimentos sobre a diversidade e variabilidade existente nos vírus que infectam células eucarióticas.
- Desenvolvimento de capacidades de i) análise da diversidade de estratégias de expressão e de replicação viral na célula hospedeira; ii) análise da diversidade de factores do hospedeiro e ambientais relacionados com a infecciosidade viral; iii) estabelecer padrões comuns a diferentes grupos de vírus

Módulo de Microbiologia Molecular
Localização, secreção e direccionamento de proteínas. Estabilidade de proteínas no citoplasma e no periplasma de bactérias Gram-negativas: chaperones, proteases e sua regulação.
Translocação de proteínas através da membrana citoplasmática e inserção de proteínas em membranas: o sistema Sec e o sistema Tat. A via SRP. Biogénese de proteínas da membrana externa de bactérias Gram-negativas.
Proteínas associadas à parede celular: “sorting” e “targeting”.
Secreção de proteínas para o meio extracelular. Sistemas de secreção do tipoI, II, III, IV e V.
Relações evolutivas entre sistemas de exportação de proteínas e componentes de apêndices macromoleculares proteicos: montagem de fímbrias e flagelos
Transdução de sinais e mecanismos adaptativos em bactérias. A quimiotaxia como paradigma de transdução de sinais em bactérias.
Regulação hierárquica do transporte e utilização de fontes de carbono e azoto: os sistemas PTS e Ntr.
Comunicação celular e interacções com outros organismos: sinais de comunicação celular bacterianos, sensores de quorum e estratégias populacionais.
Divisão celular e diferenciação. Etapas moleculares na formação de endósporos
Regulação da bioluminescência em Vibrio. Conjugação em Agrobacterium tumefaciens.

Módulo de Virologia
A Virologia como ciência recente versus o “conhecimento” dos vírus desde a antiguidade.
A natureza dos vírus. Possíveis definições de vírus, organismo e vida.
Cronologia e impactos das principais descobertas em Virologia.
Discussão sobre algumas das metodologias utilizadas no estudo dos vírus.
Propriedades das partículas virais. Classificação e taxonomia dos vírus.
Variabilidade genética dos vírus: causas de variabilidade genética, e suas relações com os diferentes tipos de genoma viral. Diferentes tipos de mutantes virais.
Definição de quasiespécie. Partículas defectivas interferentes (D.I.), sua origem e propriedades.
Vírus com genoma segmentado e com genoma multipartido e estratégias de infecção e de replicação utilizadas.
Interacções genéticas entre vírus e entre vírus e respectivas células hospedeiras.
Metodologias utilizadas no estudo e identificação de genes virais.
Estudo de diversas famílias de vírus (1), aprofundando para cada uma delas, os seguintes aspectos: propriedades e estrutura do virião, estratégias de replicação e de expressão na célula hospedeira. Referência aos principais representantes de cada grupo estudado e às suas interacções com o/s hospedeiro/s naturais; possíveis estratégias de combate à sua propagação.
Epidemiologia de algumas doenças virais.
Os vírus como vectores de expressão.
Vacinas. Perspectivas futuras da Virologia.

(1) Grupos de vírus estudados com maior detalhe: Picornaviridae, Togaviridae, Flaviviridae, Coronaviridae, Rhabdoviridae, Paramyxoviridae, Orthomyxoviridae, Filoviridae, Bunyaviridae, Arenaviridae, Reoviridae, Retroviridae, Hepadnaviridae, Papovaviridae, Adenoviridae, Herpesviridae e Poxviridae.

Módulo de Microbiologia Molecular
Genes que afectam a adsorção de um vírus bacteriano ao seu hospedeiro
Adsorção reversível e irreversível~
Caracterização do operão YukE por mutagénese insercional. Avaliação da expressão génica por fusões a lacZ.
Secreção e actividade (in vivo e in vitro)de uma endolisina fágica

Bibliografia:
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(2)-São-José, C., Baptista, C. and Santos, M.A. (2004). A Bacillus subtilis operon encoding a membrane receptor for bacteriophage SPP1. J Bacteriol. 186: 8337-46

Módulo de Virologia
Cultura de células animais
Produção e titulação de vírus em culturas celulares.
Extracção, purificação e análise de um genoma viral (a partir do virião e de células infectadas).
Expressão do genoma viral in vivo (em células infectadas) e in vitro (em sistemas de tradução); análise dos polipéptidos virais.

Bibliografia:
(1) Caeiro, F. (1998). “Virologia – Trabalhos Práticos”. Ed. Associação dos Estudantes da Faculdade de Ciências de Lisboa.

A. Microbiologia Molecular

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