As unidades de investigação são os elementos-chave para o desenvolvimento da investigação e do conhecimento científico, no seio da Escola.
A Escola Superior de Educação e Ciências Sociais tem atualmente 6 unidades de investigação, que desenvolvem a sua atividade em diversas áreas científicas:
acessibilidade, antropologia, artes, ciências jurídicas, comunicação, educação, motricidade, serviço social, sociologia.