Programa Teórico |
A - CONTROLO DA EXPRESSÃO GÉNICA EM BACTÉRIAS
1. Revisões
2. Repressão catabólica – em bactérias Gram-negativas e em bactérias Gram-positivas.
3. Operões e Regulões
2. 1. Utilização da arabinose: operão ara
2.1.1. em E. coli:
2.1.2. em B. subtilis Operão do triptofano
2. 2. Operão do triptofano
2.3. Utilização da maltose em E. coli: regulão mal.
4. Mecanismos de controlo global
Sistemas reguladores de duas componentes
3.1. Quorum sensing. em Vibrio fisheri.
3.2. Regulação da síntese da porina: análise genética.
3.2. Regulação dos genes de virulência nas bactérias patogénicas. Cólera (Vibrio cholerae) e Difteria (Corynebacterium diphtheriae) .
3.4. Regulação da síntese dos RNAs de transferência e dos ribossomas.
B – ESTUDO DOS BACTERIÓFAGOS
1. Introdução
2. Desenvolvimento dos ciclos lítico e lisogénico.
3. Quantificação fágica
4. Ciclos de vida de alguns bacteriófagos
4.1. Genoma constituído por DNA de cadeia dupla: T4, 29, (ciclo lítico versus ciclo lisogénico), Mu, P1, fagos temperados de Bacillus subtilis (grupos de imunidade), fagos de Archaea, fagos de cianobactérias.
4.2. Genoma constituído por DNA de cadeia simples: X174, M13
4.3. Genoma constituído por RNA de cadeia simples: MS2
4.4. Genoma constituído por RNA de cadeia dupla: 6
C – TRANSFERÊNCIAS NATURAIS DE GENES EM BACTÉRIAS
1. Transformação
1.1. Indução do estado de competência.
1.2. Estudo do processo da transformação em Streptococcus pneumoniae e em B. subtilis.
1.3. Estudo do processo da transformação em Neisseria gonorrhoeae e em Haemophilus influenzae
1.4. Transformação plasmídica.
1.5. Transfecção.
2. Transdução
2.1. Transdução generalizada
2.2. Transdução especializada
2.3. Transdução abortiva.
3. Conjugação
3.1. Conjugação mediada por plasmídeos F
3.2. Estudo de outros sistemas conjugativos
3.3. Mobilização de cromossomas e de plasmídeos não auto-transmissíveis (em cis e em trans)
3.4. Conjugação em bactérias Gram-positivas
D – SEMINÁRIOS |
Literatura aconselhada |
Bacterial & Bacteriophage Genetics (2006)
E.A. Birge (Springer-Verlag)
Bacteriophages (2005)
Edited Elizabeth kutter & Alexander Sulakvelidze (CRC Press)
Genes VIII (2005)
Benjamin Lewin (Pearson Prentice Hall)
Microbiology (2005)
Prescott, Harley & Klein (McGraw-Hill)
Molecular Genetics of Bacteria (2003)
Larry Snyder & Wendy Chapness (ASM Press)
Bibliografia Complementar
Bacterial Conjugation (1993)
B. Lewin (Oxford, University Press)
Edited by D.B. Clewell, Plenum Press
Molecular Cell Biology (2004)
Lodish, Berk, Matsudaira, Kaiser, Krieger, Scott, Zipursky & Darnell (Freeman)
The Bacteriophages Vol I e II (2005)
Edited by R. Calendar (Plenum Press)
Virology (2001)
Levy, J.A., Fraenkel-Conrat, H. & Owens, R.A. (Prentice-Hall, Int)
Componente Prática
Adams, M.H. (1959). Bacteriophages. Wiley Interscience, NY
Inácio, J.M., Costa, C.. & Sá-Nogueira, I. (2003). Distinct molecular mechanisms involved in carbon catabolite repression of the arabinose regulon in Bacillus subtilis. Microbiol., 149: 2345-2355.
Isabel de Sá Nogueira (1985). Estudo de mutantes constitutivos para a utilização da L-arabinose em Bacillus subtilis. Relatório de Estágio, FCUL.
Maria Helena Paveia (1986). Genes de Bacillus subtilis para utilização da L-arabinose. Tese de Doutoramento, UL.
Mota, L.J., Tavares, P. & Sá-Nogueira, I. (1999). Mode of action of Ara R, the key regulator of L-arabinose metabolism in Bacillus subtilis. Molec. Microbiol., 33: 476-489.
Mota, L.J., Sarmento, L.M. & Sá-Nogueira, I. (2001). Control of Arabinose regulon in Bacillus subtilis by Ara R in vivo: crucial roles of operators, cooperativity and DNA looping. J. of Bacteriol., 183: 4190-4201.
Paveia, H. and Archer, L. (1992). Genes for L-arabinose utilization in Bacillus subtilis. Broteria Genetica, 13:149-159.
Paveia, H. and Archer, L. (1992). Mapping of ara genes in Bacillus subtilis. Broteria Genetica, 13:161-167.
Sá-Nogueira, I., Paveia, H. and de Lencastre, H. (1988). Isolation of constitutive mutants for L-arabinose utilization in Bacillus subtilis. J. of Bacteriol., 170: 2855-2857.
Sá-Nogueira, I. and de Lencastre, H. (1989). Cloning and characterization of araA, araB and araD, the structural genes for L-arabinose utilization in Bacillus subtilis. J. of Bacteriol., 171: 4088-4091.
Sá-Nogueira, I. and Mota, L.J. (1997). Negative regulation of L-arabinose metabolism in Bacillus subtilis: characterization of the araR (araC) gene. J. of Bacteriol., 179: 1598-1608.
Sá-Nogueira, I., Nogueira, T., Soares, S. and de Lencastre, H. (1997). The Bacillus subtilis L-arabinose (ara) operon: nucleotide sequence, genetic organization and expression. Microbiology, 143: 957-969.
Sandra Ramos (1996). Clonagem e sequenciação completa do gene araE envolvido na utilização da L-arabinose de Bacillus subtilis. Relatório de Estágio, FCUL.
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