Nuno Miguel da Silva Empadinhas. É da Universidade de Coimbra. Publicou 33 artigos em revistas especializadas, possui 2 capítulos de livros publicados. Possui 2 processos ou técnicas registados e outros 26 itens de produção técnica. Participou em 13 eventos no estrangeiro e 9 em Portugal. Actua na área de Ciências Biológicas Nas suas actividades profissionais interagiu com 79 colaboradores em co-autorias de trabalhos científicos.
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Nome completo Full name	Nuno Miguel da Silva Empadinhas
Nome em citações bibliográficas Quoting name	Empadinhas, Nuno
Domínio científico de atuação Scientific domain	Ciências Naturais-Ciências Biológicas. Ciências Médicas-Ciências da Saúde.

Endereço profissional Professional address

Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular Microbiologia Centro de Neurociências e Biologia Celular, Universidade de Coimbra Coimbra 3004-517 Coimbra Portugal Apartado: - Telefone: (+351)304502931Extensão: 140 Fax: (+351)239822776 Correio electrónico: numenius@cnc.uc.pt Homepage: http://www.cnbc.pt/research/areaD22_2.asp

Sexo Gender

Masculino»Male

2000-2004	Doutoramento Phd
Bioquímica/Microbiologia (4 anos » years) . Universidade de Coimbra, Portugal.

1990-1996	Licenciatura Licentiate degree
Biologia (4 anos » years) . Universidade de Coimbra, Portugal.

2005-2008	Pós-Doutoramento Postdoctorate

1998-1999	Especialização/ Pós-Graduação Specialization/ Postgraduation
Biologia Celular e Molecular. Universidade de Coimbra, Portugal.

Centro de Neurociencias e Biologia Celular Coimbra

Fev/2008-Actual

Investigador Auxiliar

Centro de Neurociencias e Biologia Celular Coimbra

Mar/2005-Jan/2008

Outra Situação

Centro de Neurociencias e Biologia Celular Coimbra

Jan/2000-Dez/2003

Outra Situação

Centro de Neurociencias e Biologia Celular Coimbra

Out/2012-Actual

Participação como Investigador responsável Participation as responsible Researcher

2013-2015 Biosynthesis of rare methylmannose polysaccharides in nontuberculous mycobacteria-Biosynthesis of rare methylmannose polysaccharides in nontuberculous mycobacteria

Referência do projeto»Project reference: PTDC/BIA-MIC/2779/2012. Financiador(es)»Funding: Fundação para a Ciência e a Tecnologia.

2012-2014 Unravelling the early steps in mycobacterial MGLP biosynthesis-Unravelling the early steps in mycobacterial MGLP biosynthesis

Referência do projeto»Project reference: Grant 120123. Mizutani Foundation for Glycoscience Financiador(es)»Funding: Mizutani Foundation for Glycoscience.

2011-2013 Pathway for the synthesis of the mycobacterial MGLP. Biochemical and structural characterization of the key enzymes-Pathway for the synthesis of the mycobacterial MGLP. Biochemical and structural characterization of the key enzymes

Referência do projeto»Project reference: PTDC/BIA-PRO/110523/2009. Parceiro(s)»Partners: Instituto de Biologia Molecular e Celular. Financiador(es)»Funding: Fundação para a Ciência e a Tecnologia.

2011-2013 The enigmatic mycobacterial maltokinase-The enigmatic mycobacterial maltokinase

Referência do projeto»Project reference: PTDC/BIA-BCM/112459/2009. Financiador(es)»Funding: Fundação para a Ciência e a Tecnologia.

Participação como Investigador Participation as Researcher

2010-2013 Hotmetal: exploiting marine hydrothermal spots for diversity of metal resistance-strategies together with antibiotic resistance dissemination-Hotmetal: exploiting marine hydrothermal spots for diversity of metal resistance-strategies together with antibiotic resistance dissemination

Referência do projeto»Project reference: PTDC/MAR/109057/2008.

2008-2009 Cloning, expression and regulation of genes for the synthesis of compatible solutes in Thermus thermophilus-Cloning, expression and regulation of genes for the synthesis of compatible solutes in Thermus thermophilus

Referência do projeto»Project reference: E-9/08. Financiador(es)»Funding: Conselho de Reitores das Universidades Portuguesas.

2005-2008 Nature’s shields to environmental stress. Biosynthesis of compatible solutes in extremely radiation-resistant Rubrobacter spp.-Nature’s shields to environmental stress. Biosynthesis of compatible solutes in extremely radiation-resistant Rubrobacter spp.

Referência do projeto»Project reference: POCI/BIA-MIC/56511/2004. Financiador(es)»Funding: Fundação para a Ciência e a Tecnologia.

Participação como Doutorando Participation as Phd student

2004-2006 Hotsolutes - new applications of compatible solutes from hyperthermophiles-Hotsolutes - new applications of compatible solutes from hyperthermophiles

Referência do projeto»Project reference: COOP-CT-2003-508644.

2002-2005 Hypersolutes - exploiting new solutes from hyperthermophiles for the preservation of biomaterials: cell factories for production of hypersolutes-Hypersolutes - exploiting new solutes from hyperthermophiles for the preservation of biomaterials: cell factories for production of hypersolutes

Referência do projeto»Project reference: QLK3-CT-2000-00640.

2002-2005 New compatible solutes from thermophiles and hyperthermophiles: Screening, identification and physiological role-New compatible solutes from thermophiles and hyperthermophiles: Screening, identification and physiological role

Referência do projeto»Project reference: POCTI/BIO/42331/2001.

2001-2004 Towards the utilization of cell-reactors for the production of mannosylglycerate, an enzyme stabilizer from hyperthermophiles-Towards the utilization of cell-reactors for the production of mannosylglycerate, an enzyme stabilizer from hyperthermophiles

Referência do projeto»Project reference: POCTI/BIO/35715/99.

Actual	Sociedade Portuguesa de Bioquímica, Membro.
Actual	Sociedade Portuguesa de Microbiologia, Membro.
Actual	European Society for Mycobacteriology, Membro.
Jun/2013 - Actual	TBnet, Membro.

Capítulos de livros publicados Published book chapters

1.	MS, Costa; Empadinhas, Nuno. 2005. Biosynthesis of the compatible solute mannosylglycerate from hyperthermophiles to mesophiles. Genes, enzymes and evolutionary perspectives.  In Adaptation to Life at High Salt Concentrations in Archaea, Bacteria, and Eukarya, 313 - 328. . Holanda: Elsevier.

2.	N, Empadinhas; Z, Silva; MS, Costa. 2003. Os solutos compatíveis como estratégia de sobrevivência a agressão osmótica.  In Biotecnologia: Fundamentos e Aplicações, ed. Nelson Lima e Manuel Mota, 51 - 67. ISBN: 972-757-197-2. Lisboa: Lidel Edições Técnicas.

Artigos em revistas com arbitragem científica Papers in periodics with scientific refereeing

1.	Alarico, Susana; Empadinhas, Nuno; da Costa, M. S. 2013. "A new bacterial hydrolase specific for the compatible solutes a-d-mannopyranosyl-(1¿2)-d-glycerate and a-d-glucopyranosyl-(1¿2)-d-glycerate", Enzyme and Microbial Technology 52, 2: 77 - 83.

2.	Mendes, Vitor; Maranha, Ana; Alarico, Susana; Empadinhas, Nuno. 2012. "Biosynthesis of mycobacterial methylglucose lipopolysaccharides", Natural Product Reports 29, 8: 834 - 834.

3.	Nobre, Ana; Empadinhas, Nuno; Nobre, Maria F; Lourenço, Eva C; Maycock, Christopher; Ventura, Maria R; Mingote, Ana; da Costa, M. S. 2012. "The plant Selaginella moellendorffii possesses enzymes for synthesis and hydrolysis of the compatible solutes mannosylglycerate and glucosylglycerate", Planta 237, 3: 891 - 901.

4.	Tiago, I.; Maranha, A.; Mendes, V.; Alarico, S.; Moynihan, P. J; Clarke, A. J; Macedo-Ribeiro, S.; Pereira, P. J. B; Empadinhas, N.. 2012. "Genome Sequence of Mycobacterium hassiacum DSM 44199, a Rare Source of Heat-Stable Mycobacterial Proteins", Journal of Bacteriology 194, 24: 7010 - 7011.

5.	Empadinhas, Nuno; Pereira, Pedro J. B; Albuquerque, Luciana; Costa, Joana; Sá-Moura, Bebiana; Marques, Alexandra T; Macedo-Ribeiro, Sandra; da Costa, M. S. 2011. "Functional and structural characterization of a novel mannosyl-3-phosphoglycerate synthase from Rubrobacter xylanophilus reveals its dual substrate specificity", Molecular Microbiology 79, 1: 76 - 93.

6.	Empadinhas, Nuno; da Costa, M. S. 2011. "Diversity, biological roles and biosynthetic pathways for sugar-glycerate containing compatible solutes in bacteria and archaea", Environmental Microbiology 13, 8: 2056 - 2077.

7.	Mendes, Vítor; Maranha, Ana; Alarico, Susana; da Costa, M. S; Empadinhas, Nuno. 2011. "Mycobacterium tuberculosis Rv2419c, the missing glucosyl-3-phosphoglycerate phosphatase for the second step in methylglucose lipopolysaccharide biosynthesis", Scientific Reports 1, 177: 1 - 8.

8.	Fernandes, C.; Mendes, V.; Costa, J.; Empadinhas, N.; Jorge, C.; Lamosa, P.; Santos, H.; da Costa, M. S. 2010. "Two Alternative Pathways for the Synthesis of the Rare Compatible Solute Mannosylglucosylglycerate in Petrotoga mobilis", Journal of Bacteriology 192, 6: 1624 - 1633.

9.	Mendes, Vítor; Maranha, Ana; Lamosa, Pedro; da Costa, M. S; Empadinhas, Nuno. 2010. "Biochemical characterization of the maltokinase from Mycobacterium bovis BCG", BMC Biochemistry 11, 1: 21 - 21.

10.	S, Alarico; MS, Costa; N, Empadinhas. 2008. "Molecular and physiological role of the trehalose-hydrolyzing alpha-glucosidase from Thermus thermophilus HB27", Journal of Bacteriology  7, 190: 2298 - 2305.

11.	N, Empadinhas; MS, Costa. 2008. "To be or not to be a compatible solute: Bioversatility of mannosylglycerate and glucosylglycerate", Systematic and Applied Microbiology 3, 31: 159 - 168.

12.	B, Sá-Moura; L, Albuquerque; N, Empadinhas; MS, Costa; PJB, Pereira; S, Macedo-Ribeiro. 2008. "Crystallization and preliminary crystallographic analysis of mannosyl-3-phosphoglycerate synthase from Rubrobacter xylanophilus", Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications 8, 64: 760 - 763.

13.	N, Empadinhas; MS, Costa. 2008. "Osmoadaptation mechanisms in prokaryotes: distribution of compatible solutes", International Microbiology  3, 11: 151 - 161.

14.	A, Nobre; S, Alarico; C, Fernandes; N, Empadinhas; MS, Costa. 2008. "A unique combination of genetic systems for the synthesis of trehalose in Rubrobacter xylanophilus: properties of a rare actinobacterial TreT", Journal of Bacteriology 24, 190: 7939 - 7946.

15.	N, Empadinhas; L, Albuquerque; V, Mendes; S, Macedo-Ribeiro; MS, Costa. 2008. "Identification of the mycobacterial glucosyl-3-phosphoglycerate synthase", FEMS Microbiology Letters  2, 280: 195 - 202.

16.	PJB, Pereira; N, Empadinhas; L, Albuquerque; B, Sá-Moura; MS, Costa; S, Macedo-Ribeiro. 2008. "Mycobacterium tuberculosis glucosyl-3-phosphoglycerate synthase: structural characterization of a key enzyme in methylglucose lipopolysaccharide biosynthesis", PLoS ONE 11, 3: 3748 - 3748.

17.	J, Costa; N, Empadinhas; MS, Costa. 2007. "Glucosylglycerate biosynthesis in the deepest lineage of the Bacteria: characterization of the thermophilic proteins GpgS and GpgP from Persephonella marina", Journal of Bacteriology  5, 189: 1648 - 1654.

18.	C, Fernandes; N, Empadinhas; MS, Costa. 2007. "Single-step pathway for synthesis of glucosylglycerate in Persephonella marina", Journal of Bacteriology  11, 189: 4014 - 4019.

19.	N, Empadinhas; V, Mendes; C, Simões; MS, Santos; A, Mingote; P, Lamosa; H, Santos; MS, Costa. 2007. "Organic solutes in Rubrobacter xylanophilus: the first example of di-myo-inositol-phosphate in a thermophile", Extremophiles 5, 11: 667 - 673.

20.	MV, Rodrigues; N, Borges; M, Henriques; P, Lamosa; R, Ventura; C, Fernandes; N, Empadinhas; C, Maycock; MS, Costa; H, Santos. 2007. "Bifunctional CTP:inositol-1-phosphate cytidylyltransferase/CDP-inositol:inositol-1-phosphate transferase, the key enzyme for di-myo-inositol-phosphate synthesis in several (hyper)thermophiles", Journal of Bacteriology 15, 189: 5405 - 5412.

21.	S, Alarico; N, Empadinhas; A, Mingote; C, Simões; MS, Santos; MS, Costa. 2007. "Mannosylglycerate is essential for osmotic adjustment in Thermus thermophilus strains HB27 and RQ-1", Extremophiles 6, 11: 833 - 840.

22.	J, Costa; N, Empadinhas; L, Gonçalves; P, Lamosa; H, Santos; MS, Costa. 2006. "Characterization of the biosynthetic pathway of glucosylglycerate in the archaeon Methanococcoides burtonii", Journal of Bacteriology  3, 188: 1022 - 1030.

23.	N, Empadinhas; MS, Costa. 2006. "Diversity and biosynthesis of compatible solutes in hyper/thermophiles", International Microbiology  3, 9: 199 - 206.

24.	AL, Pires; L, Albuquerque; I, Tiago; MF, Nobre; N, Empadinhas; A, Verissimo; MS, Costa. 2005. "Meiothermus timidus sp. nov., a new slightly thermophilic yellow-pigmented species", FEMS Microbiology Letters 1, 245: 39 - 45.

25.	S, Alarico; N, Empadinhas; C, Simões; Z, Silva; A, Henne; A, Mingote; H, Santos; MS, Costa. 2005. "Distribution of genes for synthesis of trehalose and mannosylglycerate in Thermus spp. and direct correlation of these genes with halotolerance", Applied and Environmental Microbiology  5, 71: 2460 - 2466.

26.	N, Borges; JD, Marugg; N, Empadinhas; MS, Costa; H, Santos. 2004. "Specialized roles of the two pathways for the synthesis of mannosylglycerate in osmoadaptation and thermoadaptation of Rhodothermus marinus", Journal of Biological Chemistry  11, 279: 9892 - 9898.

27.	N, Empadinhas; L, Albuquerque; J, Costa; SH, Zinder; MA, Santos; H, Santos; MS, Costa. 2004. "A gene from the mesophilic bacterium Dehalococcoides ethenogenes encodes a novel mannosylglycerate synthase", Journal of Bacteriology 13, 186: 4075 - 4084.

28.	N, Empadinhas; L, Albuquerque; A, Henne; H, Santos; MS, Costa. 2003. "The bacterium Thermus thermophilus, like hyperthermophilic archaea, uses a two-step pathway for the synthesis of mannosylglycerate", Applied and Environmental Microbiology 6, 69: 3272 - 3279.

29.	P, Santos; I, Pinhal; FA, Rainey; N, Empadinhas; J, Costa; B, Fields; R, Benson; A, Verissimo; MS, Costa. 2003. "Gamma-proteobacteria Aquicella lusitana gen. nov., sp. nov., and Aquicella siphonis sp. nov. infect protozoa and require activated charcoal for growth in laboratory media", Applied and Environmental Microbiology 11, 69: 6533 - 6540.

30.	L, Albuquerque; J, Santos; P, Travassos; MF, Nobre; FA, Rainey; R, Wait; N, Empadinhas; MT, Silva; MS, Costa. 2002. "Albidovulum inexpectatum gen. nov., sp. nov., a nonphotosynthetic and slightly thermophilic bacterium from a marine hot spring that is very closely related to members of the photosynthetic genus Rhodovulum", Applied and Environmental Microbiology 9, 68: 4266 - 4273.

31.	S, Alarico; FA, Rainey; N, Empadinhas; P, Schumann; MF, Nobre; MS, Costa. 2002. "Rubritepida flocculans gen. nov., sp. nov., a new slightly thermophilic member of the alpha-1 subclass of the Proteobacteria", Systematic and Applied Microbiology 2, 25: 198 - 206.

32.	N, Empadinhas; JD, Marugg; N, Borges; H, Santos; MS, Costa. 2001. "Pathway for the synthesis of mannosylglycerate in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii. Biochemical and genetic characterization of key enzymes", Journal of Biological Chemistry 47, 276: 43580 - 43588.

33.	LO, Martins; N, Empadinhas; JD, Marugg; C, Miguel; C, Ferreira; MS, Costa; H, Santos. 1999. "Biosynthesis of mannosylglycerate in the thermophilic bacterium Rhodothermus marinus. Biochemical and genetic characterization of a mannosylglycerate synthase", Journal of Biological Chemistry 50, 274: 35407 - 35414.

Processo com registo ou patente Process with patent or official record

1.

MS, Da C; Empadinhas, Nuno. Massive production of mycobacterial glucosyl-3-phosphoglycerate synthase and the use of this enzyme as a target for antimycobacterial substances,2009. Tipo de processo ou técnica: Outro;Natureza do processo ou técnica: Terapêutica. Patente: Patente de Invenção.n. WO2009028973,"Massive production of mycobacterial glucosyl-3-phosphoglycerate synthase and the use of this enzyme as a target for antimycobacterial substances".30 ago. 2007(Depósito);30 dez. 2008(Exame);15 mar. 2009(Concessão).

2.

MS, Da C; Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; H, Santos. Identification of a bifunctional gene for mannosylglycerate synthesis and development of a high-scale-production heterologous system based on Sacharomyces cerevisiae,2005. Tipo de processo ou técnica: Outro;Natureza do processo ou técnica: . Patente: Patente de Invenção.n. EP1526180,"Identification of a bifunctional gene for mannosylglycerate synthesis and development of a high-scale-production heterologous system based on Sacharomyces cerevisiae".

Apresentação oral de trabalho Oral work presentation

1.	Empadinhas, Nuno. Civilização: o Paraíso das Micobactérias,2013 (Conferência ou palestra).

2.	Empadinhas, Nuno. Reconstruction of mycobacterial pathways from missing enzyme links: playing hide and seek,2013 (Seminário).

3.	Empadinhas, Nuno. Missing links in mycobacterial MGLP biosynthesis: the early players,2012 (Seminário).

4.	Empadinhas, Nuno. Why is Mycobacterium tuberculosis a real and present threat?,2011 (Comunicação).

5.	Empadinhas, Nuno. O Planeta das Micobactérias,2010 (Conferência ou palestra).

6.	Empadinhas, Nuno. Biossíntese de polissacáridos raros em Mycobacterium: o Dia Mundial da Tuberculose,2010 (Conferência ou palestra).

7.

Empadinhas, Nuno; Pereira, Pedro J. B; Albuquerque, Luciana; Costa, Joana; Sá-Moura, Bebiana; Macedo-Ribeiro, Sandra; da Costa, M. S. Functional and structural characterization of a paradoxical glucosyl-3-phosphoglycerate synthase from Rubrobacter xylanophilus involved in mannosylglycerate synthesis in vivo,2010 (Poster).

8.	Empadinhas, Nuno. Identification of the mycobacterial glucosyl-3-phosphoglycerate synthase,2010 (Poster).

9.	da Costa, M. S; Empadinhas, Nuno. A caminho de um novo antibiótico,2008 (Conferência ou palestra).

10.	da Costa, M. S; Empadinhas, Nuno. Compatible solutes in thermophiles and hyperthermophiles: from the esoteric to the applied,2008 (Seminário).

11.	Empadinhas, Nuno; MS, Da C. Biosynthesis and accumulation of compatible solutes in hyper/thermophiles,Halophiles 2007, International Congress Exploring Life at High Salinity,Colchester,2007 (Conferência ou palestra).

12.	Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; J, Costa; MS, Da C. Rubrobacter xylanophilus mannosyl-3-phosphoglycerate synthase. evolution of mannosylglycerate and glucosylglycerate biosynthesis in prokaryotes,Extremophiles 2006, International Conference on Extremophiles,Brest,2006 (Conferência ou palestra).

13.	Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; J, Costa; MS, Da C. The mannosyl-3-phosphoglycerate synthase from Rubrobacter xylanophilus,Final Meeting of the “HotSolutes” Project,Carcavelos,2006 (Comunicação).

14.	Empadinhas, Nuno. Compatible solutes in the radiation-resistant bacterium Rubrobacter xylanophilus,2006 (Poster).

15.	Empadinhas, Nuno; Albuquerque, Luciana; Costa, Joana; da Costa, M. S. A highly divergent MpgS accounts for the synthesis of mannosylglycerate in the gram-positive bacterium Rubrobacter xylanophilus,2005 (Poster).

16.	Empadinhas, Nuno; J, Costa; MS, Da C. Nature’s shields to environmental stress: biosynthesis of compatible solutes in extremophiles,2nd Annual Meeting of the Centre for Neuroscience and Cell Biology,Luso,2004 (Comunicação).

17.	Empadinhas, Nuno; J, Costa; MS, Da C. Biosynthesis of glucosylglycerate: a “coldsolute” from prokaryotes,3rd Meeting of the “HotSolutes” Project,Ferrara,2004 (Comunicação).

18.	Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; J, Costa; MA, Santos; H, Santos; MS, Da C. Production of mannosylglycerate by Saccharomyces cerevisiae,6th Meeting of the “Hypersolutes” Project,Hamburg,2003 (Comunicação).

19.	Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; J, Costa; MA, Santos; H, Santos; MS, Da C. Production of mannosylglycerate in mesophilc organisms,5th Meeting of the “Hypersolutes” Project,Alcochete,2003 (Comunicação).

20.	Empadinhas, Nuno; Albuquerque, Luciana; A, Henne; da Costa, M. S; Santos, H.. The bacterium Thermus thermophilus, like hyperthermophilic archaea, uses a two-step pathway for the synthesis of mannosylglycerate,2003 (Poster).

21.	Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; SH, Zinder; H, Santos; MS, Da C. Synthesis of mannosylglycerate at room temperature: properties of a mesophilic mannosylglycerate synthase,3rd Meeting of the “Hypersolutes” Project,Coimbra,2002 (Comunicação).

22.	Empadinhas, Nuno; JD, Marugg; MS, Da C; H, Santos. Biosynthesis of mannosylglycerate in the hyperthermophile Pyrococcus horikoshii: characterization of key-enzymes,27th Meeting of the Federation of European Biochemical Societies,Lisboa,2001 (Comunicação).

23.	Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; SH, Zinder; H, Santos; MS, Da C. Genes for the synthesis of mannosylglycerate at high and room temperature: characterization of key-enzymes,2nd Meeting of the “Hypersolutes” Project,Konstanz,2001 (Comunicação).

24.	Empadinhas, Nuno. Pathway for the synthesis of mannosylglycerate in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii: Biochemical and genetic characterization of key-enzymes,2001 (Comunicação).

25.	Empadinhas, Nuno; JD, Marugg; N, Borges; Santos, H.; da Costa, M. S. Pathway for the synthesis of mannosylglycerate in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii: Biochemical and genetic characterization of key-enzymes,2001 (Poster).

26.	LO, Martins; Empadinhas, Nuno; da Costa, M. S; Santos, H.. Pathway for the synthesis of mannosylglycerate in Rhodothermus marinus: purification and characterization of mannosylglycerate synthase,1998 (Poster).

Orientações Orientations

Participação no júri de Graus Académicos Academic Degrees jury participation

Participação em eventos Event participation

Orientações Orientations

Tese de Doutoramento Phd Thesis

Concluídas Completed

1.	Vitor Gonçalo Mendes, Biosynthesis of methylated polysaccharides in mycobacteria: Identification of genes and characterization of enzymes, 2011. Tese (Bioquímica/Microbiologia) - Universidade de Coimbra, Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Orientador).

2.	Susana Elias Alarico, Relevance of mannosylglycerate and trehalose accumulation in the osmoadaptation of Thermus thermophilus, 2009. Tese (Biologia/Microbiologia) - Universidade de Coimbra, Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Co-orientador).

3.	Chantal Vicência Fernandes, Glucosylglycerate occurrence, biosynthesis and protein stabilizing effect, 2009. Tese (Bioquímica/Microbiologia) - Universidade de Coimbra, Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Co-orientador).

Em curso Ongoing

1.	Ana Maranha Tiago, The role of MGLP in the adaptation of saprophytic and pathogenic mycobacteria to stress, 2011. Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Orientador).

Dissertação de Mestrado Master degree dissertation

Concluídas Completed

1.	Mafalda Costa, Biosynthesis of rare methylglucose lipopolysaccharides in rapidly-growing mycobacteria: characerization of a key hydrolase, 2013. Dissertação (Bioquímica) - Universidade de Coimbra (Orientador).

2.	Andreia Lamaroso, Functional analysis of maltokinases and bifunctional trehalose synthases/maltokinases in bacteria, 2012. Dissertação (Bioquímica) - Universidade de Coimbra (Orientador).

Em curso Ongoing

1.	Diogo Reis, Metabolismo de açúcares em Mycobacterium marinum durante adaptação a stress: o papel do gene mak, 2012. Dissertação (Biotecnologia e Recursos Marinhos) - Instituto Politécnico de Leiria (Orientador).

2.	Ana Maranha Tiago, Transcriptional responses of the mycobacterial maltokinase to different growth conditions and during infection, 2009. Dissertação (Biologia Celular e Molecular) - Universidade de Coimbra (Orientador).

Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização Specialization course conclusion monograph

Concluídas Completed

1.	Luigina Cirelli, Optimization of expression and purification of a novel mycobacterial octanoyltransferase, 2012. (Orientador).

Trabalho de conclusão de curso de Bacharelato/Licenciatura Bachelor/Licenciate degree conclusion work

Concluídas Completed

1.	Emanuele Feleppa , Cloning and expression of novel genes of the biosynthetic pathway of a rare polysaccharide from Mycobacterium species, 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Licenciatura em Bioquímica) - Universita degli Studi - Siena (Orientador).

2.	Tânia Batista, Microbiologia das especiarias: um estudo de isolamento e identificação por biologia molecular, 2008. (Orientador).

Iniciação científica Scientific initiation

Concluídas Completed

1.	Vitor Manuel Carmona, Expressão, purificação e caracterização de uma nova fosfatase de Mycobacterium tuberculosis, 2009. Iniciação científica (Bioquímica) - Universidade de Coimbra (Orientador).

Orientação de outra natureza Other orientation

Em curso Ongoing

1.	Vitor Gonçalo Mendes, Molecular and physiological characterization of two crucial enzymes from Mycobacterium tuberculosis, 2012. Universidade de Coimbra, Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Orientador).

2.	Susana Elias Alarico, The early steps in methylglucose lipopolysaccharide biosynthesis in mycobacteria, 2012. Universidade de Coimbra, Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Orientador).

Participação no júri de Graus Académicos Academic Degrees jury participation

Doutoramento Phd

1.	Empadinhas, Nuno; Pereira, Pedro; Carrondo, Maria Arménia; Matias, Pedro. Participação no júri de Susana Pires Gonçalves. Structure-function relationships in a glycosyltransferase, a phosphatase and an oxidoreductase, 2012. Tese (Bioquímica) - Universidade Nova de Lisboa.

2.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de John Edward Pearl. The Adaptive Response of Mycobacterium avium to Anoxia and Nitric Oxide, 2012. Tese (Ciências Biomédicas) - Universidade do Porto.

3.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Vitor Gonçalo Mendes. New Insights into the Biosynthesis of the Mycobacterial Methylglucose Lipopolysaccharide, 2011. Tese (Bioquímica) - Universidade de Coimbra.

4.	Empadinhas, Nuno; Verissimo, António; Nobre, Maria Fernanda; da Costa, Milton S. Participação no júri de Susana Elias Alarico. Relevance of mannosylglycerate and trehalose accumulation in the osmoadaptation of Thermus thermophilus, 2009. Tese (Biologia/Microbiologia) - Universidade de Coimbra.

5.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Chantal Vicencia Fernandes. Glucosylglycerate occurrence, biosynthesis and protein stabilizing effect, 2009. Tese (Bioquímica/Microbiologia) - Universidade de Coimbra.

Mestrado Master degree

1.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Mafalda Santos Costa. Biosynthesis of methylglucose lipopolysaccharides in rapidly-growing mycobacteria: characterization of a key hydrolase, 2013.

2.	Empadinhas, Nuno; Pedro Castanheira; Paula Verissimo; Euclides Pires. Participação no júri de Paulo Espirito Santo. Screening of Saccharomyces cerevisiae strains for recombinant protein expression, 2013.

3.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Rui Marques Costa. Diversity of arsenite transporter genes present in microbial populations of the abandoned uranium mine in Urgeiriça, 2013.

4.	Empadinhas, Nuno; Verissimo, António; Costa, Joana; Morais, Paula. Participação no júri de Andreia Mendes Lamaroso. Análise functional de maltocinases e trealose sintases/maltocinases bifuncionais, 2012.

5.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Sónia Costa André. Analysis of the antimicrobial content of amphibian skin secretions and structural and functional characterization of a novel member of the temporin family (temporin-SHe), 2012.

6.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Luisa Silva Lopes. Estratificação vertical das comunidades microbianas da zona mesopelágica, no Atlântico Norte, determinada por pirosequenciação do 16S DNAr, 2011.

7.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Tânia Miranda Sousa. Characterization of bacterial strains resistant to uranium for use in bioremediation, 2011.

8.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Pedro Miguel Abreu. Formation and analysis of metal-induced phosphate rich extracellular nano-particulate in the Cr(VI) resistant strain Ochrobactrum tritici 5bv11 , 2011.

9.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Ana Filipa d Avó. Evolução molecular dos genes pilD e lspE de Legionella pneumophila, 2010.  Dissertação (Bioquímica) - Universidade de Coimbra.

10.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Ana Maranha Tiago. A multifactorial approach to the biological role of the mycobacterial maltokinase, 2010.

11.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Ana Carina Madureira. Role of Hsp60 and its peptide aa437-460 in experimental Sjogren’s syndrome, 2008.  Dissertação (Bioquímica) - Universidade de Coimbra.

Exame de qualificação de doutoramento Phd qualification test

1.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Ana Maranha Tiago. The role of MGLP in the thermal adaptation of saprophytic and pathogenic mycobacteria, 2011.

Bacharelato/Licenciatura Degree of licentiate

1.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Liliana Varela. Carcinoma gástrico: Alguns marcadores moleculares da sua etiopatogenia e história natural, 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelato/Licenciatura em Bioquímica) - Universidade de Coimbra.

2.

Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Maria Manuel Nunes. Role of T cells in the pathophysiology and immunotherapy of Alzheimer’s disease: optimization of immunization conditions and identification of A¿-derived CD4 T cell epitopes in H-2 haplotypes, 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelato/Licenciatura em Bioquímica) - Universidade de Coimbra.

3.	Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Selma Lopes. hCD3¿ and hCD3d subunit buried surface analyses in the aßTCR-CD3 complex, 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelato/Licenciatura em Bioquímica) - Universidade de Coimbra.

Participação em eventos Event participation

Participação como Keynote Speaker Participation as Keynote Speaker

1.	Novas terapias baseadas na manipulação do Microbioma, 2013 (Seminário).

2.	O Microbioma Humano, 2013 (Seminário). Cidade do evento: Mamarrosa.

3.	Biosynthesis of glucosylglycerate: A “coldsolute” from prokaryotes, 2004 (Encontro). Nome do evento: 3rd Meeting of the “HotSolutes”; Cidade do evento: Ferrara.

4.	Production of mannosylglycerate by Saccharomyces cerevisiae, 2003 (Encontro). Nome do evento: 6th Meeting of the “Hypersolutes”; Cidade do evento: Hamburg.

5.	Genes for the synthesis of mannosylglycerate at high and room temperature: characterization of key-enzymes, 2001 (Encontro). Nome do evento: 2nd Meeting of the “Hypersolutes”; Cidade do evento: Konstanz.

Participação como Relator Participation as Commentator

1.	Reconstruction of mycobacterial pathways from missing enzyme links: playing hide and seek , 2013 (Seminário). Cidade do evento: Coimbra.

2.	Nature’s shields to environmental stress: Biosynthesis of compatible solutes in extremophiles, 2004 (Encontro). Nome do evento: 2nd Annual Meeting of the Center for Neuroscience and Cell Biology; Cidade do evento: Luso.

Outro tipo de participação Other kind of participation

1.	The early steps in mycobacterial MGLP biosynthesis: the players, 2013 (Congresso). Nome do evento: EuroCarb17; Cidade do evento: Telavive.

2.	Comparative studies on mycobacterial maltokinases: saprophytes versus pathogens, 2011 (Congresso). Nome do evento: 8th International Conference on the Pathogenesis of Mycobacterial Infections.

3.	Functional and structural characterization of a paradoxical glucosyl-3-phosphoglycerate synthase from Rubrobacter xylanophilus involved in mannosylglycerate synthesis in vivo, 2010 (Congresso). Nome do evento: Extremophiles 2010; Cidade do evento: Ponta Delgada.

4.

Biosynthesis of the MGLP in Mycobacterium tuberculosis. Identification of genes and characterization of enzymes, 2008 (Encontro). Nome do evento: 6th Annual Meeting of the Centre for Neuroscience and Cell Biology; Nome da Instituição: Centro de Neurociências e Biologia Celular; Cidade do evento: Coimbra / Fundação Bissaya Barreto.

4.	A caminho dum novo antibiótico, 2008 (Encontro). Nome do evento: Semana da Tuberculose; Cidade do evento: Lisboa.

6.	Biosynthesis and accumulation of compatible solutes in hyper/thermophiles, 2007 (Congresso). Nome do evento: International Congress Exploring Life at High Salinity; Cidade do evento: Colchester / Wivenhoe Park, University of Essex, Colchester, United Kingdom.

7.	Compatible solutes in the radiation-resistant bacterium Rubrobacter xylanophilus, 2006 (Congresso). Nome do evento: 2nd FEMS Congress of European Microbiologists; Cidade do evento: Madrid.

8.	The mannosyl-3-phosphoglycerate synthase from Rubrobacter xylanophilus, 2006 (Encontro). Nome do evento: Final Meeting of the “HotSolutes” Project; Cidade do evento: Carcavelos.

9.	Rubrobacter xylanophilus mannosyl-3-phosphoglycerate synthase. evolution of mannosylglycerate and glucosylglycerate biosynthesis in prokaryotes, 2006 (Conferência). Nome do evento: Extremophiles 2006 Conference; Cidade do evento: Brest / Brest, France.

10.	A highly divergent MpgS accounts for the synthesis of mannosylglycerate in the gram-positive bacterium Rubrobacter xylanophilus, 2005 (Congresso). Nome do evento: 30th FEBS Congress: The Protein World; Cidade do evento: Budapest.

11.	The bacterium Thermus thermophilus, like hyperthermophilic archaea, uses a two-step pathway for the synthesis of mannosylglycerate, 2003 (Congresso). Nome do evento: 1st FEMS Congress of European Microbiologists; Cidade do evento: Ljubljana.

12.	Biosynthesis of mannosylglycerate in the hyperthermophile Pyrococcus horikoshii: characterization of key-enzymes, 2001 (Congresso). Nome do evento: 27th Meeting of the Federation of European Biochemical Societies; Nome da Instituição: FEBS; Cidade do evento: Lisboa.

13.	The genes involved in compatible solute biosynthesis in Rhodothermus marinus and Thermus thermophilus, 1999 (Encontro). Nome do evento: 3rd Meeting on Extremophiles as Cell Factories; Cidade do evento: Graz.

14.	Molecular cloning of the genes involved in compatible solute biosynthesis in Rhodothermus marinus and Thermus thermophilus, 1998 (Congresso). Nome do evento: Thermophiles 98; Cidade do evento: Brest.

15.	Pathway for the synthesis of mannosylglycerate in Rhodothermus marinus: purification and characterization of mannosylglycerate synthase, 1998 (Conferência). Nome do evento: Second Meeting on Extremophiles as Cell Factories; Cidade do evento: Dublin.

Produção científica Scientific production

Produção técnica Technical production

Dados complementares data

Total

Produção científica Scientific production

35

Livros e capítulos Books and book chapters

2

Capítulos de livros publicados Published book chapters

2

Artigos científicos em revistas Papers in periodics

33

Com arbitragem científica With scientific refereeing

33

Total

Produção técnica Technical production

28

Processos ou técnicas Processes or techiniques

2

Processos ou técnicas com registo ou patente Processes or techiniques with patent or official record

2

Outros tipos de produção técnica Other technical production

26

Total

Dados complementares (Additional data)

58

Orientações Orientations

16

Participação no Júri de Graus Académicos Academic Degrees jury participation

20

Participação em Eventos Event participation

22

	Ana Branco Maranha Tiago
	António Manuel Veríssimo Pires
	Joana Cardoso da Costa
	Maria Helena Dias dos Santos
	Milton Simões da Costa

Paula Maria de Melim e Vasconcelos de Vitorino Morais