Curriculum Vitae

Nuno Miguel da Silva Empadinhas

Data da última atualização »Last update : 20/11/2013


Nuno Miguel da Silva Empadinhas. É da Universidade de Coimbra. Publicou 33 artigos em revistas especializadas, possui 2 capítulos de livros publicados. Possui 2 processos ou técnicas registados e outros 26 itens de produção técnica. Participou em 13 eventos no estrangeiro e 9 em Portugal. Actua na área de Ciências Biológicas Nas suas actividades profissionais interagiu com 79 colaboradores em co-autorias de trabalhos científicos.


Endereço de acesso a este CV:

http://www.degois.pt/visualizador/curriculum.jsp?key=4548502382024443


Dados pessoais (Personal data)
Nome completo
Full name
Nuno Miguel da Silva Empadinhas
Nome em citações bibliográficas
Quoting name
Empadinhas, Nuno
Domínio científico de atuação
Scientific domain
Ciências Naturais-Ciências Biológicas.
Ciências Médicas-Ciências da Saúde.
Endereço profissional
Professional address
Universidade de Coimbra
Centro de Neurociências e Biologia Celular
Microbiologia
Centro de Neurociências e Biologia Celular, Universidade de Coimbra
Coimbra
3004-517 Coimbra
Portugal
Apartado: -
Telefone: (+351)304502931Extensão: 140
Fax: (+351)239822776
Correio electrónico: numenius@cnc.uc.pt
Homepage: http://www.cnbc.pt/research/areaD22_2.asp
Sexo
Gender
Masculino»Male




Graus Académicos (Academic Degrees)
2000-2004 Doutoramento
Phd
Bioquímica/Microbiologia (4 anos » years) .
Universidade de Coimbra, Portugal.

1990-1996 Licenciatura
Licentiate degree
Biologia (4 anos » years) .
Universidade de Coimbra, Portugal.





Formação complementar ( studies)
2005-2008 Pós-Doutoramento
Postdoctorate

1998-1999 Especialização/ Pós-Graduação
Specialization/ Postgraduation
Biologia Celular e Molecular.
Universidade de Coimbra, Portugal.





Vínculos profissionais (Professional Positions)
Centro de Neurociencias e Biologia Celular Coimbra
Fev/2008-Actual Investigador Auxiliar

Centro de Neurociencias e Biologia Celular Coimbra
Mar/2005-Jan/2008 Outra Situação

Centro de Neurociencias e Biologia Celular Coimbra
Jan/2000-Dez/2003 Outra Situação





Atividades de Investigação e Desenvolvimento (Research and Development activities)
Centro de Neurociencias e Biologia Celular Coimbra
Out/2012-Actual






Projetos de Investigação (Research projects)
Participação como Investigador responsável
Participation as responsible Researcher
2013-2015
Biosynthesis of rare methylmannose polysaccharides in nontuberculous mycobacteria-Biosynthesis of rare methylmannose polysaccharides in nontuberculous mycobacteria
Referência do projeto»Project reference: PTDC/BIA-MIC/2779/2012.
Financiador(es)»Funding: Fundação para a Ciência e a Tecnologia.

2012-2014
Unravelling the early steps in mycobacterial MGLP biosynthesis-Unravelling the early steps in mycobacterial MGLP biosynthesis
Referência do projeto»Project reference: Grant 120123.
Mizutani Foundation for Glycoscience
Financiador(es)»Funding: Mizutani Foundation for Glycoscience.

2011-2013
Pathway for the synthesis of the mycobacterial MGLP. Biochemical and structural characterization of the key enzymes-Pathway for the synthesis of the mycobacterial MGLP. Biochemical and structural characterization of the key enzymes
Referência do projeto»Project reference: PTDC/BIA-PRO/110523/2009.
Parceiro(s)»Partners: Instituto de Biologia Molecular e Celular.
Financiador(es)»Funding: Fundação para a Ciência e a Tecnologia.

2011-2013
The enigmatic mycobacterial maltokinase-The enigmatic mycobacterial maltokinase
Referência do projeto»Project reference: PTDC/BIA-BCM/112459/2009.
Financiador(es)»Funding: Fundação para a Ciência e a Tecnologia.


Participação como Investigador
Participation as Researcher
2010-2013
Hotmetal: exploiting marine hydrothermal spots for diversity of metal resistance-strategies together with antibiotic resistance dissemination-Hotmetal: exploiting marine hydrothermal spots for diversity of metal resistance-strategies together with antibiotic resistance dissemination
Referência do projeto»Project reference: PTDC/MAR/109057/2008.

2008-2009
Cloning, expression and regulation of genes for the synthesis of compatible solutes in Thermus thermophilus-Cloning, expression and regulation of genes for the synthesis of compatible solutes in Thermus thermophilus
Referência do projeto»Project reference: E-9/08.
Financiador(es)»Funding: Conselho de Reitores das Universidades Portuguesas.

2005-2008
Nature’s shields to environmental stress. Biosynthesis of compatible solutes in extremely radiation-resistant Rubrobacter spp.-Nature’s shields to environmental stress. Biosynthesis of compatible solutes in extremely radiation-resistant Rubrobacter spp.
Referência do projeto»Project reference: POCI/BIA-MIC/56511/2004.
Financiador(es)»Funding: Fundação para a Ciência e a Tecnologia.


Participação como Doutorando
Participation as Phd student
2004-2006
Hotsolutes - new applications of compatible solutes from hyperthermophiles-Hotsolutes - new applications of compatible solutes from hyperthermophiles
Referência do projeto»Project reference: COOP-CT-2003-508644.

2002-2005
Hypersolutes - exploiting new solutes from hyperthermophiles for the preservation of biomaterials: cell factories for production of hypersolutes-Hypersolutes - exploiting new solutes from hyperthermophiles for the preservation of biomaterials: cell factories for production of hypersolutes
Referência do projeto»Project reference: QLK3-CT-2000-00640.

2002-2005
New compatible solutes from thermophiles and hyperthermophiles: Screening, identification and physiological role-New compatible solutes from thermophiles and hyperthermophiles: Screening, identification and physiological role
Referência do projeto»Project reference: POCTI/BIO/42331/2001.

2001-2004
Towards the utilization of cell-reactors for the production of mannosylglycerate, an enzyme stabilizer from hyperthermophiles-Towards the utilization of cell-reactors for the production of mannosylglycerate, an enzyme stabilizer from hyperthermophiles
Referência do projeto»Project reference: POCTI/BIO/35715/99.






Membro de Associações Profissionais/Científicas (Professional/Scientific Association membership)
Actual Sociedade Portuguesa de Bioquímica, Membro.
Actual Sociedade Portuguesa de Microbiologia, Membro.
Actual European Society for Mycobacteriology, Membro.
Jun/2013 - Actual TBnet, Membro.




Produção científica, técnica e artística/cultural (Scientific, technical and artistical/cultural production)
Capítulos de livros publicados
Published book chapters
1. MS, Costa; Empadinhas, Nuno. 2005. Biosynthesis of the compatible solute mannosylglycerate from hyperthermophiles to mesophiles. Genes, enzymes and evolutionary perspectives.  In Adaptation to Life at High Salt Concentrations in Archaea, Bacteria, and Eukarya, 313 - 328. . Holanda: Elsevier.
2. N, Empadinhas; Z, Silva; MS, Costa. 2003. Os solutos compatíveis como estratégia de sobrevivência a agressão osmótica.  In Biotecnologia: Fundamentos e Aplicações, ed. Nelson Lima e Manuel Mota, 51 - 67. ISBN: 972-757-197-2. Lisboa: Lidel Edições Técnicas.

Artigos em revistas com arbitragem científica
Papers in periodics with scientific refereeing
1. Alarico, Susana; Empadinhas, Nuno; da Costa, M. S. 2013. "A new bacterial hydrolase specific for the compatible solutes a-d-mannopyranosyl-(1¿2)-d-glycerate and a-d-glucopyranosyl-(1¿2)-d-glycerate", Enzyme and Microbial Technology 52, 2: 77 - 83.
2. Mendes, Vitor; Maranha, Ana; Alarico, Susana; Empadinhas, Nuno. 2012. "Biosynthesis of mycobacterial methylglucose lipopolysaccharides", Natural Product Reports 29, 8: 834 - 834.
3. Nobre, Ana; Empadinhas, Nuno; Nobre, Maria F; Lourenço, Eva C; Maycock, Christopher; Ventura, Maria R; Mingote, Ana; da Costa, M. S. 2012. "The plant Selaginella moellendorffii possesses enzymes for synthesis and hydrolysis of the compatible solutes mannosylglycerate and glucosylglycerate", Planta 237, 3: 891 - 901.
4. Tiago, I.; Maranha, A.; Mendes, V.; Alarico, S.; Moynihan, P. J; Clarke, A. J; Macedo-Ribeiro, S.; Pereira, P. J. B; Empadinhas, N.. 2012. "Genome Sequence of Mycobacterium hassiacum DSM 44199, a Rare Source of Heat-Stable Mycobacterial Proteins", Journal of Bacteriology 194, 24: 7010 - 7011.
5. Empadinhas, Nuno; Pereira, Pedro J. B; Albuquerque, Luciana; Costa, Joana; Sá-Moura, Bebiana; Marques, Alexandra T; Macedo-Ribeiro, Sandra; da Costa, M. S. 2011. "Functional and structural characterization of a novel mannosyl-3-phosphoglycerate synthase from Rubrobacter xylanophilus reveals its dual substrate specificity", Molecular Microbiology 79, 1: 76 - 93.
6. Empadinhas, Nuno; da Costa, M. S. 2011. "Diversity, biological roles and biosynthetic pathways for sugar-glycerate containing compatible solutes in bacteria and archaea", Environmental Microbiology 13, 8: 2056 - 2077.
7. Mendes, Vítor; Maranha, Ana; Alarico, Susana; da Costa, M. S; Empadinhas, Nuno. 2011. "Mycobacterium tuberculosis Rv2419c, the missing glucosyl-3-phosphoglycerate phosphatase for the second step in methylglucose lipopolysaccharide biosynthesis", Scientific Reports 1, 177: 1 - 8.
8. Fernandes, C.; Mendes, V.; Costa, J.; Empadinhas, N.; Jorge, C.; Lamosa, P.; Santos, H.; da Costa, M. S. 2010. "Two Alternative Pathways for the Synthesis of the Rare Compatible Solute Mannosylglucosylglycerate in Petrotoga mobilis", Journal of Bacteriology 192, 6: 1624 - 1633.
9. Mendes, Vítor; Maranha, Ana; Lamosa, Pedro; da Costa, M. S; Empadinhas, Nuno. 2010. "Biochemical characterization of the maltokinase from Mycobacterium bovis BCG", BMC Biochemistry 11, 1: 21 - 21.
10. S, Alarico; MS, Costa; N, Empadinhas. 2008. "Molecular and physiological role of the trehalose-hydrolyzing alpha-glucosidase from Thermus thermophilus HB27", Journal of Bacteriology  7, 190: 2298 - 2305.
11. N, Empadinhas; MS, Costa. 2008. "To be or not to be a compatible solute: Bioversatility of mannosylglycerate and glucosylglycerate", Systematic and Applied Microbiology 3, 31: 159 - 168.
12. B, Sá-Moura; L, Albuquerque; N, Empadinhas; MS, Costa; PJB, Pereira; S, Macedo-Ribeiro. 2008. "Crystallization and preliminary crystallographic analysis of mannosyl-3-phosphoglycerate synthase from Rubrobacter xylanophilus", Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications 8, 64: 760 - 763.
13. N, Empadinhas; MS, Costa. 2008. "Osmoadaptation mechanisms in prokaryotes: distribution of compatible solutes", International Microbiology  3, 11: 151 - 161.
14. A, Nobre; S, Alarico; C, Fernandes; N, Empadinhas; MS, Costa. 2008. "A unique combination of genetic systems for the synthesis of trehalose in Rubrobacter xylanophilus: properties of a rare actinobacterial TreT", Journal of Bacteriology 24, 190: 7939 - 7946.
15. N, Empadinhas; L, Albuquerque; V, Mendes; S, Macedo-Ribeiro; MS, Costa. 2008. "Identification of the mycobacterial glucosyl-3-phosphoglycerate synthase", FEMS Microbiology Letters  2, 280: 195 - 202.
16. PJB, Pereira; N, Empadinhas; L, Albuquerque; B, Sá-Moura; MS, Costa; S, Macedo-Ribeiro. 2008. "Mycobacterium tuberculosis glucosyl-3-phosphoglycerate synthase: structural characterization of a key enzyme in methylglucose lipopolysaccharide biosynthesis", PLoS ONE 11, 3: 3748 - 3748.
17. J, Costa; N, Empadinhas; MS, Costa. 2007. "Glucosylglycerate biosynthesis in the deepest lineage of the Bacteria: characterization of the thermophilic proteins GpgS and GpgP from Persephonella marina", Journal of Bacteriology  5, 189: 1648 - 1654.
18. C, Fernandes; N, Empadinhas; MS, Costa. 2007. "Single-step pathway for synthesis of glucosylglycerate in Persephonella marina", Journal of Bacteriology  11, 189: 4014 - 4019.
19. N, Empadinhas; V, Mendes; C, Simões; MS, Santos; A, Mingote; P, Lamosa; H, Santos; MS, Costa. 2007. "Organic solutes in Rubrobacter xylanophilus: the first example of di-myo-inositol-phosphate in a thermophile", Extremophiles 5, 11: 667 - 673.
20. MV, Rodrigues; N, Borges; M, Henriques; P, Lamosa; R, Ventura; C, Fernandes; N, Empadinhas; C, Maycock; MS, Costa; H, Santos. 2007. "Bifunctional CTP:inositol-1-phosphate cytidylyltransferase/CDP-inositol:inositol-1-phosphate transferase, the key enzyme for di-myo-inositol-phosphate synthesis in several (hyper)thermophiles", Journal of Bacteriology 15, 189: 5405 - 5412.
21. S, Alarico; N, Empadinhas; A, Mingote; C, Simões; MS, Santos; MS, Costa. 2007. "Mannosylglycerate is essential for osmotic adjustment in Thermus thermophilus strains HB27 and RQ-1", Extremophiles 6, 11: 833 - 840.
22. J, Costa; N, Empadinhas; L, Gonçalves; P, Lamosa; H, Santos; MS, Costa. 2006. "Characterization of the biosynthetic pathway of glucosylglycerate in the archaeon Methanococcoides burtonii", Journal of Bacteriology  3, 188: 1022 - 1030.
23. N, Empadinhas; MS, Costa. 2006. "Diversity and biosynthesis of compatible solutes in hyper/thermophiles", International Microbiology  3, 9: 199 - 206.
24. AL, Pires; L, Albuquerque; I, Tiago; MF, Nobre; N, Empadinhas; A, Verissimo; MS, Costa. 2005. "Meiothermus timidus sp. nov., a new slightly thermophilic yellow-pigmented species", FEMS Microbiology Letters 1, 245: 39 - 45.
25. S, Alarico; N, Empadinhas; C, Simões; Z, Silva; A, Henne; A, Mingote; H, Santos; MS, Costa. 2005. "Distribution of genes for synthesis of trehalose and mannosylglycerate in Thermus spp. and direct correlation of these genes with halotolerance", Applied and Environmental Microbiology  5, 71: 2460 - 2466.
26. N, Borges; JD, Marugg; N, Empadinhas; MS, Costa; H, Santos. 2004. "Specialized roles of the two pathways for the synthesis of mannosylglycerate in osmoadaptation and thermoadaptation of Rhodothermus marinus", Journal of Biological Chemistry  11, 279: 9892 - 9898.
27. N, Empadinhas; L, Albuquerque; J, Costa; SH, Zinder; MA, Santos; H, Santos; MS, Costa. 2004. "A gene from the mesophilic bacterium Dehalococcoides ethenogenes encodes a novel mannosylglycerate synthase", Journal of Bacteriology 13, 186: 4075 - 4084.
28. N, Empadinhas; L, Albuquerque; A, Henne; H, Santos; MS, Costa. 2003. "The bacterium Thermus thermophilus, like hyperthermophilic archaea, uses a two-step pathway for the synthesis of mannosylglycerate", Applied and Environmental Microbiology 6, 69: 3272 - 3279.
29. P, Santos; I, Pinhal; FA, Rainey; N, Empadinhas; J, Costa; B, Fields; R, Benson; A, Verissimo; MS, Costa. 2003. "Gamma-proteobacteria Aquicella lusitana gen. nov., sp. nov., and Aquicella siphonis sp. nov. infect protozoa and require activated charcoal for growth in laboratory media", Applied and Environmental Microbiology 11, 69: 6533 - 6540.
30. L, Albuquerque; J, Santos; P, Travassos; MF, Nobre; FA, Rainey; R, Wait; N, Empadinhas; MT, Silva; MS, Costa. 2002. "Albidovulum inexpectatum gen. nov., sp. nov., a nonphotosynthetic and slightly thermophilic bacterium from a marine hot spring that is very closely related to members of the photosynthetic genus Rhodovulum", Applied and Environmental Microbiology 9, 68: 4266 - 4273.
31. S, Alarico; FA, Rainey; N, Empadinhas; P, Schumann; MF, Nobre; MS, Costa. 2002. "Rubritepida flocculans gen. nov., sp. nov., a new slightly thermophilic member of the alpha-1 subclass of the Proteobacteria", Systematic and Applied Microbiology 2, 25: 198 - 206.
32. N, Empadinhas; JD, Marugg; N, Borges; H, Santos; MS, Costa. 2001. "Pathway for the synthesis of mannosylglycerate in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii. Biochemical and genetic characterization of key enzymes", Journal of Biological Chemistry 47, 276: 43580 - 43588.
33. LO, Martins; N, Empadinhas; JD, Marugg; C, Miguel; C, Ferreira; MS, Costa; H, Santos. 1999. "Biosynthesis of mannosylglycerate in the thermophilic bacterium Rhodothermus marinus. Biochemical and genetic characterization of a mannosylglycerate synthase", Journal of Biological Chemistry 50, 274: 35407 - 35414.



Processo com registo ou patente
Process with patent or official record
1. MS, Da C; Empadinhas, Nuno. Massive production of mycobacterial glucosyl-3-phosphoglycerate synthase and the use of this enzyme as a target for antimycobacterial substances,2009.
Tipo de processo ou técnica: Outro;Natureza do processo ou técnica: Terapêutica.
Patente: Patente de Invenção.n. WO2009028973,"Massive production of mycobacterial glucosyl-3-phosphoglycerate synthase and the use of this enzyme as a target for antimycobacterial substances".30 ago. 2007(Depósito);30 dez. 2008(Exame);15 mar. 2009(Concessão).
2. MS, Da C; Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; H, Santos. Identification of a bifunctional gene for mannosylglycerate synthesis and development of a high-scale-production heterologous system based on Sacharomyces cerevisiae,2005.
Tipo de processo ou técnica: Outro;Natureza do processo ou técnica: .
Patente: Patente de Invenção.n. EP1526180,"Identification of a bifunctional gene for mannosylglycerate synthesis and development of a high-scale-production heterologous system based on Sacharomyces cerevisiae".

Apresentação oral de trabalho
Oral work presentation
1. Empadinhas, Nuno. Civilização: o Paraíso das Micobactérias,2013 (Conferência ou palestra).
2. Empadinhas, Nuno. Reconstruction of mycobacterial pathways from missing enzyme links: playing hide and seek,2013 (Seminário).
3. Empadinhas, Nuno. Missing links in mycobacterial MGLP biosynthesis: the early players,2012 (Seminário).
4. Empadinhas, Nuno. Why is Mycobacterium tuberculosis a real and present threat?,2011 (Comunicação).
5. Empadinhas, Nuno. O Planeta das Micobactérias,2010 (Conferência ou palestra).
6. Empadinhas, Nuno. Biossíntese de polissacáridos raros em Mycobacterium: o Dia Mundial da Tuberculose,2010 (Conferência ou palestra).
7. Empadinhas, Nuno; Pereira, Pedro J. B; Albuquerque, Luciana; Costa, Joana; Sá-Moura, Bebiana; Macedo-Ribeiro, Sandra; da Costa, M. S. Functional and structural characterization of a paradoxical glucosyl-3-phosphoglycerate synthase from Rubrobacter xylanophilus involved in mannosylglycerate synthesis in vivo,2010 (Poster).
8. Empadinhas, Nuno. Identification of the mycobacterial glucosyl-3-phosphoglycerate synthase,2010 (Poster).
9. da Costa, M. S; Empadinhas, Nuno. A caminho de um novo antibiótico,2008 (Conferência ou palestra).
10. da Costa, M. S; Empadinhas, Nuno. Compatible solutes in thermophiles and hyperthermophiles: from the esoteric to the applied,2008 (Seminário).
11. Empadinhas, Nuno; MS, Da C. Biosynthesis and accumulation of compatible solutes in hyper/thermophiles,Halophiles 2007, International Congress Exploring Life at High Salinity,Colchester,2007 (Conferência ou palestra).
12. Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; J, Costa; MS, Da C. Rubrobacter xylanophilus mannosyl-3-phosphoglycerate synthase. evolution of mannosylglycerate and glucosylglycerate biosynthesis in prokaryotes,Extremophiles 2006, International Conference on Extremophiles,Brest,2006 (Conferência ou palestra).
13. Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; J, Costa; MS, Da C. The mannosyl-3-phosphoglycerate synthase from Rubrobacter xylanophilus,Final Meeting of the “HotSolutes” Project,Carcavelos,2006 (Comunicação).
14. Empadinhas, Nuno. Compatible solutes in the radiation-resistant bacterium Rubrobacter xylanophilus,2006 (Poster).
15. Empadinhas, Nuno; Albuquerque, Luciana; Costa, Joana; da Costa, M. S. A highly divergent MpgS accounts for the synthesis of mannosylglycerate in the gram-positive bacterium Rubrobacter xylanophilus,2005 (Poster).
16. Empadinhas, Nuno; J, Costa; MS, Da C. Nature’s shields to environmental stress: biosynthesis of compatible solutes in extremophiles,2nd Annual Meeting of the Centre for Neuroscience and Cell Biology,Luso,2004 (Comunicação).
17. Empadinhas, Nuno; J, Costa; MS, Da C. Biosynthesis of glucosylglycerate: a “coldsolute” from prokaryotes,3rd Meeting of the “HotSolutes” Project,Ferrara,2004 (Comunicação).
18. Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; J, Costa; MA, Santos; H, Santos; MS, Da C. Production of mannosylglycerate by Saccharomyces cerevisiae,6th Meeting of the “Hypersolutes” Project,Hamburg,2003 (Comunicação).
19. Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; J, Costa; MA, Santos; H, Santos; MS, Da C. Production of mannosylglycerate in mesophilc organisms,5th Meeting of the “Hypersolutes” Project,Alcochete,2003 (Comunicação).
20. Empadinhas, Nuno; Albuquerque, Luciana; A, Henne; da Costa, M. S; Santos, H.. The bacterium Thermus thermophilus, like hyperthermophilic archaea, uses a two-step pathway for the synthesis of mannosylglycerate,2003 (Poster).
21. Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; SH, Zinder; H, Santos; MS, Da C. Synthesis of mannosylglycerate at room temperature: properties of a mesophilic mannosylglycerate synthase,3rd Meeting of the “Hypersolutes” Project,Coimbra,2002 (Comunicação).
22. Empadinhas, Nuno; JD, Marugg; MS, Da C; H, Santos. Biosynthesis of mannosylglycerate in the hyperthermophile Pyrococcus horikoshii: characterization of key-enzymes,27th Meeting of the Federation of European Biochemical Societies,Lisboa,2001 (Comunicação).
23. Empadinhas, Nuno; L, Albuquerque; SH, Zinder; H, Santos; MS, Da C. Genes for the synthesis of mannosylglycerate at high and room temperature: characterization of key-enzymes,2nd Meeting of the “Hypersolutes” Project,Konstanz,2001 (Comunicação).
24. Empadinhas, Nuno. Pathway for the synthesis of mannosylglycerate in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii: Biochemical and genetic characterization of key-enzymes,2001 (Comunicação).
25. Empadinhas, Nuno; JD, Marugg; N, Borges; Santos, H.; da Costa, M. S. Pathway for the synthesis of mannosylglycerate in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii: Biochemical and genetic characterization of key-enzymes,2001 (Poster).
26. LO, Martins; Empadinhas, Nuno; da Costa, M. S; Santos, H.. Pathway for the synthesis of mannosylglycerate in Rhodothermus marinus: purification and characterization of mannosylglycerate synthase,1998 (Poster).





Dados Complementares (Additional data)


Orientações
Orientations


Tese de Doutoramento
Phd Thesis
Concluídas
Completed
1. Vitor Gonçalo Mendes, Biosynthesis of methylated polysaccharides in mycobacteria: Identification of genes and characterization of enzymes, 2011. Tese (Bioquímica/Microbiologia) - Universidade de Coimbra, Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Orientador).
2. Susana Elias Alarico, Relevance of mannosylglycerate and trehalose accumulation in the osmoadaptation of Thermus thermophilus, 2009. Tese (Biologia/Microbiologia) - Universidade de Coimbra, Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Co-orientador).
3. Chantal Vicência Fernandes, Glucosylglycerate occurrence, biosynthesis and protein stabilizing effect, 2009. Tese (Bioquímica/Microbiologia) - Universidade de Coimbra, Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Co-orientador).
Em curso
Ongoing
1. Ana Maranha Tiago, The role of MGLP in the adaptation of saprophytic and pathogenic mycobacteria to stress, 2011. Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Orientador).


Dissertação de Mestrado
Master degree dissertation
Concluídas
Completed
1. Mafalda Costa, Biosynthesis of rare methylglucose lipopolysaccharides in rapidly-growing mycobacteria: characerization of a key hydrolase, 2013. Dissertação (Bioquímica) - Universidade de Coimbra (Orientador).
2. Andreia Lamaroso, Functional analysis of maltokinases and bifunctional trehalose synthases/maltokinases in bacteria, 2012. Dissertação (Bioquímica) - Universidade de Coimbra (Orientador).
Em curso
Ongoing
1. Diogo Reis, Metabolismo de açúcares em Mycobacterium marinum durante adaptação a stress: o papel do gene mak, 2012. Dissertação (Biotecnologia e Recursos Marinhos) - Instituto Politécnico de Leiria (Orientador).
2. Ana Maranha Tiago, Transcriptional responses of the mycobacterial maltokinase to different growth conditions and during infection, 2009. Dissertação (Biologia Celular e Molecular) - Universidade de Coimbra (Orientador).


Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização
Specialization course conclusion monograph
Concluídas
Completed
1. Luigina Cirelli, Optimization of expression and purification of a novel mycobacterial octanoyltransferase, 2012. (Orientador).


Trabalho de conclusão de curso de Bacharelato/Licenciatura
Bachelor/Licenciate degree conclusion work
Concluídas
Completed
1. Emanuele Feleppa , Cloning and expression of novel genes of the biosynthetic pathway of a rare polysaccharide from Mycobacterium species, 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Licenciatura em Bioquímica) - Universita degli Studi - Siena (Orientador).
2. Tânia Batista, Microbiologia das especiarias: um estudo de isolamento e identificação por biologia molecular, 2008. (Orientador).


Iniciação científica
Scientific initiation
Concluídas
Completed
1. Vitor Manuel Carmona, Expressão, purificação e caracterização de uma nova fosfatase de Mycobacterium tuberculosis, 2009. Iniciação científica (Bioquímica) - Universidade de Coimbra (Orientador).


Orientação de outra natureza
Other orientation
Em curso
Ongoing
1. Vitor Gonçalo Mendes, Molecular and physiological characterization of two crucial enzymes from Mycobacterium tuberculosis, 2012. Universidade de Coimbra, Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Orientador).
2. Susana Elias Alarico, The early steps in methylglucose lipopolysaccharide biosynthesis in mycobacteria, 2012. Universidade de Coimbra, Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Orientador).


Participação no júri de Graus Académicos
Academic Degrees jury participation


Doutoramento
Phd
1. Empadinhas, Nuno; Pereira, Pedro; Carrondo, Maria Arménia; Matias, Pedro. Participação no júri de Susana Pires Gonçalves. Structure-function relationships in a glycosyltransferase, a phosphatase and an oxidoreductase, 2012. Tese (Bioquímica) - Universidade Nova de Lisboa.
2. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de John Edward Pearl. The Adaptive Response of Mycobacterium avium to Anoxia and Nitric Oxide, 2012. Tese (Ciências Biomédicas) - Universidade do Porto.
3. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Vitor Gonçalo Mendes. New Insights into the Biosynthesis of the Mycobacterial Methylglucose Lipopolysaccharide, 2011. Tese (Bioquímica) - Universidade de Coimbra.
4. Empadinhas, Nuno; Verissimo, António; Nobre, Maria Fernanda; da Costa, Milton S. Participação no júri de Susana Elias Alarico. Relevance of mannosylglycerate and trehalose accumulation in the osmoadaptation of Thermus thermophilus, 2009. Tese (Biologia/Microbiologia) - Universidade de Coimbra.
5. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Chantal Vicencia Fernandes. Glucosylglycerate occurrence, biosynthesis and protein stabilizing effect, 2009. Tese (Bioquímica/Microbiologia) - Universidade de Coimbra.


Mestrado
Master degree
1. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Mafalda Santos Costa. Biosynthesis of methylglucose lipopolysaccharides in rapidly-growing mycobacteria: characterization of a key hydrolase, 2013. 
2. Empadinhas, Nuno; Pedro Castanheira; Paula Verissimo; Euclides Pires. Participação no júri de Paulo Espirito Santo. Screening of Saccharomyces cerevisiae strains for recombinant protein expression, 2013. 
3. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Rui Marques Costa. Diversity of arsenite transporter genes present in microbial populations of the abandoned uranium mine in Urgeiriça, 2013. 
4. Empadinhas, Nuno; Verissimo, António; Costa, Joana; Morais, Paula. Participação no júri de Andreia Mendes Lamaroso. Análise functional de maltocinases e trealose sintases/maltocinases bifuncionais, 2012. 
5. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Sónia Costa André. Analysis of the antimicrobial content of amphibian skin secretions and structural and functional characterization of a novel member of the temporin family (temporin-SHe), 2012. 
6. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Luisa Silva Lopes. Estratificação vertical das comunidades microbianas da zona mesopelágica, no Atlântico Norte, determinada por pirosequenciação do 16S DNAr, 2011. 
7. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Tânia Miranda Sousa. Characterization of bacterial strains resistant to uranium for use in bioremediation, 2011. 
8. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Pedro Miguel Abreu. Formation and analysis of metal-induced phosphate rich extracellular nano-particulate in the Cr(VI) resistant strain Ochrobactrum tritici 5bv11 , 2011. 
9. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Ana Filipa d Avó. Evolução molecular dos genes pilD e lspE de Legionella pneumophila, 2010.  Dissertação (Bioquímica) - Universidade de Coimbra.
10. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Ana Maranha Tiago. A multifactorial approach to the biological role of the mycobacterial maltokinase, 2010. 
11. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Ana Carina Madureira. Role of Hsp60 and its peptide aa437-460 in experimental Sjogren’s syndrome, 2008.  Dissertação (Bioquímica) - Universidade de Coimbra.


Exame de qualificação de doutoramento
Phd qualification test
1. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Ana Maranha Tiago. The role of MGLP in the thermal adaptation of saprophytic and pathogenic mycobacteria, 2011.


Bacharelato/Licenciatura
Degree of licentiate
1. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Liliana Varela. Carcinoma gástrico: Alguns marcadores moleculares da sua etiopatogenia e história natural, 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelato/Licenciatura em Bioquímica) - Universidade de Coimbra.
2. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Maria Manuel Nunes. Role of T cells in the pathophysiology and immunotherapy of Alzheimer’s disease: optimization of immunization conditions and identification of A¿-derived CD4 T cell epitopes in H-2 haplotypes, 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelato/Licenciatura em Bioquímica) - Universidade de Coimbra.
3. Empadinhas, Nuno. Participação no júri de Selma Lopes. hCD3¿ and hCD3d subunit buried surface analyses in the aßTCR-CD3 complex, 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelato/Licenciatura em Bioquímica) - Universidade de Coimbra.


Participação em eventos
Event participation
Participação como Keynote Speaker
Participation as Keynote Speaker
1. Novas terapias baseadas na manipulação do Microbioma, 2013 (Seminário).
2. O Microbioma Humano, 2013 (Seminário).
Cidade do evento: Mamarrosa.
3. Biosynthesis of glucosylglycerate: A “coldsolute” from prokaryotes, 2004 (Encontro).
Nome do evento: 3rd Meeting of the “HotSolutes”; Cidade do evento: Ferrara.
4. Production of mannosylglycerate by Saccharomyces cerevisiae, 2003 (Encontro).
Nome do evento: 6th Meeting of the “Hypersolutes”; Cidade do evento: Hamburg.
5. Genes for the synthesis of mannosylglycerate at high and room temperature: characterization of key-enzymes, 2001 (Encontro).
Nome do evento: 2nd Meeting of the “Hypersolutes”; Cidade do evento: Konstanz.

Participação como Relator
Participation as Commentator
1. Reconstruction of mycobacterial pathways from missing enzyme links: playing hide and seek , 2013 (Seminário).
Cidade do evento: Coimbra.
2. Nature’s shields to environmental stress: Biosynthesis of compatible solutes in extremophiles, 2004 (Encontro).
Nome do evento: 2nd Annual Meeting of the Center for Neuroscience and Cell Biology; Cidade do evento: Luso.

Outro tipo de participação
Other kind of participation
1. The early steps in mycobacterial MGLP biosynthesis: the players, 2013 (Congresso).
Nome do evento: EuroCarb17; Cidade do evento: Telavive.
2. Comparative studies on mycobacterial maltokinases: saprophytes versus pathogens, 2011 (Congresso).
Nome do evento: 8th International Conference on the Pathogenesis of Mycobacterial Infections.
3. Functional and structural characterization of a paradoxical glucosyl-3-phosphoglycerate synthase from Rubrobacter xylanophilus involved in mannosylglycerate synthesis in vivo, 2010 (Congresso).
Nome do evento: Extremophiles 2010; Cidade do evento: Ponta Delgada.
4. Biosynthesis of the MGLP in Mycobacterium tuberculosis. Identification of genes and characterization of enzymes, 2008 (Encontro).
Nome do evento: 6th Annual Meeting of the Centre for Neuroscience and Cell Biology; Nome da Instituição: Centro de Neurociências e Biologia Celular; Cidade do evento: Coimbra / Fundação Bissaya Barreto.
4. A caminho dum novo antibiótico, 2008 (Encontro).
Nome do evento: Semana da Tuberculose; Cidade do evento: Lisboa.
6. Biosynthesis and accumulation of compatible solutes in hyper/thermophiles, 2007 (Congresso).
Nome do evento: International Congress Exploring Life at High Salinity; Cidade do evento: Colchester / Wivenhoe Park, University of Essex, Colchester, United Kingdom.
7. Compatible solutes in the radiation-resistant bacterium Rubrobacter xylanophilus, 2006 (Congresso).
Nome do evento: 2nd FEMS Congress of European Microbiologists; Cidade do evento: Madrid.
8. The mannosyl-3-phosphoglycerate synthase from Rubrobacter xylanophilus, 2006 (Encontro).
Nome do evento: Final Meeting of the “HotSolutes” Project; Cidade do evento: Carcavelos.
9. Rubrobacter xylanophilus mannosyl-3-phosphoglycerate synthase. evolution of mannosylglycerate and glucosylglycerate biosynthesis in prokaryotes, 2006 (Conferência).
Nome do evento: Extremophiles 2006 Conference; Cidade do evento: Brest / Brest, France.
10. A highly divergent MpgS accounts for the synthesis of mannosylglycerate in the gram-positive bacterium Rubrobacter xylanophilus, 2005 (Congresso).
Nome do evento: 30th FEBS Congress: The Protein World; Cidade do evento: Budapest.
11. The bacterium Thermus thermophilus, like hyperthermophilic archaea, uses a two-step pathway for the synthesis of mannosylglycerate, 2003 (Congresso).
Nome do evento: 1st FEMS Congress of European Microbiologists; Cidade do evento: Ljubljana.
12. Biosynthesis of mannosylglycerate in the hyperthermophile Pyrococcus horikoshii: characterization of key-enzymes, 2001 (Congresso).
Nome do evento: 27th Meeting of the Federation of European Biochemical Societies; Nome da Instituição: FEBS; Cidade do evento: Lisboa.
13. The genes involved in compatible solute biosynthesis in Rhodothermus marinus and Thermus thermophilus, 1999 (Encontro).
Nome do evento: 3rd Meeting on Extremophiles as Cell Factories; Cidade do evento: Graz.
14. Molecular cloning of the genes involved in compatible solute biosynthesis in Rhodothermus marinus and Thermus thermophilus, 1998 (Congresso).
Nome do evento: Thermophiles 98; Cidade do evento: Brest.
15. Pathway for the synthesis of mannosylglycerate in Rhodothermus marinus: purification and characterization of mannosylglycerate synthase, 1998 (Conferência).
Nome do evento: Second Meeting on Extremophiles as Cell Factories; Cidade do evento: Dublin.








Indicadores de produção (Production indicators)

Total
Produção científica
Scientific production
35

Livros e capítulos
Books and book chapters
2
Capítulos de livros publicados
Published book chapters
2
Artigos científicos em revistas
Papers in periodics
33
Com arbitragem científica
With scientific refereeing
33

Total
Produção técnica
Technical production
28

Processos ou técnicas
Processes or techiniques
2
Processos ou técnicas com registo ou patente
Processes or techiniques with patent or official record
2
Outros tipos de produção técnica
Other technical production
26

Total
Dados complementares
(Additional data)
58

Orientações
Orientations
16
Participação no Júri de Graus Académicos
Academic Degrees jury participation
20
Participação em Eventos
Event participation
22


Visualizações do curriculum [ 2019 ]
 
Página gerada pela Plataforma de Curricula DeGóis promovida pela FCT e pelo Gávea/DSI/UM em 11-02-2016 às 04:45:57
Plataforma de Curricula DeGóis: http://www.degois.pt | Icons by Axialis Team
Co-Autores Relacionados no DeGóis (5)
 Co-authors listed in Degóis
Colaboração em projetos no DeGóis (1)
 Project collaboration in Degóis