Curriculum Vitae

Paulo de Castro Aguiar

Data da última atualização »Last update : 02/01/2015


Paulo de Castro Aguiar. É da Universidade do Porto. Publicou 27 artigos em revistas especializadas e 13 trabalhos em actas de eventos. Possui 3 softwares e outros 2 itens de produção técnica. Recebeu 4 prémios e/ou homenagens. Actua na área de Ciências da Saúde Nas suas actividades profissionais interagiu com 101 colaboradores em co-autorias de trabalhos científicos.


Endereço de acesso a este CV:

http://www.degois.pt/visualizador/curriculum.jsp?key=7838134675556679


Dados pessoais (Personal data)
Nome completo
Full name
Paulo de Castro Aguiar
Nome em citações bibliográficas
Quoting name
Aguiar, Paulo
Domínio científico de atuação
Scientific domain
Ciências Médicas-Ciências da Saúde.
Ciências Exactas-Matemática.
Ciências Exactas-Física.
Ciências Exactas-Ciências da Computação e da Informação.
Engenharia e Tecnologia-Engenharia Médica.
Endereço profissional
Professional address
Universidade do Porto
Faculdade de Ciências
Centro de Matemática da Universidade do Porto (CMUP)
Rua do Campo Alegre, 687
Porto
4169--007 Porto
Portugal
Telefone: (+351)220402266
Fax: (+351)220402209
Correio electrónico: pauloaguiar@fc.up.pt
Homepage: http://www.fc.up.pt/pessoas/pauloaguiar/
Sexo
Gender
Masculino»Male




Graus Académicos (Academic Degrees)
2001-2006 Doutoramento
Phd
Computational/Theoretical Neuroscience (4 anos » years) .
University of Edinburgh, Reino Unido.
Com o tipo » With the type: Equivalência » Equivalence.

1995-2000 Licenciatura
Licentiate degree
Engª Física Tecnológica (5 anos » years) .
Universidade Técnica de Lisboa, Portugal.





Formação complementar ( studies)
2003-2003 Curso de curta duração
Short course
Advanced Course in Computational Neuroscience (1 month course).
Federation of European Neurosciences / International Brain Research Organi, França.

2000-2001 Especialização/ Pós-Graduação
Specialization/ Postgraduation
Biophysics and Biomedical Engineering.
Universidade de Lisboa, Portugal.





Vínculos profissionais (Professional Positions)
Instituto de Biologia Molecular e Celular
Jun/2013-Actual Investigador Auxiliar

Universidade do Porto
Mai/2008-Mai/2013 Investigador Auxiliar

Instituto de Biologia Molecular e Celular
Dez/2005-Abr/2008 Investigador Auxiliar

University of Edinburgh
Set/2002-Jul/2004 Assistente

Universidade Técnica de Lisboa
Set/2000-Jul/2001 Estagiário Investigador

Universidade Técnica de Lisboa
Set/1998-Jul/2000 Assistente





Atividades de Investigação e Desenvolvimento (Research and Development activities)
Instituto de Biologia Molecular e Celular
Jun/2013-Actual
Linhas de investigação»Research fields:


Mathematical Models in Biology


Computational Biology


Biophysics




Universidade do Porto
Mai/2008-Mai/2013
Linhas de investigação»Research fields:


Computational Neuroscience; Mathematical models in biology






Atividades de Ensino (Teaching activities)


Universidade do Porto
Mai/2008-Mai/2013
Disciplinas lecionadas»Taught units:

  • Mathematical Models in Biology [MSc](Regente)
  • Introduction to Computational Neuroscience [PhD](Regente)




University of Edinburgh
Set/2002-Jul/2004
Disciplinas lecionadas»Taught units:

  • Neural Computation(Monitor)
  • Learning from Data(Monitor)
  • Maths refresher(Monitor)




Universidade Técnica de Lisboa
Set/1998-Jul/2000
Disciplinas lecionadas»Taught units:

  • Physics II [BSc](Monitor)
  • Computational Physics [BSc](Monitor)






Atividades de Conselhos, Comissões e Consultorias (Councils, Comissions and Consultancy activities)


Universidade Técnica de Lisboa
Set/2000-Set/2001
Membro de Conselho Consultivo






Atividades de Extensão Universitária (Other services rendered through University)


Universidade Técnica de Lisboa
Set/1999-Set/2000
Atividade de extensão realizada»Extension activity rendered:

   - 






Linhas de Investigação (Research fields)
1. Computational Neuroscience; Mathematical models in biology
2. Mathematical Models in Biology
3. Computational Biology
4. Biophysics




Projetos de Investigação (Research projects)
Participação como Investigador responsável
Participation as responsible Researcher
2007-2010
Theoretical models of nociceptive information processing and transmission in the spinal cord´s dorsal horn
Referência do projeto»Project reference: PTDC /SAU-NEU/68929/2006.


Participação como Investigador
Participation as Researcher
2011-
Memristor Based Adaptive Neural Networks (MemBrAiNN)
Referência do projeto»Project reference: PTDC/CTM-NAN/122868/2010.
Parceiro(s)»Partners: Universidade do Porto.

1999-2001
Study of Type Ia supernovae and their cosmological implications
Referência do projeto»Project reference: PESO/ESO/P/PRO/1257/98.


Outro Tipo de Participação
Other kind of participation
2012-
Y1 receptor based therapy for local bone repair: Antagonist behavior and delivery in challenged bone microenvironment
Referência do projeto»Project reference: PTDC/BIM-MED/1047/2012.






Línguas (Languages)
Compreende
Understandig
Português (Bem), Inglês (Bem), Francês (Razoavelmente), Japonês (Pouco).
Fala
Speaking
Português (Bem), Inglês (Bem), Francês (Razoavelmente), Japonês (Pouco).

Reading
Português (Bem), Inglês (Bem), Francês (Razoavelmente), Japonês (Pouco).
Escreve
Writing
Português (Bem), Inglês (Bem), Francês (Razoavelmente), Japonês (Pouco).




Prémios e títulos (Awards Prizes, and Honours)
2008 FENS 2008 Travel Award, Portuguese Society for Neurosciences.
2006 Postdoctoral fellowship, FCT, MCTES Portugal.
2005 Postdoctoral fellowship, IBMC, Portugal.
2000 PhD Scholarship, FCT, MCTES Portugal.




Membro de Associações Profissionais/Científicas (Professional/Scientific Association membership)
Actual Portuguese Society for Neurosciences, Membro.




Produção científica, técnica e artística/cultural (Scientific, technical and artistical/cultural production)
Artigos em revistas com arbitragem científica
Papers in periodics with scientific refereeing
1. Sousa, M.; Aguiar, P.. 2014. "Building, simulating and visualizing large spiking neural networks with NeuralSyns", Neurocomputing 123, .: 372 - 380.
2. Barisic, M.; Aguiar, P.; Geley, S.; Maiato, H.. 2014. "Kinetochore motors drive congression of peripheral polar chromosomes by overcoming random arm-ejection forces", Nature Cell Biology 16, 12: 1249 - 1256.
3. Conde-Sousa, E.; Aguiar, P.. 2013. "A working memory model for serial order that stores information in the intrinsic excitability properties of neurons", Journal of Computational Neuroscience 35, 2: 187 - 199.
4. Szucs, P.; Luz, L.L.; Pinho, R.; Aguiar, P.; Antal, Z.; Tiong, S.Y.X.; Todd, A.J.; Safronov, B.V.. 2013. "Axon diversity of lamina I local-circuit neurons in the lumbar spinal cord", Journal of Comparative Neurology 521, 12: 2719 - 27.
5. Aguiar, P.; Horta, R.; Monteiro, D.; Silva, A.; Amarante, J.M.. 2013. "Evaluation of a facial transplant candidate with a facegram: A baseline analysis", Plastic and Reconstructive Surgery 132, 3: x - x.
6. Silva, P.; Garganta, J.; Araújo, D.; Davids, K.; Aguiar, P.. 2013. "Shared knowledge or shared affordances? insights from an ecological dynamics approach to team coordination in sports", Sports Medicine 43, 9: 765 - 772.
7. Carneiro, J.; Duarte-Pereira, S.; Azevedo, L.; Castro, L.F.C.; Aguiar, P.; Moreira, I.S.; Amorim, A.; Silva, R.M.. 2013. "The Evolutionary Portrait of Metazoan NAD Salvage", PLoS ONE 8, 5: x - x.
8. Aguiar, P.; Sousa, M.; Szucs, P.. 2013. "Versatile morphometric analysis and visualization of the three-dimensional structure of neurons", Neuroinformatics 11, 4: 393 - 403.
9. Pais-Vieira, M.; Aguiar, P.; Lima, D.; Galhardo, V.. 2012. "Inflammatory pain disrupts the orbitofrontal neuronal activity and risk-assessment performance in a rodent decision-making task", Pain 153, 8: 1625 - 16.
10. Castro, L. F. C; Aguiar, P.. 2012. "Phase precession through acceleration of local theta rhythm: A biophysical model for the interaction between place cells and local inhibitory neurons", Journal of Computational Neuroscience 33, 1: 141 - 150.
11. Pinto, S.; Krishna, R.; Dias, C.; Pimentel, G.; Oliveira, G.N.P.; Teixeira, J.M.; Aguiar, P.; Titus, E.; Gracio, J.; Ventura, J.; Araujo, J.P.. 2012. "Resistive switching and activity-dependent modifications in Ni-doped graphene oxide thin films", Applied Physics Letters 101, 6: x - x.
12. Aguiar, P.; Sousa, M.; Lima, D.. 2010. "NMDA channels together with L-type calcium currents and calcium-activated nonspecific cationic currents are sufficient to generate windup in WDR neurons", Journal of Neurophysiology 104, 2: 1155 - 11.
13. Vourvouhaki, E.; Carvalho, C.; Aguiar, P.. 2007. "Model for Osteosarcoma-9 as a potent factor in cell survival and resistance to apoptosis", Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics 76, 1: x - x.
14. Aguiar, P.; Mendonça, L.; Galhardo, V.. 2007. "OpenControl: A free opensource software for video tracking and automated control of behavioral mazes", Journal of Neuroscience Methods 166, 1: 66 - 72.

Trabalhos completos/resumidos em eventos com arbitragem científica
Papers in conference proceedings with scientific refereeing
1. Sousa, Mafalda; Szucs, Peter; Aguiar, Paulo. 2013. "Reduction in inhibitory control is sufficient to generate hyperalgesia in a spiking model of nociceptive integration in the superficial dorsal horn", Trabalho apresentado em CNS, In BMC Neuroscience 2013, 14(Suppl 1), Paris.
2. Castro, Luísa; Aguiar, Paulo. 2013. "A model for grid cells where spatially correlated place cells compete for the grid map nodes", Trabalho apresentado em CNS, In BMC Neuroscience 2013, 14(Suppl 1), Paris.
3. Conde-Sousa, E.; Aguiar, Paulo. 2013. "Conversion from spatial patterns of activity to sequences of neuronal activations using gate interneurons", Trabalho apresentado em CNS, In BMC Neuroscience 2013; 14(Suppl 1), Paris.
4. Castro, Luísa; Aguiar, Paulo. 2011. "Phase precession through acceleration of local theta rhythm: a biophysical model for the interaction between complex spike cells and theta cells", Trabalho apresentado em CNS, In BMC Neuroscience 2011, 12(Suppl 1), Stockholm.
5. Aguiar, Paulo; Szucs, Peter. 2011. "Detailed visualization and morphometric analysis of reconstructed neurons using Blender and Python", Trabalho apresentado em CNS, In BMC Neuroscience 2011, 12(Suppl 1), Stockholm.
6. Aguiar, Paulo; Sousa, Mafalda; Lima, Deolinda. 2010. "Analysis of the mechanisms underlying windup using a detailed biophysical model of WDR neurons", Trabalho apresentado em CNS, In BMC Neuroscience 2010, 11(Suppl 1), San Antonio.
7. Aguiar, Paulo; Rodrigues, Miguel. 2009. "Neuronal connectivity inference from spike trains using an empirical probabilistic causality measure", Trabalho apresentado em CNS, In BMC Neuroscience 2009, 10(Suppl 1), Berlin.
8. Sousa, Mafalda; Aguiar, Paulo. 2009. "NetBuilder: a tool for constructing large and complex neural networks", Trabalho apresentado em Portuguese Society for Neurosciences (SPN) Meeting, In Frontiers, Braga.
9. Aguiar, Paulo. 2009. "NeuralSyns: A Novel Tool For Simulating Large Neuronal Networks With Complex Architectures", Trabalho apresentado em Portuguese Society for Neurosciences (SPN) Meeting, In Frontiers, Braga.
10. Aguiar, Paulo; Willshaw, David. 2007. "Simulating large and heterogeneous networks of spiking neurons with SpiNet", Trabalho apresentado em CNS, In BMC Neuroscience 2007, 8(Suppl 2), Edinburgh.
11. Mourao, Ana; Aguiar, Paulo; Cruz, Maria; Lopes, Ana. 2001. "Nearby Type Ia supernova searches: the Portuguese experience and plans for the future", Trabalho apresentado em 10th Portuguese Meeting in Astronomy and Astrophysics, In Astronomy and Astrophysics: Recent developments, Lisbon.
12. Cruz, Maria; Aguiar, Paulo; Lopes, Ana; Mourao, Ana. 2000. "Type Ia Supernova", Trabalho apresentado em PhD Euroconference - Simililarities and universality in relativistic flows, In Logos Verlag Berlin, Mykonos.
13. Aguiar, Paulo. 2000. "EEGSolver - Brain Activity and Genetic Algorithms", Trabalho apresentado em ACM - Symposium on Applied Computing, In SAC 2000 Proceedings, Como.

Artigos em revistas sem arbitragem científica
Papers in periodics without scientific refereeing
1. Sousa, M.; Szucs, P.; Lima, D.; Aguiar, P.. 2014. "The pronociceptive dorsal reticular nucleus contains mostly tonic neurons and shows a high prevalence of spontaneous activity in block preparation", Journal of Neurophysiology 111, 7: 1507 - 1518.
2. Castro, Luísa; Aguiar, Paulo. 2014. "A feedforward model for the formation of a grid field where spatial information is provided solely from place cells", Biological Cybernetics 108, 2: 133 - 143.
3. Afonso, O.; Matos, I.; Pereira, A.J.; Aguiar, P.; Lampson, M.A.; Maiato, H.. 2014. "Feedback control of chromosome separation by a midzone Aurora B gradient", Science 345, 6194: 332 - 336.
4. Horta, R.; Aguiar, P.; Silva, P.; Monteiro, D.; Amarante, J.M.. 2014. "Facial disfigurement: Restoration of facial dynamics in a patient with concomitant facial paralysis and blindness", Journal of Reconstructive Microsurgery 30, 3: 207 - 210.
5. Neto, E.; Alves, C.J.; Sousa, D.M.; Alencastre, I.S.; Lourenço, A.H.; Leitão, L.; Ryu, H.R.; Jeon, N.L.; Fernandes, R.; Aguiar, P.; Almeida, R.D.; Lamghari, M.. 2014. "Sensory neurons and osteoblasts: Close partners in a microfluidic platform", Integrative Biology (United Kingdom) 6, 6: 586 - 595.
6. Silva, P.; Travassos, B.; Vilar, L.; Aguiar, P.; Davids, K.; Araújo, D.; Garganta, J.. 2014. "Numerical relations and skill level constrain co-adaptive behaviors of agents in sports teams", PLoS ONE 9, 9: 1 - 1.
7. Silva, P.; Duarte, R.; Sampaio, J.; Aguiar, P.; Davids, K.; Araújo, D.; Garganta, J.. 2014. "Field dimension and skill level constrain team tactical behaviours in small-sided and conditioned games in football", Journal of Sports Sciences 32, 20: 1888 - 18.
8. Silva, P.; Aguiar, P.; Duarte, R.; Davids, K.; Araújo, D.; Garganta, J.. 2014. "Effects of pitch size and skill level on tactical behaviours of association football players during small-sided and conditioned games", International Journal of Sports Science and Coaching 9, 5: 993 - 10.
9. Horta, R.; Aguiar, P.; Monteiro, D.; Silva, A.; Amarante, J.M.. 2014. "A facegram for spatial-temporal analysis of facial excursion: Applicability in the microsurgical reanimation of long-standing paralysis and pretransplantation", Journal of Cranio-Maxillofacial Surgery 42, 7: 1250 - 12.
10. Moutinho-Pereira, S.; Stuurman, N.; Afonso, O.; Hornsveld, M.; Aguiar, P.; Goshima, G.; Vale, R. D; Maiato, H.. 2013. "Genes involved in centrosome-independent mitotic spindle assembly in Drosophila S2 cells", Proceedings of the National Academy of Sciences 110, 49: 19808 - 19813.
11. Horta, Ricardo; Aguiar, Paulo; Silva, Pedro; Monteiro, Diana; Amarante, José. 2013. "Facial Disfigurement: Restoration of Facial Dynamics in a Patient with Concomitant Facial Paralysis and Blindness", Journal of Reconstructive Microsurgery 30, 03: 207 - 210.
12. Guimarães, J.; Moura, E.; Silva, E.; Aguiar, P.; Garrett, C.; Vieira-Coelho, M.A.. 2013. "Locus coeruleus is involved in weight loss in a rat model of Parkinson's disease: An effect reversed by deep brain stimulation", Brain Stimulation 6, 6: 845 - 855.
13. Aguiar, P.; Willshaw, D.. 2004. "Hippocampal mossy fibre boutons as dynamical synapses", Neurocomputing 58-60, .: 699 - 703.

Textos em jornais ou revistas
Texts in newspapers or magazines
1. Conde-Sousa, E.; Aguiar, Paulo. 01 jan. 2012. "Detailed mathematical models in neurobiology - Storing information in membrane conductances dynamics" CIM Buletin, 19 - 25.

Outra produção científica
Other scientific production
1. Sousa, Mafalda; Szucs, Peter; Lima, Deolinda; Aguiar, Paulo. 2013. "The pronociceptive dorsal reticular nucleus contains mostly tonic neurons and frequently shows spontaneous activity without ascending input from the spinal cord [!under review! - 2nd round - in JNeurophysiol]". *: *.
2. Moutinho-Pereira, S.; Stuurman, N.; Aguiar, Paulo; Hornsveld, M.; Goshima, G.; Vale, R.; Maiato, Helder. 2013. "The Molecular Basis of Mitotic Spindle Adaptation to the Presence/Absence of Centrosomes [!under review! in PNAS]". *: *.
3. Guerra, Luís; Aguiar, Paulo; Dias, Catarina; Ventura, J.. 2013. "Memristor-based Willshaw network: capacity and robustness to noise in the presence of defects [!under review! in Applied Physics Letters]". *: *.
4. Conde-Sousa, E.; Aguiar, Paulo. 2013. "Synergy between different membrane currents as a mechanism for one-shot short-term memory in a spiking network model [!under review! - 2nd round - in IntJNeuralSystems]". *: *.
5. Neto, Estrela; Alves, C.; Sousa, D.; Alencastre, Ines; Lourenço, A.; Leitão, L.; Ryu, H.; Jeon, N.; Aguiar, Paulo; Almeida, R; Lamghari, Meriem. 2013. "Bone cells and sensory neurons: close partners in a microfluidic platform [!under review! in Tissue Engineering]". *: *.
6. Castro, Luísa; Aguiar, Paulo. 2013. "A feed-forward model for grid fields’ formation where spatial information is provided solely from place cells [!under review! - 2nd round - in Biological Cybernetics]". *: *.



Software sem registo ou patente
Software without patent or official record
1. Aguiar, Paulo. NeuralSyns - Simulation environment for large spiking neuronal networks,2013.
2. Aguiar, Paulo. Py3DN - Morphometric analysis and visualization of the 3D structure of neurons,2012.
3. Aguiar, Paulo. OpenControl - Automated control in behavioral experiments in Neuroscience,2007.

Apresentação oral de trabalho
Oral work presentation
1. Neto, Estrela; Aguiar, Paulo; Almeida, R; Lamghari, Meriem. Quantitative method for assessing axonal outgrowth on microfluidic devices,Bioimaging 2012,2012 (Conferência ou palestra).

Organização de evento
Event organization
1. Aguiar, Paulo. Mathematical Neuroscience Workshop,2012 (Oficina).





Dados Complementares (Additional data)


Orientações
Orientations


Tese de Doutoramento
Phd Thesis
Concluídas
Completed
1. Maria Luísa Castro Guedes, Models for spatial information encoding in neuronal populations, 2013. Tese (Doctoral Program in Applied Mathematics) - Universidade do Porto, Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Orientador).
Em curso
Ongoing
1. Maria Mafalda Sousa, Construction and analysis of detailed biophysical models for DRt and Lamina I neurons, 2014. Tese (Doctoral Program in Neuroscience) - Universidade do Porto, Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Orientador).
2. Eduardo Conde-Sousa, Spiking neural networks and applications in working memory, 2014. Tese (Doctoral Program in Applied Mathematics) - Universidade do Porto, Bolseiro(a) de Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Orientador).
3. Ricardo Horta, Facegrams for spacio-temporal analysis of facial anatomical landmarks trajectories, 2014. Tese (Doctoral Program in Medicine) - Universidade do Porto (Co-orientador).


Dissertação de Mestrado
Master degree dissertation
Concluídas
Completed
1. Mariana Cunha, Quantification of flux and time decay of microtubules in the mitotic spindle [Final grade 19/20], 2012. Dissertação (Masters in Mathematical Engineering) - Universidade do Porto (Orientador).


Participação no júri de Graus Académicos
Academic Degrees jury participation


Doutoramento
Phd
1. Aguiar, Paulo. Titulo do Trabalho, 2010.







Indicadores de produção (Production indicators)

Total
Produção científica
Scientific production
47

Artigos científicos em revistas
Papers in periodics
27
Com arbitragem científica
With scientific refereeing
14
Sem arbitragem científica
Without scientific refereeing
13
Trabalhos em eventos
Papers in conference proceedings
13
Com arbitragem científica
With scientific refereeing
13
Textos em jornais ou revistas
Texts in journals or magazines
1
Revistas
Magazines
1
Outros tipos de produção científica
Other scientific production
6

Total
Produção técnica
Technical production
5

Software 3
Software sem registo ou patente
Software without patent or official record
3
Outros tipos de produção técnica
Other technical production
2

Total
Dados complementares
(Additional data)
7

Orientações
Orientations
6
Participação no Júri de Graus Académicos
Academic Degrees jury participation
1


Visualizações do curriculum [ 946 ]
 
Página gerada pela Plataforma de Curricula DeGóis promovida pela FCT e pelo Gávea/DSI/UM em 03-03-2017 às 22:10:46
Plataforma de Curricula DeGóis: http://www.degois.pt | Icons by Axialis Team
Co-Autores Relacionados no DeGóis (5)
 Co-authors listed in Degóis