Curriculum Vitae

Tiago Vasconcelos Duarte Moreira Pais

Data da última atualização »Last update : 06/11/2012


RESEARCH:The main field of work of the researcher has been “Protein stabilization by compatible solutes". Compatible solutes are small organic compounds found to accumulate in many organisms as a response to environmental stresses including osmotic and heat stresses. The researcher has been particularly focused on the study of compatible solutes accumulated by (hyper)thermophilic organisms since these solutes usually show greater protection against protein thermal unfolding – despite the fact that the magnitude of thermal protection is very dependent on the solute/protein pair. The main goal has been the characterization of solute/protein interactions in order to better understand the molecular mechanism of protein stabilization by compatible solutes. In particular, the researcher has been addressing the effect of stabilizers on the internal dynamics of proteins and testing for possible specific interactions of the solute with the protein surface. To study backbone and side chain subnanosecond motions it were measured, respectively, 15N and 13C spin relaxation times. The results showed that backbone motions, but not side chain motions, were progressively restricted by increasing amounts of added stabilizer. Conversely, the presence of a destabilizer, such as urea, resulted in an increase of the backbone subnanosecond motions. In fact, there was a strong correlation between backbone mobility and changes in the protein melting temperature induced by the presence of different solutes. Slower time scale motions (>ms) were studied using native state hydrogen exchange NMR experiments in the absence and presence of a stabilizing solute. By measuring hydrogen exchange rates as a function of denaturant concentration (urea) the researcher was able to separate the effect of the solute on the local motions from the effect on the global opening motions of the protein. Global opening motions appeared to be restricted independent of location by stabilizers, suggesting that the solute is simply canceling the effect of the denaturant. On the other hand, local motions were specifically constrained in ß-sheet structures and not in a-helices. Interestingly, I found no evidence of specific weak binding of the solute to the protein surface as monitored by chemical shift perturbation and 1H saturation transfer experiments. All experimental work was performed by the researcher, including protein production and purification, necessary modifications to the NMR acquisition schemes (pulse sequences) as well as all the statistical treatment of the experimental data. The work resulted in preparation of four manuscripts, two already published in international peer-reviewed journals (FEBS J. and J. Mol. Biol.), one just submitted to Biophysical J. and one other soon to be submitted. TECHNICAL EXPERTISE: Nuclear Magnetic Resonance, Computer Skills, liquid chromatography, SDS-PAGE electrophoresis, CD, DSC, TEM; Molecular biology: Gene cloning/expression, PCR,plasmid, etc


Endereço de acesso a este CV:

http://www.degois.pt/visualizador/curriculum.jsp?key=7271582262839611


Dados pessoais (Personal data)
Nome completo
Full name
Tiago Vasconcelos Duarte Moreira Pais
Nome em citações bibliográficas
Quoting name
Pais, Tiago M
Domínio científico de atuação
Scientific domain
Ciências Naturais-Ciências Biológicas.
Endereço profissional
Professional address
Universidade Nova de Lisboa
Instituto de Tecnologia Química e Biológica
Av. da República, Estação Agronómica Nacional
Oeiras
2781-901 Oeiras
Portugal
Telefone: (+351)214469524
Fax: (+351)21441127
Correio electrónico: tpais@itqb.unl.pt
Sexo
Gender
Masculino»Male




Graus Académicos (Academic Degrees)
2008-2011 Doutoramento
Phd
Biologia (4 anos » years) .
Universidade Nova de Lisboa, Portugal.

1995-2000 Licenciatura
Licentiate degree
Microbiologia (4 anos » years) .
Universidade Católica Portuguesa, Portugal.





Formação complementar ( studies)
2006-2006 Curso de curta duração
Short course
Curso Anvanzado de Ressonancia Magnética nuclear .
Real Sociedad Española de Química , Espanha.

2005-2005 Curso de curta duração
Short course
UIC Flowcytometry and Microscopy course.
Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal.

2005-2005 Curso de curta duração
Short course
First FECS School on Protein Chemistry .
Società Chimica Italiana Divsione di Chimica dei Sistemi Bioloici , Itália.

2004-2004 Curso de curta duração
Short course
Understanding Protein Stability .
Karolina Institute , Suécia.





Vínculos profissionais (Professional Positions)
Universidade Nova de Lisboa
Out/2000-Actual Outra Situação

Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias
Fev/2012-Mar/2012 Outra Situação





Atividades de Investigação e Desenvolvimento (Research and Development activities)
Universidade Nova de Lisboa
Mar/2012-Actual
Linhas de investigação»Research fields:


THE ROLE OF HUB PROTEINS IN THE MACROMOLECULAR ASSEMBLY OF A BACTERIAL ORGANELLAR STRUCTURE






Atividades de Ensino (Teaching activities)


Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias
Fev/2012-Mar/2012
Disciplinas lecionadas»Taught units:

  • Química Analítica(Docente)






Linhas de Investigação (Research fields)
1. THE ROLE OF HUB PROTEINS IN THE MACROMOLECULAR ASSEMBLY OF A BACTERIAL ORGANELLAR STRUCTURE




Projetos de Investigação (Research projects)
Participação como Doutorando
Participation as Phd student
2008-2011
O papel dos movimentos das proteinas no mecanismo de termo-estabilização por solutos compativeis the origens hipertermofilicas-The role of protein dynamics in the mechanism of thermal stabilization by compatible solutes from (hyper)thermophilic origins
Referência do projeto»Project reference: -.
Financiador(es)»Funding: Fundação para a Ciência e a Tecnologia.


Participação como Desenvolvimento técnico
Participation as Technical developer
2005-2005
The effect of compatible solutes on amyloid fibril formation and disassembly using TEM and CD spectroscopy
Referência do projeto»Project reference: EMBL - Heidelber.
Parceiro(s)»Partners: European Molecular Biology Laboratory.






Línguas (Languages)
Compreende
Understandig
Inglês (Bem), Francês (Razoavelmente), Espanhol (Razoavelmente).
Fala
Speaking
Inglês (Bem), Francês (Razoavelmente), Espanhol (Razoavelmente).

Reading
Inglês (Bem), Francês (Razoavelmente), Espanhol (Razoavelmente).
Escreve
Writing
Inglês (Bem), Francês (Pouco), Espanhol (Pouco).




Membro de Associações Profissionais/Científicas (Professional/Scientific Association membership)
Mai/2011 - Actual International Biophysical Society, Membro.




Produção científica, técnica e artística/cultural (Scientific, technical and artistical/cultural production)
Capítulos de livros publicados
Published book chapters
1. Santos, Helena; Lamosa, Pedro; Borges, Nuno; Gonçalves, Luis G; Pais, Tiago V. D. M; Rodrigues, Marta V. 2011. Organic compatible solutes of prokaryotes that thrive in hot enviroments: the importance of ionic compounds for thermostabilization .  In Extremophiles Handbook , ed. K. Horikoshi, G.Antranikian, A.T.Bull, F.T.Robb, K.O.Stetter, 497 - 520. . Tokyo: Springer.
2. Santos, Helena; Lamosa, Pedro; Faria, Tiago Q; Pais, Tiago V. D. M; Paz, Manuela L. l; Serrano, Luis. 2008. Compatible solutes of (hyper)thermophilçes and their role in protein stabilization" .  In Thermophiles, Biology and technology at high temperatures , ed. F.T. Robb, G.Antranikian, D. Grogan, A. Driessen , 9 - 24. . -: CRC Press.

Artigos em revistas com arbitragem científica
Papers in periodics with scientific refereeing
1. Pais, Tiago M; Lamosa, Pedro; Garcia-Moreno, Bertrand; Turner, David L; Santos, Helena. 2009. "Relationship between Protein Stabilization and Protein Rigidification Induced by Mannosylglycerate", Journal of Molecular Biology 394, 2: 237 - 250.
2. Pais, Tiago M; Lamosa, Pedro; Santos, Wagner; LeGall, Jean; Turner, David L; Santos, Helena. 2005. "Structural determinants of protein satbilization by solutes: The importance of the hairpin loop in rubredoxins", FEBS Journal  272, 4: 999 - 1011.

Tradução
Translation
1. Pais, Tiago V. D. M. 2011. "Curso de Ensino Superior". Portugal: -. (Outra)



Apresentação oral de trabalho
Oral work presentation
1. Pais, Tiago V. D. M; Lamosa, Pedro; Turner, David L; Santos, Helena. Is there a link between protein stabilization and protein rigidification induced by compatible solutes of Extremophiles?,8th International Congress of Extremophiles ,Ponta Delgada ,2010 (Conferência ou palestra).

Organização de evento
Event organization
1. Pais, Tiago V. D. M. 8th International Conference on Extremophiles,2011 (Congresso / Organização).





Dados Complementares (Additional data)


Participação em eventos
Event participation
Outro tipo de participação
Other kind of participation
1. The importance of backbone dynamics in protein stabilization by compatible solutes, 2011 (Congresso).
Nome do evento: Dynamics within and between proteins; Nome da Instituição: Biophysical society; Cidade do evento: Colchester / Essex.
2. EUROMAR 2010 - A World Wide Magnetic Ressonance Conference , 2010 (Conferência).
Nome do evento: EUROMAR 2010 - A World Wide Magnetic Ressonance Conference ; Cidade do evento: Florença.
3. BIOCAT - International Congress on Biocatalysis, 2008 (Congresso).
Nome do evento: BIOCAT 2008 - International Congress on Biocatalysis; Cidade do evento: Hamburgo .
4. EUROMAR, 2007 (Conferência).
Nome do evento: EUROMAR - Magnetic Ressonance Conference ; Nome da Instituição: GERM; Cidade do evento: Terragona .
5. Protein stabilizarion by compatible solutes from extremophiles, 2006 (Congresso).
Nome do evento: International Conference on Extremophiles ; Nome da Instituição: Internation Society of Extermophiles; Cidade do evento: Brest / França.
6. Sintra, 2003 (Conferência).
Nome do evento: 2nd Portuguese-Brazilian NMR Conference; Cidade do evento: Lisboa / Sintra.
7. The effect of compatible solutes on the stability of a series of rubredoxin mutants, 2002 (Congresso).
Nome do evento: The 4th International Congress on Extremophiles ; Nome da Instituição: ISE; Cidade do evento: Napoles / Itália.








Indicadores de produção (Production indicators)

Total
Produção científica
Scientific production
5

Livros e capítulos
Books and book chapters
2
Capítulos de livros publicados
Published book chapters
2
Artigos científicos em revistas
Papers in periodics
2
Com arbitragem científica
With scientific refereeing
2
Outros tipos de produção científica
Other scientific production
1

Total
Produção técnica
Technical production
2

Outros tipos de produção técnica
Other technical production
2


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