Pedro Henrique Couto Oliveira. Concluiu Biotecnologia pela Universidade Técnica de Lisboa em 2010. É - Mount Sinai Hospital. Publicou 18 artigos em revistas especializadas, possui 3 capítulos de livros publicados. Possui 36 itens de produção técnica. Participou em 2 eventos no estrangeiro e 2 em Portugal. Recebeu 1 prémio e/ou homenagem. Actua nas áreas de Ciências Médicas com ênfase em Biotecnologia Médica, Engenharia e Tecnologia com ênfase em Biotecnologia Industrial, Ciências Naturais com ênfase em Ciências Biológicas e Ciências Exactas com ênfase em Ciências da Computação e da Informação. Nas suas actividades profissionais interagiu com 71 colaboradores em co-autorias de trabalhos científicos.
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Nome completo Full name	Pedro Henrique Couto Oliveira
Nome em citações bibliográficas Quoting name	Oliveira, PH
Domínio científico de atuação Scientific domain	Ciências Médicas-Biotecnologia Médica. Engenharia e Tecnologia-Biotecnologia Industrial. Ciências Naturais-Ciências Biológicas. Ciências Exactas-Ciências da Computação e da Informação.

Endereço profissional Professional address

Mount Sinai Hospital 1 Gustave L. Levy Place 1002-9 New York Estados Unidos Correio electrónico: pcphco@gmail.com Homepage: http://icahn.mssm.edu

Sexo Gender

Masculino»Male

2006-2010	Doutoramento Phd
Biotecnologia (4 anos » years) . Universidade Técnica de Lisboa, Portugal.

1999-2005	Licenciatura Licentiate degree
Engenharia Biológica (5 anos » years) . Universidade Técnica de Lisboa, Portugal.

2013	Pós-Doutoramento Postdoctorate
3 anos » years. Institut Pasteur, França.

2010-2012	Pós-Doutoramento Postdoctorate
4 anos » years. Universidade Técnica de Lisboa, Portugal.

2008-2009	Outros Others
Bioengineering. Massachusetts Institute of Technology, Estados Unidos.

2005-2005	Outros Others
Bioengineering. University of London, Reino Unido.

Universidade Técnica de Lisboa

Jan/2010-Dez/2012

Outra Situação

Compreende Understandig	Português (Bem), Inglês (Bem), Francês (Razoavelmente), Chinês (Pouco), Espanhol (Razoavelmente).
Fala Speaking	Português (Bem), Inglês (Bem), Francês (Razoavelmente), Chinês (Pouco), Espanhol (Razoavelmente).
Lê Reading	Português (Bem), Inglês (Bem), Francês (Bem), Chinês (Pouco), Espanhol (Razoavelmente).
Escreve Writing	Português (Bem), Inglês (Bem), Francês (Razoavelmente), Chinês (Pouco), Espanhol (Razoavelmente).

2010	Top-Cited Article, Elsevier.

Capítulos de livros publicados Published book chapters

1.	Oliveira, PH. 2014. DNA instability in bacterial genomes: causes and consequences.  In Genome Analysis: Current Procedures and Applications, ed. Maria Poptsova, 261 - 284. ISBN: 978-1-908230-29-4. UK: Horizon Press.

2.	Marcos, João C; Oliveira, PH. 2012. Biofármacos: Desafios e Limitações.  In Conversas com Ciência, 63 - 65. ISBN: 978-989-98077-0-9. Braga, Portugal: Escola de Ciências da Universidade do Minho.

3.	Oliveira, PH; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. 2012. Structural and segregational instability in plasmid biology.  In Plasmids: Genetics, Applications and Health, 79 - 100. ISBN: 978-1-62081-370-6. NY: Nova Publishers.

Artigos em revistas com arbitragem científica Papers in periodics with scientific refereeing

1.	Oliveira, Pedro H; Touchon, Marie; Cury, Jean; Rocha, Eduardo P. C. 2017. "The chromosomal organization of horizontal gene transfer in bacteria", Nature Communications 8, 1: 1 - 11.

2.	Oliveira, Pedro H; Touchon, Marie; Rocha, Eduardo P. C. 2016. "Regulation of genetic flux between bacteria by restriction–modification systems", Proceedings of the National Academy of Sciences, XX: 201603257 - 201603257.

3.	Oliveira, Pedro H; Silva, Cláudia L; Cabral, Joaquim M. S. 2014. "Genomic instability in human stem cells: Current status and future challenges", STEM CELLS 32, 11: 2824 - 2832.

4.	Gonçalves, Geisa A. L; Oliveira, Pedro H; Gomes, Ana G; Prather, Kristala L. J; Lewis, Leslie A; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. 2014. "Evidence that the insertion events of IS2 transposition are biased towards abrupt compositional shifts in target DNA and modulated by a diverse set of culture parameters", Applied Microbiology and Biotechnology 98, 15: 6609 - 6619.

5.	Oliveira, P. H; Touchon, M.; Rocha, E. P. C. 2014. "The interplay of restriction-modification systems with mobile genetic elements and their prokaryotic hosts", Nucleic Acids Research 42, 16: 10618 - 10631.

6.	Oliveira, Pedro H; Lobato da S. C; Cabral, Joaquim M. S. 2013. "An Appraisal of Human Mitochondrial DNA Instability: New Insights into the Role of Non-Canonical DNA Structures and Sequence Motifs", PLoS ONE 8, 3: e59907 - e59907.

7.	Oliveira, Pedro H; Mairhofer, Juergen. 2013. "Marker-free plasmids for biotechnological applications – implications and perspectives", Trends in Biotechnology 31, 9: 539 - 547.

8.	Lewis, Leslie A; Astatke, Mekbib; Umekubo, Peter T; Alvi, Shaheen; Saby, Robert; Afrose, Jehan; Oliveira, Pedro H; Monteiro, Gabriel A; Prazeres, Duarte M. F. 2012. "Protein-DNA Interactions Define the Mechanistic Aspects of Circle formation and Insertion Reactions in IS2 Transposition", Mobile DNA 3, 1: 1 - 1.

9.	Oliveira, Pedro H; Boura, Joana S; Abecasis, Manuel M; Gimble, Jeffrey M; da Silva, C. L; Cabral, Joaquim M. 2012. "Impact of hypoxia and long-term cultivation on the genomic stability and mitochondrial performance of ex vivo expanded human stem/stromal cells", Stem Cell Research 9, 3: 225 - 236.

10.	Borlido, L.; Azevedo, A.M.; Sousa, A.G.; Oliveira, P.H.; Roque, A.C.A.; Aires-Barros, M.R.. 2012. "Fishing human monoclonal antibodies from a CHO cell supernatant with boronic acid magnetic particles", Journal of Chromatography B 903, 1: 163 - 170.

11.	Oliveira, Pedro H; Prather, Kristala L. J; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. 2011. "Mutation detection in plasmid-based biopharmaceuticals", Biotechnology Journal 6, 4: 378 - 391.

12.	Oliveira, Pedro H; Prather, Kristala J; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. 2010. "Analysis of DNA repeats in bacterial plasmids reveals the potential for recurrent instability events", Applied Microbiology and Biotechnology 87, 6: 2157 - 2167.

13.	Oliveira, Pedro H; Prather, Kristala J; Prazeres, Duarte M; Monteiro, Gabriel A. 2009. "Structural instability of plasmid biopharmaceuticals: challenges and implications", Trends in Biotechnology 27, 9: 503 - 511.

14.	Oliveira, Pedro H; Prazeres, Duarte M; Monteiro, Gabriel A. 2009. "Deletion formation mutations in plasmid expression vectors are unfavored by runaway amplification conditions and differentially selected under kanamycin stress", Journal of Biotechnology 143, 4: 231 - 238.

15.	Ribeiro, Sofia C; Oliveira, Pedro H; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. 2008. "High Frequency Plasmid Recombination Mediated by 28 bp Direct Repeats", Molecular Biotechnology 40, 3: 252 - 260.

16.	Oliveira, Pedro H; Lemos, Francisco; Monteiro, Gabriel A; Prazeres, Duarte M. 2008. "Recombination frequency in plasmid DNA containing direct repeats—predictive correlation with repeat and intervening sequence length", Plasmid 60, 2: 159 - 165.

17.	Oliveira, P.H.; Batagov, A.; Ward, J.; Baganz, F.; Krabben, P.. 2006. "Identification of erythrobactin, a hydroxamate-type siderophore produced by Saccharopolyspora erythraea", Letters in Applied Microbiology 42, 4: 375 - 380.

18.	Aleixo, Ana I; Oliveira, Pedro H; Diogo, Hermínio P; Minas da P. M. E. 2005. "Enthalpies of formation and lattice enthalpies of alkaline metal acetates", Thermochimica Acta 428, 1-2: 131 - 136.

Trabalhos completos/resumidos em eventos com arbitragem científica Papers in conference proceedings with scientific refereeing

1.	Oliveira, Pedro H; Boura, Joana S; Abecasis, Manuel M; da Silva, C. L; Cabral, Joaquim M. S. 2011. "An appraisal of genetic stability in human mesenchymal stem cells", Trabalho apresentado em 2011 1st Portuguese Meeting in Bioengineering ¿ The Challenge of the XXI Century (ENBENG), In 1st Portuguese Biomedical Engineering Meeting, Lisbon, Portugal.

Apresentação oral de trabalho Oral work presentation

1.	Oliveira, PH; Touchon, M.; Rocha, E. P. C. Restriction-modification systems as key players in horizontal gene transfer and genome diversification,7th New England Biolabs (NEB) Meeting,Poland,2015 (Congresso).

2.	Oliveira, PH; Touchon, M.; Rocha, E. P. C. Genetic mobility and the distribution of restriction modification systems in prokaryotes,13th European Conference on Computational Biology (ECCB 2014) (Selected for F1000 Posters),Strasbourg,2014 (Poster).

3.	Oliveira, PH; Touchon, M.; Rocha, E. P. C. Genetic mobility and the distribution of restriction modification systems in prokaryotes,EMBO Conference on Microbiology after the Genomics Revolution: Genomes 2014,Paris,2014 (Poster).

4.	Oliveira, PH; Rocha, E. P. C. A comparative genomics approach provides new insights into the distribution and evolutionary history of restriction modification systems in bacteria,Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution,Chicago,2013 (Congresso).

5.

Lewis, Leslie A; Gonçalves, Geisa A. L; Oliveira, PH; Astatke, Mekbib; Gomes, Ana G; Prather, Kristala L. J; Alvi, Shaheen; Saby, Robert; Afrose, Jehan; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. Mechanistic definition of IS2 transposition and the basis for its non-random insertional specificity in relevant DNA-based biopharmaceuticals.,2013 (Congresso).

6.

Oliveira, PH; Boura, Joana S; Abecasis, Manuel M; Gimble, Jeffrey M; da Silva, C. L; Cabral, Joaquim M. Effect of hypoxia and long-term culture on the genomic stability and mitochondrial performance of human mesenchymal stem cells expanded in vitro for clinical applications,15th European Congress on Biotechnology-Biocrossroads,Istanbul,2012 (Poster).

7.	Gonçalves, G.A.L.; Oliveira, PH; Lewis, Leslie A; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. Identification of IS2 transposition in pVAX1-based plasmid, a common vector for DNA vaccine development,15th European Congress on Biotechnology-Biocrossroads,Turkey,2012 (Poster).

8.	Gomes, A.G.; Oliveira, PH. Comparative genomic analysis indicates strand compositional asymmetries as regional landmarks in plasmid evolution,15th European Congress on Biotechnology-Biocrossroads,2012 (Poster).

9.	Oliveira, PH; da Silva, C. L; Cabral, Joaquim M. S. An appraisal of human mtDNA instability: role of DNA topology and composition,3rd Scientific Meeting of the Institute for Biotechnology and Bioengineering,Lisbon,2012 (Congresso).

10.	Oliveira, PH; Gonçalves, G.A.L.; Lewis, Leslie A; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. Preferential transposition of the mobile element IS2 into AT- and GC-skew polarity switches,15th European Congress on Biotechnology-Biocrossroads,2012 (Poster).

11.	Oliveira, PH. Biological Reactors in Health and Biotechnology,2012 (Seminário).

12.	Oliveira, PH; da Silva, C. L; Cabral, Joaquim M. S. An appraisal of human mtDNA instability: role of DNA topology and sequence motifs,15th European Congress on Biotechnology-Biocrossroads,Istanbul,2012 (Congresso).

13.	Oliveira, PH; Boura, Joana S; Abecasis, Manuel M; Gimble, J.; da Silva, C. L; Cabral, Joaquim M. S. An appraisal of genetic stability during the ex-vivo expansion of human mesenchymal stem cells,11th International Symposium on Mutations in the Genome,Santorini,2011 (Poster).

14.	Oliveira, PH; da Silva, C. L; Cabral, Joaquim M. S. Unusual DNA structures and instability motifs correlate with human mitochondrial deletion breakpoints involved in genetic disorders and cancer,11th International Symposium on Mutations in the Genome,Santorini,2011 (Poster).

15.	Oliveira, PH; Boura, Joana S; Abecasis, Manuel M; da Silva, C. L; Cabral, Joaquim M. S. An appraisal of genetic stability in human mesenchymal stem cells,1st Portuguese Meeting in Bioengineering,Lisbon,2011 (Congresso).

16.

Oliveira, PH; Boura, Joana S; Abecasis, Manuel M; Gimble, J.; da Silva, C. L; Cabral, Joaquim M. S. Genetic stability during the ex-vivo expansion of human mesenchymal stem cells for clinical applications,6th International Meeting of the Portuguese Society for Stem Cells and Cellular Therapy (SPCE-TC),Cantanhede,2011 (Congresso).

17.

Oliveira, PH; da Silva, C. L; Cabral, Joaquim M. S. Bias in human mitochondrial DNA repeat distribution correlates with common deletion/amplification breakpoints involved in genetic disorders and cancer,5th International Meeting of the Portuguese Society for Stem Cells and Cellular Therapy (SPCE-TC),Guimarães,2010 (Congresso).

18.	Oliveira, PH; Lopes, G.; Prather, Kristala J; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. Structural instability in plasmid biopharmaceuticals for DNA vaccination,2nd Scientific Meeting of the Institute for Biotechnology and Bioengineering,Braga,2010 (Congresso).

19.

Lopes, G.; Oliveira, Pedro H; Prather, Kristala L. J; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. Rational engineering of E. coli strains and vectors for improved manufacturing of plasmid biopharmaceuticals,2nd MIT-Portugal Annual Conference: Creating Value through Systems Thinking,Porto,2010 (Poster).

20.	Oliveira, PH; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. Hotspots for recombination are widespread among plasmid vectors,3rd FEMS congress,Gothenburg,2009 (Poster).

21.	Oliveira, PH; Prather, Kristala L. J; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. Structural instability in plasmid vectors for DNA vaccination,MicroBiotec 2009,Vilamoura,2009 (Congresso).

22.

Oliveira, PH; Prather, Kristala J; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. III International Conference on Environmental, Industrial and Microbial Biotechnology (BioMicroWorld),III International Conference on Environmental, Industrial and Microbial Biotechnology (BioMicroWorld),Lisbon,2009 (Congresso).

23.	Monteiro, Gabriel A; Prazeres, Duarte M. F; Azzoni, A.; Ribeiro, Sofia C; Carvalho, J.; Oliveira, Pedro H; Freitas, S.; Magalhães, S.; Lima, J.; Beira, J.. Design and stability of plasmid vectors,Ist Scientific Meeting of the Institute for Biotechnology and Bioengineering (IBB),Faro,2009 (Poster).

24.

Oliveira, PH; Prather, Kristala J; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. Genome-wide analysis of DNA repeats in bacterial plasmids identifies genetically unstable hotspots and candidate regions for minimization,8th European Symposium on Biochemical Engineering Science (ESBES),Bologna,2009 (Poster).

25.	Santos, Ricardo; Marques, Marco P; Oliveira, Pedro H; Carvalho, F.; Carvalho, C.; Monteiro, Gabriel A; Cabral, Joaquim M. S; Frade, R.; Silva, M.; Fernandes, P.. The sunny side of mycobacteria,30th Annual Congress of the European Society of Mycobacteriology,Porto,2009 (Congresso).

26.	Monteiro, Gabriel A; Prazeres, Duarte M. F; Fonseca, L.P.; Martins, S.; Oliveira, Pedro H; Azzoni, A.; Lima, J.. Quality control and monitoring of plasmid biopharmaceuticals,Ist Scientific Meeting of the Institute for Biotechnology and Bioengineering (IBB),Faro,2009 (Poster).

27.	Oliveira, PH; Prather, Kristala L. J; Prazeres, Duarte M; Monteiro, Gabriel A. Rational engineering of E. coli strains and vectors for improved manufacturing of plasmid biopharmaceuticals,1st MIT-Portugal Annual Conference: Engineering for Better Jobs,Lisbon,2009 (Poster).

28.	Oliveira, PH; Prazeres, Duarte M; Monteiro, Gabriel A. Plasmid DNA instability mediated by direct repeats and type-2 insertion sequences,EMBO conference Recombination Mechanisms,Il Ciocco,2008 (Poster).

29.	Oliveira, PH; Marques, Marco P; Santos, Ricardo; Claudino, M.; Monteiro, Gabriel A; Cabral, J.M.S.. Searching for a multipurpose Mycobacterium,XIIIrd MicroBiotec,Lisbon,2007 (Poster).

30.	Oliveira, PH; Nunes, S.C.; Ribeiro, Sofia C; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. Kanamycin-induced recombination in E. coli cells harbouring plasmids with direct repeats,32nd FEBS Congress – Molecular Machines,Vienna,2007 (Poster).

31.	Oliveira, PH; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. Plasmid recombination by direct repeats and type 2 insertion sequences,XIIIrd MicroBiotec,Lisbon,2007 (Poster).

32.	Oliveira, PH; Ribeiro, Sofia C; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. Deletions in Escherichia coli plasmids harbouring direct repeats – Environmental factors and the adaptive response,XVth National Congress of Biochemistry,Aveiro,2006 (Poster).

33.	Oliveira, PH; Linde, E.; Baganz, F.; Ward, J.; Krabben, P.. From genome to improved antibiotic production by Saccharopolyspora erythraea,ExGen - Exploiting Genomics Grant Holders,Cambridge,2006 (Poster).

34.	Ribeiro, Sofia C; Oliveira, PH; Prazeres, Duarte M. F; Monteiro, Gabriel A. Stress-induced mutation in E. coli cells harbouring plasmids with direct repeats – The adaptive response,31st FEBS Congress – Molecules in health and disease,Istanbul,2006 (Congresso).

35.	Krabben, P.; Oliveira, Pedro H; Baganz, F.; Ward, J.. Exploring the substrate spectrum of the antibiotic producing bacteria Saccharopolyspora erythraea,12th European Congress on Biotechnology,Copenhagen,2005 (Congresso).

36.	Aleixo, Ana I; Oliveira, Pedro H; Diogo, Hermínio P; Minas da P. M. E. Enthalpies of formation of alkaline metal acetates,6th Mediterranean Conference on Calorimetry and Thermal Analysis,Porto,2003 (Poster).

Participação em eventos Event participation

Participação editorial em revistas Magazine editorial participation

Participação em eventos Event participation

Participação como Keynote Speaker Participation as Keynote Speaker

1.	Genetic mobility and the distribution of restriction modification systems in prokaryotes, 2014 (Encontro). Nome do evento: Department Days of Institut Pasteur; Nome da Instituição: Institut Pasteur.

2.	Mechanistic definition of IS2 transposition and the basis for its non-random insertional specificity in relevant DNA-based biopharmaceuticals, 2013 (Congresso). Nome do evento: 3rd Annual World Congress of Molecular and Cell Biology; Cidade do evento: Suzhou.

3.	Da sala de aula ao laboratório – Uma experiência na primeira pessoa, 2011 (Conferência). Nome do evento: Jornadas de Engenharia Química e Biológica (JEQB); Nome da Instituição: Instituto Superior Técnico; Cidade do evento: Lisbon.

4	Biofármacos: Desafios e Limitações, 2011 (Mesa-Redonda). Nome do evento: Tertúlias FNACiência; Cidade do evento: Guimarães / FNAC Guimarães.

Participação editorial em revistas Magazine editorial participation

1.	Oliveira, PH. Cell Death and Differentiation, Função ou tipo de participação: Reviewer.
2.	Oliveira, PH. Nucleic Acids Research, Função ou tipo de participação: Reviewer.
3.	Oliveira, PH. FEMS Microbiology Letters, Função ou tipo de participação: Reviewer.
4.	Oliveira, PH. Biomed Research International, Função ou tipo de participação: Corpo editorial.
5.	Oliveira, PH. Pharmaceutica Analytica Acta, Função ou tipo de participação: Reviewer.
6.	Oliveira, PH. PLoS ONE, Função ou tipo de participação: Reviewer.
7.	Oliveira, PH. Cell and Tissue Research, Função ou tipo de participação: Reviewer.
8.	Oliveira, PH. Bioinformatics, Função ou tipo de participação: Reviewer.
9.	Oliveira, PH. Scientific Reports, Função ou tipo de participação: Reviewer.
10.	Oliveira, PH. Acta Biomaterialia, Função ou tipo de participação: Reviewer.
11.	Oliveira, PH. Food Technology and Biotechnology, Função ou tipo de participação: Reviewer.
12.	Oliveira, PH. BMC Genomics, Função ou tipo de participação: Reviewer.
13.	Oliveira, PH. Biotechnology Research International, desde 2012/02/01, Função ou tipo de participação: Reviewer.

Produção científica Scientific production

Produção técnica Technical production

Dados complementares data

Total

Produção científica Scientific production

22

Livros e capítulos Books and book chapters

3

Capítulos de livros publicados Published book chapters

3

Artigos científicos em revistas Papers in periodics

18

Com arbitragem científica With scientific refereeing

18

Trabalhos em eventos Papers in conference proceedings

1

Com arbitragem científica With scientific refereeing

1

Total

Produção técnica Technical production

36

Outros tipos de produção técnica Other technical production

36

Total

Dados complementares (Additional data)

17

Participação em Eventos Event participation

4

Participação editorial em revistas Magazine editorial participation

13

	Ana Cecilia Afonso Roque
	Ana Gabriela Gonçalves Neves Gomes
	Gabriel António Amaro Monteiro