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                  | Patrícia Joana Morais Ferreira Oliveira |  
                  |  | Data da última atualização
                        												»Last update
                        												:
                        												10/09/2018 |  
 
 Dados pessoais (Personal data)  
               
                  
                     | Nome completo Full name
 | Patrícia Joana Morais Ferreira Oliveira |  
                     | Nome em citações bibliográficas Quoting name
 | Oliveira, Patrícia Joana Morais Ferreira |  
                     | Domínio científico de atuação Scientific domain
 | Ciências Médicas-Ciências da Saúde. Ciências Exactas-Ciências da Computação e da Informação.
 
 |  
                  
                     | Endereço profissional Professional address
 | Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto
 Rua Dr. Roberto Frias s/n
 Porto
 4200-465 Porto
 Portugal
 Telefone: (+351)225570700Extensão: 3770
 Fax: (+351)225570799
 Correio electrónico: poliveira@ipatimup.pt
 Homepage: www.ipatimup.pt
 |  
                  
                     | Sexo Gender
 | Feminino»Female |  
 
                  			Graus Académicos
                  			 (Academic Degrees) 
               
                  
                     | 2007-2012 | Doutoramento Phd
 |  
                     | Doutoramento em Áreas de Biologia Básica e Aplicada
                        							(4 anos » years)
                        						. Universidade do Porto,
                        			Portugal.
 |  
                  
                     | 2000-2006 | Licenciatura Licentiate degree
 |  
                     | Bioquímica
                        							(4 anos » years)
                        						. Universidade de Coimbra,
                        			Portugal.
 |  
 Vínculos profissionais
                  				 (Professional Positions) 
               
                  
                     | Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto |  
                  
                     | Jan/2013-Actual | Outra Situação |  
                  
                     | Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto |  
                  
                     | Jan/2010-Set/2014 | Outra Situação |  
                  
                     | Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto |  
                  
                     | Fev/2012-Dez/2012 | Outra Situação |  
                  
                     | Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto |  
                  
                     | Jan/2009-Dez/2012 | Outra Situação |  
                  
                     | Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto |  
                  
                     | Jan/2007-Fev/2012 | Outra Situação |  
                  
                     | British Columbia Cancer Agency |  
                  
                     | Jun/2010-Jul/2010 | Outra Situação |  
                  
                     | Nov/2007-Mar/2009 | Outra Situação |  
 Línguas (Languages) 
               
                  
                     | Compreende Understandig
 | Inglês (Bem), Espanhol (Bem), Italiano (Bem). |  
                     | Fala Speaking
 | Inglês (Bem), Espanhol (Razoavelmente), Italiano (Razoavelmente). |  
                     | Lê Reading
 | Inglês (Bem), Espanhol (Razoavelmente), Italiano (Razoavelmente). |  
                     | Escreve Writing
 | Inglês  (Bem), Espanhol (Pouco), Italiano (Pouco). |  
 Prémios e títulos (Awards Prizes, and Honours) 
               
                  
                     | 2012 | Segundo Melhor Poster na Área de Oncobiologia na Conferência I3S 2012,
                        					I3S (Consórcio IPATIMUP/IBMC/INEB). |  
                     | 2015 | Finalista do "Young Investigator Award" da ESHG 2015,
                        					ESHG 2015. |  
 
                  											Produção científica, técnica e artística/cultural
                  											 (Scientific, technical and artistical/cultural
                     													production) 
               
                  
                     | Artigos em revistas com arbitragem científica Papers in periodics with scientific refereeing
 |  
                  
                     | 1. | Pinheiro, Hugo; Oliveira, PatrÃcia; Oliveira, Carla.  2015. "Hereditary Cancer Risk Assessment: Challenges for the Next-Gen Sequencing Era", Frontiers in Oncology 5, NA: NA - NA. 
 |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | Artigos em revistas sem arbitragem científica Papers in periodics without scientific refereeing
 |  
                  
                     | 1. |  Gullo, Irene; Carvalho, Joana; Martins, Diana; Lemos, Diana; Monteiro, Ana; Ferreira, Marta; Das, Kakoli; Tan, Patrick; Oliveira, Carla; Carneiro, Fátima; Oliveira, Patrícia.  2018. "The Transcriptomic Landscape of Gastric Cancer: Insights into Epstein-Barr Virus Infected and Microsatellite Unstable Tumors", International Journal of Molecular Sciences 19, 7: 2079 - 2079. 
 |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | 2. | Gullo, Irene; Oliveira, Patrícia; Athelogou, Maria; Gonçalves, Gilza; Pinto, Marta L; Carvalho, Joana; Valente, Ana; Pinheiro, Hugo; Andrade, Sara; Almeida, Gabriela M; Huss, Ralf; Das, Kakoli; Tan, Patrick; Machado, José C; Oliveira, Carla; Carneiro, Fátima.  2018. "New insights into the inflamed tumor immune microenvironment of gastric cancer with lymphoid stroma: from morphology and digital
                        analysis to gene expression", Gastric Cancer, NA: NA - NA. 
 |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | 3. | Ferreira, Pedro G; Muñoz-Aguirre, Manuel; Reverter, Ferran; Sá Godinho, C. P; Sousa, Abel; Amadoz, Alicia; Sodaei, Reza; Hidalgo, Marta R; Pervouchine, Dmitri; Carbonell-Caballero, Jose; Nurtdinov, Ramil; Breschi, Alessandra; Amador, Raziel; Oliveira, Patrícia; Çubuk, Cankut; Curado, João; Aguet, François; Oliveira, Carla; Dopazo, Joaquin; Sammeth, Michael; Ardlie, Kristin G; Guigó, Roderic.  2018. "The effects of death and post-mortem cold ischemia on human tissue transcriptomes", Nature Communications 9, 1: 490 - NA. 
 |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | 4. | Bidarra, S. J; Oliveira, P.; Rocha, S.; Saraiva, D. P; Oliveira, C.; Barrias, C. C.  2016. "A 3D in vitro model to explore the inter-conversion between epithelial and mesenchymal states during EMT and its reversion", Scientific Reports 6, 1: NA - NA. 
 |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | 5. |  Oliveira, Patrícia; Carvalho, Joana; Rocha, Sara; Azevedo, Mafalda; Reis, Inês; Camilo, Vânia; Sousa, Bárbara; Valente, Sofia; Paredes, Joana; Almeida, Raquel; Huntsman, David; Oliveira, Carla.  2016. "Dies1/VISTA expression loss is a recurrent event in gastric cancer due to epigenetic regulation", Scientific Reports 6, 1: NA - NA. 
 |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | 6. | Queirós, Pedro; Pinheiro, Hugo; Carvalho, Joana; Oliveira, Patrícia; Gullo, Irene; Carneiro, Fátima; Almeida, Gabriela M; Oliveira, Carla.  2015. "KRAS mutations in microsatellite instable gastric tumours: impact of targeted treatment and intratumoural heterogeneity", Virchows Archiv 467, 4: 383 - 392. 
 |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | 7. | Pereira, B.; Sousa, S.; Barros, R.; Carreto, L.; Oliveira, P.; Oliveira, C.; Chartier, N.T.; Plateroti, M.; Rouault, J.-P.; Freund, J.-N.; Billaud, M.; Almeida, R..  2013. "CDX2 regulation by the RNA-binding protein MEX3A: Impact on intestinal differentiation and stemness", Nucleic Acids Research 41, 7: 3986 - 39. |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | 8. | de-Freitas-Junior, Julio C. M; Carvalho, Sandra; Dias, Ana M; Oliveira, Patrícia; Cabral, Joana; Seruca, Raquel; Oliveira, Carla; Morgado-Díaz, José A; Reis, Celso A; Pinho, Salomé S; Tang, Chih-Hsin.  2013. "Insulin/IGF-I Signaling Pathways Enhances Tumor Cell Invasion through Bisecting GlcNAc N-glycans Modulation. An Interplay
                        with E-Cadherin", PLoS ONE 8, 11: e81579 - e81579. 
 |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | 9. | Paredes, Joana; Figueiredo, Joana; Albergaria, André; Oliveira, Patrícia; Carvalho, Joana; Ribeiro, Ana S; Caldeira, Joana; Costa, Ângela M; Simões-Correia, Joana; Oliveira, Maria J; Pinheiro, Hugo; Pinho, Salomé S; Mateus, Rita; Reis, Celso A; Leite, Marina; Fernandes, Maria S; Schmitt, Fernando; Carneiro, Fátima; Figueiredo, Céu; Oliveira, Carla; Seruca, Raquel.  2012. "Epithelial E- and P-cadherins: Role and clinical significance in cancer", Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Reviews on Cancer 1826, 2: 297 - 311. 
 |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | 10. |  Pinho, Salomé S; Oliveira, Patrícia; Cabral, Joana; Carvalho, Sandra; Huntsman, David; Gärtner, Fátima; Seruca, Raquel; Reis, Celso A; Oliveira, Carla; Deb, Sumitra.  2012. "Loss and Recovery of Mgat3 and GnT-III Mediated E-cadherin N-glycosylation Is a Mechanism Involved in Epithelial-Mesenchymal-Epithelial
                        Transitions", PLoS ONE 7, 3: e33191 - e3. 
 |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | 11. | Oliveira, Patrícia; Sanges, Remo; Huntsman, David; Stupka, Elia; Oliveira, Carla.  2012. "Characterization of the intronic portion of cadherin superfamily members, common cancer orchestrators", European Journal of Human Genetics 20, 8: 878 - 883. 
 |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | 12. | Carneiro, Patrícia; Fernandes, Maria S; Figueiredo, Joana; Caldeira, Joana; Carvalho, Joana; Pinheiro, Hugo; Leite, Marina; Melo, Soraia; Oliveira, Patrícia; Simões-Correia, Joana; Oliveira, Maria J; Carneiro, Fátima; Figueiredo, Céu; Paredes, Joana; Oliveira, Carla; Seruca, Raquel.  2012. "E-cadherin dysfunction in gastric cancer - Cellular consequences, clinical applications and open questions", FEBS Letters 586, 18: 2981 - 29. 
 |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | 13. | Pinheiro, H.; Carvalho, J.; Oliveira, P.; Ferreira, D.; Pinto, M.T.; Osoquot;rio, H.; Licastro, D.; Bordeira-carricquot;o, R.; Jordan, P.; Lazarevic, D.; Sanges, R.; Stupka, E.; Huntsman, D.; Seruca, R.; Oliveira, C..  2012. "Transcription initiation arising from E-cadherin/CDH1 intron2: A novel protein isoform that increases gastric cancer cell
                        invasion and angiogenesis", Human Molecular Genetics 21, 19: 4253 - 42. |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | 14. | Pinheiro, H.; Bordeira-Carrico, R.; Seixas, S.; Carvalho, J.; Senz, J.; Oliveira, P.; Inacio, P.; Gusmao, L.; Rocha, J.; Huntsman, D.; Seruca, R.; Oliveira, C..  2009. "Allele-specific CDH1 downregulation and hereditary diffuse gastric cancer", Human Molecular Genetics 19, 5: 943 - 952. 
 |  
                     |  |  |  |  
                  
                     | Outra produção científica Other scientific production
 |  
                  
                     | 1. | Oliveira, Patrícia J. M. F.  2012. "Identification of novel cis-regulatory elements in the cadherin superfamily and characterization of their role in cancer-related
                        processes". Porto: Universidade do Porto. |  
                  
                     | Apresentação oral de trabalho Oral work presentation
 |  
                  
                     | 1. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Oliveira, Carla; Pinheiro, Hugo; Huntsman, David; Ferreira, Daniel; Vinagre, João; Carneiro, Fátima; Azevedo, Mafalda; Heravi-Moussavi, Ali; Burleigh, Angela; Carvalho, Joana; Vieira, André. Through the looking glass: the reversion of EMT,2015 (Comunicação). |  
                  
                     | 2. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Oliveira, Carla. DNA/RNAomics applications in Cancer ,Módulo de Oncobiologia GABBA,Porto,2014 (Seminário). |  
                  
                     | 3. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Carvalho, J.; Azevedo, Mafalda; Ferreira, Daniel; Heravi-Moussavi, Ali; Vinagre, João; Mendes, Nuno; Carneiro, Fátima; Huntsman, David; Seruca, Raquel; Oliveira, Carla. An in vitro model of Epithelial-Mesenchymal-Epithelial transitions as a novel tool to study cancer progression,Working Group Meeting in Warsaw,Warsaw,2013 (Comunicação). |  
                  
                     | 4. | Oliveira, Patrícia J. M. F. (Re)-Creating a dynamic EMT/MET in vitro model: from cells to RNA and maybe to novel biomarkers,IV Simpósio de Anatomia Patológica,Porto,2013 (Conferência ou palestra). |  
                  
                     | 5. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Carvalho, Joana; Ferreira, Daniel; Heravi-Moussavi, Ali; Vinagre, João; Nunes, Joana; Máximo, Valdemar; Lima, Jorge; Huntsman, David; Seruca, Raquel; Oliveira, Carla. An in vitro model for Epithelial-Mesenchymal-Epithelial transitions as a novel tool to study cancer progression and metabolic
                        alterations,XX Porto Cancer Meeting,Porto,2012 (Poster). |  
                  
                     | 6. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Seruca, Raquel; Ferreira, Daniel; Azevedo, Mafalda; Vinagre, João; Mendes, Nuno; Carneiro, Fátima; Carvalho, Joana; Huntsman, David; Oliveira, Carla. An in vitro model for Epithelial-Mesenchymal-Epithelial transitions as a novel tool to study cancer progression,I3S Scientific Retreat,Povoa do Varzim,2012 (Poster). |  
                  
                     | 7. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Azevedo, Mafalda; Carvalho, Joana; Mendes, Nuno; Ferreira, Daniel; Vinagre, João; Carneiro, Fátima; Huntsman, David; Seruca, Raquel; Oliveira, Carla. An in vitro model of Epithelial-Mesenchymal-Epithelial transitions as a novel tool to study cancer progression,SINAL 2012,Braga,2012 (Comunicação). |  
                  
                     | 8. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Carvalho, Joana; Azevedo, Mafalda; Heravi-Moussavi, Ali; Ferreira, Daniel; Burleigh, Angela; Roskelley, Calvin; Stupka, Elia; Seruca, Raquel; Huntsman, David; Oliveira, Carla. Uncovering RNA-signatures underlying Epithelial-Mesenchymal transition and Mesenchymal-Epithelial transition,15th Annual GABBA Scientific Meeting,Porto,2011 (Comunicação). |  
                  
                     | 9. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Heravi-Moussavi, Ali; Burleigh, Angela; Roskelley, Calvin; Seruca, Raquel; Huntsman, David; Oliveira, Carla. Using an EMT/MET in vitro model to approach novel intronic based-mechanisms underlying pathological cadherin impairment,European Human Genetics Conference,Amesterdão,2011 (Poster). |  
                  
                     | 10. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Seruca, Raquel; Huntsman, David; Oliveira, Carla. Uncovering RNA-signatures underlying EMT and MET: targeting metastization,I3S Scientific Retreat,Póvoa do Varzim,2011 (Comunicação). |  
                  
                     | 11. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Sanges, Remo; Huntsman, David; Stupka, Elia; Seruca, Raquel; Oliveira, Carla. The importance of being intron: lessons from within cadherins,13th Portugalia Genetica,Porto,2010 (Poster). |  
                  
                     | 12. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Sanges, Remo; Seruca, Raquel; Huntsman, David; Stupka, Elia; Oliveira, Carla. Uncovering gene regulation: lessons from cadherin introns,XIX Porto Cancer Meeting,Porto,2010 (Poster). |  
                  
                     | 13. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Sanges, Remo; Stupka, Elia; Petrera, Francesca; Huntsman, David; Licastro, Danilo; Oliveira, Carla. New approaches in the search for novel regulatory regions underlying cadherin impairment,14th Annual GABBA Scientific Meeting,Porto,2010 (Comunicação). |  
                  
                     | 14. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Huntsman, David; Sanges, Remo; Oliveira, Carla; Seruca, Raquel; Stupka, Elia. From gene structure to regulation: the cadherin superfamily,I3S Scientific Retreat,Povoa do Varzim,2010 (Poster). |  
                  
                     | 15. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Sanges, Remo; Seruca, Raquel; Huntsman, David; Stupka, Elia; Oliveira, Carla. Bioinformatic analysis of the cadherin superfamily,13th Annual GABBA Scientific Meeting,Porto,2009 (Comunicação). |  
                  
                     | 16. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Sanges, Remo; Huntsman, David; Seruca, Raquel; Stupka, Elia; Oliveira, Carla. The importance of being intron: lessons from cadherins,13th Annual Meeting of the Portuguese Society for Human Genetics,Portugal,2009 (Comunicação). |  
                  
                     | 17. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Oliveira, Carla; Huntsman, David; Seruca, Raquel; Stupka, Elia; Sanges, Remo. Bioinformatic analysis of the cadherin superfamily,12th Annual GABBA Scientific Meeting,Porto,2008 (Comunicação). |  
                  
                     | 18. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Sanges, Remo; Huntsman, David; Stupka, Elia; Oliveira, Carla. Cadherin Regulation: Identification of novel cis-regulatory elements,11th Annual GABBA Scientific Meeting,Porto,2007 (Poster). |  
                  
                     | Organização de evento Event organization
 |  
                  
                     | 1. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Alves, João; Vinagre, João; Fernandes, Verónica; Dionísio, Maria R; Seca, Hugo. Uma Nova Perspectiva sobre o Genoma e A Comunicação Científica na Sociedade Portuguesa,2012 (Simpósio / Organização). |  
                  
                     | 2. | Oliveira, Patrícia J. M. F; Ataíde, Ricardo; Maia, Ana R; Cunha, Catarina; Vezillier, Julien; Bradic, Martina; Costa, Guilherme; Camboa, Nuno; Maia, Teresa; Manoel, Diogo; Barreira da S. R; Goulart, Luiz. Epigenetics: the Emperor's New Clothes?,2007 (Simpósio / Organização). |  
 Dados Complementares (Additional data) 
               
                  
                     | Dissertação de Mestrado Master degree dissertation
 |  
                  
                     | 1. | Sara Jorge Moreira da Rocha, Establishment of a 3D model of EMT/MET induction using molecularly-designed ECM-like hydrogels, 2014. Dissertação (Mestrado Integrado em Bioengenharia) - Universidade do Porto (Co-orientador). 
  |  
 
 
 
                  											Indicadores de produção
                  											 (Production indicators) 
               
                  
                     | Produção científica Scientific production
 |  
                     | Produção técnica Technical production
 |  
                     | Dados complementares data
 |  
 
                     
                        | Produção científica Scientific production
 | 16 |  
 
                     
                        | Artigos científicos em revistas Papers in periodics
 | 15 |  
                     
                        | Com arbitragem científica With scientific refereeing
 | 1 |  
                     
                        | Sem arbitragem científica Without scientific refereeing
 | 14 |  
                     
                        | Outros tipos de produção científica Other scientific production
 | 1 |  
 
                     
                        | Produção técnica Technical production
 | 20 |  
 
                     
                        | Outros tipos de produção técnica Other technical production
 | 20 |  
 
                     
                        | Dados complementares (Additional data)
 | 1 |  
 
                     
                        | Orientações Orientations
 | 1 |  Outras informações relevantes 
               
                  
                     | Domain of Specialization:
                        
                        Bioinformatics
                        
                        Analysis of Next Generation Sequencing raw data (whole genome sequencing, exome sequencing, targeted DNA sequencing) using
                        public and privately designed bioinformatics tools and pipelines;
                        
                        Analysis of Gene Expression and Tiling Microarrays using public and privately designed bioinformatics tools and pipelines;
                        
                        Data mining using Perl (programming language) and several online databases such as ENCODE, Ensembl, dbSNP;
                        
                        Database creation and management using MySQL;
                        
                        Data statistical analysis using R. 
 |  
               
                  | Visualizações do curriculum [
                     												1072
                     												] |  
               
                  | Página gerada pela Plataforma de Curricula DeGóis promovida pela FCT e pelo Gávea/DSI/UM
                     											em
                     											31-10-2018
                     											às
                     											20:09:55 |  
                  | Plataforma de Curricula DeGóis: http://www.degois.pt | Icons by Axialis Team |  |