Jose António Almeida Costa da Cruz Publicou 9 artigos em revistas especializadas e 2 trabalhos em actas de eventos. Possui 1 software. Nas suas actividades profissionais interagiu com 113 colaboradores em co-autorias de trabalhos científicos.
Endereço de acesso a este CV: http://www.degois.pt/visualizador/curriculum.jsp?key=7201929260297967

Nome completo Full name	Jose António Almeida Costa da Cruz
Nome em citações bibliográficas Quoting name	Cruz, Jose António Almeida Costa da

Sexo Gender

Masculino»Male

Capítulos de livros publicados Published book chapters

1.	Silvério, Francisco J; Certal, Ana C; de Ferro, C. M; Monteiro, Joana F; Cruz, José A; Ribeiro, Ricardo; Silva, João N. 2016. Automatic System for Zebrafish Counting in Fish Facility Tanks.  In Image Analysis and Recognition, ed. Aurélio CampilhoFakhri Karray, 774 - 782. ISBN: 978-3-319-41500-0. Cham: Springer International Publishing.

Artigos em revistas sem arbitragem científica Papers in periodics without scientific refereeing

1.	Cruz, Jose A. A. C.. 2015. " RNA-Puzzles Round II: assessment of RNA structure prediction programs applied to three large RNA structures ", RNA 21, 6: 1066 - 1084.

2.	Abril-de-Abreu, Rodrigo; Cruz, José; Oliveira, Rui F. 2015. "Social Eavesdropping in Zebrafish: Tuning of Attention to Social Interactions", Scientific Reports 5, 1: 1 - 7.

3.	Gabaldón, Toni; Martin, Tiphaine; Marcet-Houben, Marina; Durrens, Pascal; Bolotin-Fukuhara, Monique; Lespinet, Olivier; Arnaise, Sylvie; Boisnard, Stéphanie; Aguileta, Gabriela; Atanasova, Ralitsa; Bouchier, Christiane; Couloux, Arnaud; Creno, Sophie; Almeida Cruz, J; Devillers, Hugo; Enache-Angoulvant, Adela; Guitard, Juliette; Jaouen, Laure; Ma, Laurence; Marck, Christian; Neuvéglise, Cécile; Pelletier, Eric; Pinard, Amélie; Poulain, Julie; Recoquillay, Julien; Westhof, Eric; Wincker, Patrick; Dujon, Bernard; Hennequin, Christophe; Fairhead, Cécile. 2013. "Comparative genomics of emerging pathogens in the Candida glabrata clade", BMC Genomics 14, 1: 623 - 623.

4.	Cruz, J. A; Blanchet, M.-F.; Boniecki, M.; Bujnicki, J. M; Chen, S.-J.; Cao, S.; Das, R.; Ding, F.; Dokholyan, N. V; Flores, S. C; Huang, L.; Lavender, C. A; Lisi, V.; Major, F.; Mikolajczak, K.; Patel, D. J; Philips, A.; Puton, T.; Santalucia, J.; Sijenyi, F.; Hermann, T.; Rother, K.; Rother, M.; Serganov, A.; Skorupski, M.; Soltysinski, T.; Sripakdeevong, P.; Tuszynska, I.; Weeks, K. M; Waldsich, C.; Wildauer, M.; Leontis, N. B; Westhof, E.. 2012. "RNA-Puzzles: A CASP-like evaluation of RNA three-dimensional structure prediction", RNA 18, 4: 610 - 625.

5.	Louis, V. L; Despons, L.; Friedrich, A.; Martin, T.; Durrens, P.; Casaregola, S.; Neuveglise, C.; Fairhead, C.; Marck, C.; Cruz, J. A; Straub, M.-L.; Kugler, V.; Sacerdot, C.; Uzunov, Z.; Thierry, A.; Weiss, S.; Bleykasten, C.; De Montigny, J; Jacques, N.; Jung, P.; Lemaire, M.; Mallet, S.; Morel, G.; Richard, G.-F.; Sarkar, A.; Savel, G.; Schacherer, J.; Seret, M.-L.; Talla, E.; Samson, G.; Jubin, C.; Poulain, J.; Vacherie, B.; Barbe, V.; Pelletier, E.; Sherman, D. J; Westhof, E.; Weissenbach, J.; Baret, P. V; Wincker, P.; al., et. 2012. "Pichia sorbitophila, an Interspecies Yeast Hybrid, Reveals Early Steps of Genome Resolution After Polyploidization", G3: Genes|Genomes|Genetics 2, 2: 299 - 311.

6.	Cruz, José A; Westhof, Eric. 2011. "Sequence-based identification of 3D structural modules in RNA with RMDetect", Nature Methods 8, 6: 513 - 519.

7.	Cruz, José A; Westhof, Eric. 2011. "Identification and annotation of noncoding RNAs in Saccharomycotina", Comptes Rendus Biologies 334, 8-9: 671 - 678.

8.	Cruz, José A; Westhof, Eric. 2009. "The Dynamic Landscapes of RNA Architecture", Cell 136, 4: 604 - 609.

9.	Parisien, M.; Cruz, J. A; Westhof, E.; Major, F.. 2009. "New metrics for comparing and assessing discrepancies between RNA 3D structures and models", RNA 15, 10: 1875 - 1885.

Trabalhos completos/resumidos em eventos sem arbitragem científica Papers in conference proceedings without scientific refereeing

1.	Cruz, Jose A. A. C.; Westhof, Eric. 2011. "Sequence-based Identification of 3D Structural Modules in RNA", Trabalho apresentado em RNA 2011 – The 16th Annual Meeting of the RNA Society, In RNA 2011 – The 16th Annual Meeting of the RNA Society, Kyoto.

2.	Cruz, Jose A. A. C.; Westhof, Eric. 2009. "Analysis of RNA structure and sequence on Hemiascomycetous yeasts", Trabalho apresentado em Darwin09 – Trends in Complex Systems, In Darwin09 – Trends in Complex Systems, Palma de Mallorca.

Software sem registo ou patente Software without patent or official record

1.	Cruz, Jose A. A. C.; Westhof, Eric. RMDetect,2011.

Produção científica Scientific production

Produção técnica Technical production

Total

Produção científica Scientific production

12

Livros e capítulos Books and book chapters

1

Capítulos de livros publicados Published book chapters

1

Artigos científicos em revistas Papers in periodics

9

Sem arbitragem científica Without scientific refereeing

9

Trabalhos em eventos Papers in conference proceedings

2

Sem arbitragem científica Without scientific refereeing

2

Total

Produção técnica Technical production

1

Software

1

Software sem registo ou patente Software without patent or official record

1

	Carlos Jorge Velez Mão de Ferro
	Rui Filipe Nunes Pais de Oliveira