Rui Fonseca-Pinto received the Licenciado degree in Mathematics from the University of Évora in Portugal in 2000, and the M.Sc. degree in Applied Mathematics (Medical Physics) in 2004. He is post degree in Medical Physics and Biophysics and received his PhD in Biomedical Engineering and Biophysics in 2010 at the University of Lisbon, Portugal. He is also Medical Doctor- MSc at the Faculty of Medicine from the University of Lisbon. As research interests he has been enrolled in several interdisciplinary research teams linking Medicine and Engineering, in particular his main research studies are in the field of the Autonomic Nervous System Assessment and Dermoscopic image processing of skin melanocytic lesions, from whom he as published paper journals, and two book chapters. Currently he is also Professor at the Polytechnic Institute of Leiria, and Researcher at the Instituto de Telecomunicações, in the Multimedia Signal Processing Group, at the Leiria Branch of IT.
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Nome completo Full name	Rui Manuel Fonseca Pinto
Nome em citações bibliográficas Quoting name	Fonseca-Pinto R
Categoria profissional Position	Professor Adjunto
Domínio científico de atuação Scientific domain	Engenharia e Tecnologia-Engenharia Electrotécnica, Electrónica e Informática. Ciências Médicas-Medicina Básica. Ciências Médicas-Outras Ciências Médicas.

Endereço profissional Professional address

Instituto Politécnico de Leiria Escola Superior de Tecnologia e Gestão Departamento de Matemática Campus 2 Morro do Lena - Alto do Vieiro Apartado 4163 2411-901 Leiria Leiria 2411-901 Leiria Portugal Telefone: (+351)244820300 Fax: (+351)244820310 Correio electrónico: rui.pinto@ipleiria.pt Homepage: https://www.it.pt/Members/Index/4382

Sexo Gender

Masculino»Male

2010-2017	Mestrado Master degree
Medicina (6 anos » years) . Faculdade de Medicina da Universidade de Lisboa, Portugal.

2004-2009	Doutoramento Phd
Biomedical Engineering and Biophysics (5 anos » years) . Universidade de Lisboa, Portugal.

2002-2004	Mestrado Master degree
Matemática Aplicada (2 anos » years) . Universidade de Évora, Portugal.

1996-2001	Licenciatura Licentiate degree
Matemática (5 anos » years) . Universidade de Évora, Portugal.

2004-2005	Especialização/ Pós-Graduação Specialization/ Postgraduation
Física Médica e Engenharia Biomédica. Instituto de Biofísica e Engenharia Biomédica, Portugal.

Universidade Estadual do Oeste do Paraná

Jun/2016-Actual

Outra Situação

Instituto de Telecomunicações, delegação de Leiria

Jan/2013-Actual

Outra Situação

Instituto Politécnico de Leiria

Mai/2009-Actual

Professor Adjunto

Instituto Politécnico de Leiria

Set/2002-Abr/2009

Assistente 1º triénio

Ministério da Educação

Set/2001-Ago/2002

Outra Situação

Universidade de Évora

Set/2000-Ago/2001

Estagiário

Participação como Investigador responsável Participation as responsible Researcher

2017-2019 MOVIDA - Prescrição e MOnitorização de AtiVIDAde Física-MOVIDA - A Physical Exercise Prescription Platform

Referência do projeto»Project reference: 02/SAICT2016/23878. FCT

2017-2018 Laser Speckle in Medical Imaging

Referência do projeto»Project reference: LFLS. IT

2013-2015 Dermclass

Referência do projeto»Project reference: CENTRO-07-ST24-FEDER-002024.

Participação como Investigador Participation as Researcher

2016- Machine Learning in Dermoscopy-Machine Learning in Dermoscopy

Referência do projeto»Project reference: SR.

2016- DermoPleno-DermoPleno

Referência do projeto»Project reference: PEst-OE/EEI/LA0008/2016.

2014-2015 Sympath - MAPPING THE SYMPATHETIC EFFERENT ACTIVITY IN CAROTID-BODY MEDIATED INSULIN RESISTANCE-Sympath - MAPPING THE SYMPATHETIC EFFERENT ACTIVITY IN CAROTID-BODY MEDIATED INSULIN RESISTANCE

Referência do projeto»Project reference: EXPL/NEU-SCC/2183/2013. FCT

Compreende Understandig	Português (Bem), Inglês (Bem), Francês (Razoavelmente), Espanhol (Bem).
Fala Speaking	Português (Bem), Inglês (Bem), Francês (Razoavelmente), Espanhol (Razoavelmente).
Lê Reading	Português (Bem), Inglês (Bem), Francês (Bem), Espanhol (Bem).
Escreve Writing	Português (Bem), Inglês (Bem), Francês (Pouco), Espanhol (Pouco).

2010	Best paper award, IASTED - Signal Processing and Pattern Recognition and Applications Conference, Innsbruck, Austria.
2005	PhD grant (Bolsa de Doutoramento), FCT - Portuguese Fundation for Science and Technology.

Out/2017 - Actual	Ordem dos Médicos, Membro.
Set/2017 - Actual	Ordem dos Médicos, Membro.

Capítulos de livros publicados Published book chapters

1.	Pereira, Jorge; Mendes, Ana; Nogueira, Conceição; Baptista, Diogo; Fonseca-Pinto, Rui. 2015. An Adaptive Approach for Skin Lesion Segmentation in Dermoscopy Images Using a Multiscale Local Normalization.  In Dynamics, Games and Science, ed. Jean-Pierre BourguignonRolf JeltschAlberto Adrego PintoMarcelo Viana, 537 - 545. ISBN: 978-3-319-16117-4. Cham: Springer International Publishing.

2.	Fonseca-Pinto, Rui. 2011. A New Tool for Nonstationary and Nonlinear Signals: The Hilbert-Huang Transform in Biomedical Applications.  In Biomedical Engineering, Trends in Electronics, Communications and Software, ed. Anthony Laskovski, 481 - 504. ISBN: 978-953-307-475-7. -: InTech.

Artigos em revistas com arbitragem científica Papers in periodics with scientific refereeing

1.	Sacramento, Joana F; Ribeiro, Maria J; Rodrigues, Tiago; Olea, Elena; Melo, Bernardete F; Guarino, Maria P; Fonseca-Pinto, Rui; Ferreira, Cristiana R; Coelho, Joana; Obeso, Ana; Seiça, Raquel; Matafome, Paulo; Conde, Sílvia V. 2017. "Functional abolition of carotid body activity restores insulin action and glucose homeostasis in rats: key roles for visceral adipose tissue and the liver", Diabetologia 60, 1: 158 - 168.

2.	Santos, João M; Assunção, Pedro A. A; Cruz, Luis A. S; Távora, Luis; R, Fonseca-Pinto; Faria, Sérgio. 2017. "Performance evaluation of light field pre-processing methods for lossless standard coding", IEEE COMSOC MMTC Communications  12, 4: 44 - 49.

3.	Santos, João M; Assuncao, Pedro A; da Silva C. L. A; Tavora, Luis M; R, Fonseca-Pinto; Faria, Sergio M. 2017. "Performance evaluation of light field pre-processing methods for lossless standard coding", IEEE COMSOC MMTC Communications -Frontiers 12, 2: 1 - 5.

4.	Mendes, Ana I; Nogueira, Conceição; Pereira, Jorge; Fonseca-Pinto, Rui. 2016. "On the geometric modulation of skin lesion growth: a mathematical model for melanoma", Research on Biomedical Engineering 32, 1: 44 - 54.

5.	Machado, Marlene; Pereira, Jorge; Fonseca-Pinto, Rui. 2016. "Reticular pattern detection in dermoscopy: an approach using Curvelet Transform", Research on Biomedical Engineering 32, 2: 129 - 136.

6.	Machado, Marlene; Pereira, Jorge; Fonseca-Pinto, Rui. 2015. "Classification of reticular pattern and streaks in dermoscopic images based on texture analysis", Journal of Medical Imaging 2, 4: 044503 - 044503.

7.	R, Fonseca-Pinto; Pereira, Jorge. 2015. "Segmentation Strategies in Dermoscopy to Follow-up Melanoma: Combined Segmentation Scheme", The Online Journal of Science and Technology 5, 3: 56 - 61.

8.	R, Fonseca-Pinto. 2015. "Sistema de aquisição e registo de sinais biomédicos baseado numa plataforma de desenvolvimento open-source de baixo custo", Scripta Ingenia, 4: 12 - 16.

9.	R, Fonseca-Pinto. 2014. "Processamento de imagem digital e cancro de pele : uma abordagem interdisciplinar", Scripta-Ingenia, 2: 3 - 11.

10.	Marçal, Mariana; Augusto, Nádia; Janela, Sara; Vital, Emanuel; Guarino, Maria P; Dixe, Maria A; Parreira, Paula; R, Fonseca-Pinto. 2014. "Avaliação funcional em diabéticos tipo 2 com risco médio e elevado de pé diabético", Revista Portuguesa de Diabetes 9, 2: 73 - 82.

11.	Caseiro, P.; Fonseca-Pinto, Rui; Andrade, A.. 2012. "Screening of obstructive sleep apnoea in awake subjects", Journal of Sleep Research 21, 1: 1 - 371.

12.	Caseiro, P.; Fonseca-Pinto, R.; Andrade, A.. 2010. "Screening of obstructive sleep apnea using Hilbert–Huang decomposition of oronasal airway pressure recordings", Medical Engineering & Physics 32, 6: 561 - 568.

13.	Fonseca-Pinto, R.; Ducla-Soares, J.L.; Araújo, F.; Aguiar, P.; Andrade, A.. 2009. "On the influence of time-series length in EMD to extract frequency content: Simulations and models in biomedical signals", Medical Engineering & Physics 31, 6: 713 - 719.

Trabalhos completos/resumidos em eventos com arbitragem científica Papers in conference proceedings with scientific refereeing

1.	Fonseca-Pinto, Rui; Machado, Marlene. 2017. "A textured scale-based approach to melanocytic skin lesions in dermoscopy", Trabalho apresentado em 2017 40th International Convention on Information and Communication Technology, Electronics and Microelectronics (MIPRO), In 2017 40th International Convention on Information and Communication Technology, Electronics and Microelectronics (MIPRO), Opatija, Croatia.

2.	Machado, Marlene; Pereira, Jorge; Silva, Miguel; Fonseca-Pinto, Rui. 2017. "Finding a signature in dermoscopy: A color normalization proposal", Trabalho apresentado em 2017 40th International Convention on Information and Communication Technology, Electronics and Microelectronics (MIPRO), In 2017 40th International Convention on Information and Communication Technology, Electronics and Microelectronics (MIPRO), Opatija, Croatia.

3.	Duarte, Diana; Lopes, Nuno V; R, Fonseca-Pinto. 2016. "Pulse transit time estimation for continuous blood pressure measurement: A comparative study", Trabalho apresentado em IPLeiria's International Health Congress, In Proceedings of the 3rd IPLeiria’s International Health Congress, Leiria.

4.	Duarte, Diana; Lopes, Nuno V; R, Fonseca-Pinto. 2016. "Blood pressure assessment during standard clinical manoeuvres: A non-invasive PPT based approach", Trabalho apresentado em IPLeiria's International Health Congress, In Proceedings of the 3rd IPLeiria’s International Health Congress, Leiria.

5.	Mendes, Ana I; Lee, Huei D; Spolaôr, Newton; Oliva, Jefferson T; Chung, Wu F; R, Fonseca-Pinto. 2016. "Enlightening the human decision in health: The skin melanocytic classification challenge", Trabalho apresentado em IPLeiria' s International Health Congress, In Proceedings of the 3rd IPLeiria’s International Health Congress, Leiria.

6.	Rodrigues, Andreia; R, Fonseca-Pinto. 2015. "Phonocardiographyc Characterization by Time-Frequency Analysis: The Hilbert Huang Transform Approach ", Trabalho apresentado em Conftele, In Proceedings of the CONFTELE2016, Aveiro.

7.	Sacramento, Joana; R, Fonseca-Pinto; Guarino, Maria P; Conde, Sílvia. 2015. " Decreased endogenous insulin production improves whole-body insulin sensitivity: is this a sympathetically mediated effect?", Trabalho apresentado em ISAN 2015 - International Society for Autonomic Neuroscience, In Proceedings of the International Society of Autonomic Neuroscience ISAN2015 , Stresa.

8.	Marçal, Mariana; Augusto, Nádia; Janela, Sara; Vital, Emanuel; Parreira, Paula; R, Fonseca-Pinto. 2014. "Diabetes Type 2 and Risk of Fall: Functionality Assessment and Risk Group in Diabetic Foot", Trabalho apresentado em IPLeiria's 2nd Health Congress, In 2nd IPLeiria Internacional Health Congress | Challenges & Innovation in Health, Leiria.

9.	Mendes, Ana I; Nogueira, Conceição; Baptista, Diogo; Pereira, Jorge; R, Fonseca-Pinto. 2014. "Grow Model in Melanocytic Sin Lesions: A Geometric Look to Skin Pigmented Lesions", Trabalho apresentado em IPLeiria's Health Congress, In 2nd IPLeiria Internacional Health Congress | Challenges & Innovation in Health, Leiria.

10.	Bento, Luis N; R, Fonseca-Pinto. 2014. "Autonomic Nervous System Balance: Classic Analysis versus Time-Frequency Analysis", Trabalho apresentado em IPleiria's Health Congress, In 2nd IPLeiria Internacional Health Congress | Challenges & Innovation in Health, Leiria.

11.	Jardan, Daniel; Gil, João; Martins, Fernando; Ferreira, Lino; R, Fonseca-Pinto. 2014. "Continuous Autonomic Nervous System Evaluation and Inertial Anlysis", Trabalho apresentado em IPLeiria's Health Congress, In 2nd IPLeiria Internacional Health Congress | Challenges & Innovation in Health, Leiria.

12.	Baptista, Diogo; Mendes, Ana I; Nogueira, Conceição; Pereira, Jorge; R, Fonseca-Pinto. 2014. "Charaterization and Evaluation of Skin Lesions Using Symbolic Dynamics", Trabalho apresentado em IPLeiria's Health Congress, In 2nd IPLeiria Internacional Health Congress | Challenges & Innovation in Health, Leiria.

13.	Pereira, Jorge; Mendes, Ana I; Nogueira, Conceição; Baptista, Diogo; R, Fonseca-Pinto. 2014. "A Novel Method for Skin Lesion Segmentation Using a Multi-Scale Local Normalization", Trabalho apresentado em IPLeiria's Health Congress, In 2nd IPLeiria Internacional Health Congress | Challenges & Innovation in Health, Leiria.

14.	Fonseca-Pinto, Rui. 2011. "Regularity Measures for Autonomic Nervous System Data: Pseudoentropy as a Dynamic Marker", Trabalho apresentado em Signal and Image Processing, In Signal and Image Processing, Dallas, USA.

15.	R, Fonseca-Pinto. 2009. "Image Empirical Mode Decomposition (IEMD) in Dermoscopic Images: Artefact Removal and Lesion Border Detection", Trabalho apresentado em Signal Processing, Pattern Recognition and Applications, In Conference Proceedings of Signal Processing, Pattern Recognition and Applications, Innsbruck.

Artigos em revistas sem arbitragem científica Papers in periodics without scientific refereeing

1.	Santos, João M; Assuncao, Pedro A; da Silva C. L. A; Tavora, Luis M; Fonseca-Pinto, Rui; Faria, Sergio M. 2018. "Lossless coding of light field images based on minimum-rate predictors", Journal of Visual Communication and Image Representation 54, 1: 21 - 30.

2.	Lee, Huei D; Mendes, Ana I; Spolaôr, Newton; Oliva, Jefferson T; Sabino Parmezan, A. R; Wu, Feng C; Fonseca-Pinto, Rui. 2018. "Dermoscopic assisted diagnosis in melanoma: Reviewing results, optimizing methodologies and quantifying empirical guidelines", Knowledge-Based Systems 158, 158: 9 - 24.

3.	Bento, Luis; Fonseca-Pinto, Rui; Póvoa, Pedro. 2017. "Autonomic nervous system monitoring in intensive care as a prognostic tool. Systematic review", Revista Brasileira de Terapia Intensiva 29, 4: 481 - 489.

Trabalhos completos/resumidos em eventos sem arbitragem científica Papers in conference proceedings without scientific refereeing

1.	Santos, Joao M; Assuncao, Pedro A. A; da Silva C. L. A; Tavora, Luis; Fonseca-Pinto, Rui; Faria, Sergio M. M. 2017. "Lossless light-field compression using reversible colour transformations", Trabalho apresentado em 2017 Seventh International Conference on Image Processing Theory, Tools and Applications (IPTA), In 2017 Seventh International Conference on Image Processing Theory, Tools and Applications (IPTA), Montreal, QC.

Outra produção científica Other scientific production

1.	R, Fonseca-Pinto. 2010. "Novas abordagens ao estudo de sinais biomédicos: Análise tempo-frequência e Transformda de Hilbert-Huang", 222 pp.. Lisboa: FCUL - Universidade de Lisboa.

Apresentação oral de trabalho Oral work presentation

1.	Baptista, Alexandra N; Macedo, Cidália; Nogueira, Conceição; Baptista, Diogo; Ferreira, Liliana; R, Fonseca-Pinto. CiênciaLIZar – Centro de Recursos para o Ensino das Ciências,Investigação, Práticas e Contextos em Educação,Leiria,2016 (Poster).

2.	Baptista, Alexandra N; Nogueira, Conceição; Macedo, Cidália; Baptista, Diogo; Ferreira, Liliana; R, Fonseca-Pinto. A luz e as suas propriedades vão a escolas básicas,Investigação, Práticas e Contextos em Educação,Leiria,2016 (Poster).

3.

R, Fonseca-Pinto; Sacramento, Joana; Diogo, Lucília; Guarino, Maria P; Monteiro, Emília; Conde, Sílvia. Validation of a Sympathovagal Balance Model to Evaluate Autonomic Function in Rats using Time-Frequency Analysis,World Congress on Medical Physics & Biomedical Engineering. IUPESM 2015,Toronto,2015 (Comunicação).

4.	Parreiras, Hugo; Faria, Sérgio; R, Fonseca-Pinto. Accessing to the autonomic nervous system regulation by integrating ECG and accelerometer data,Hcist,VilaMoura,2012 (Poster).

5.	R, Fonseca-Pinto; Hughes, Laura; Rowe, J; Andrade, A.. Empirical Mode Decomposition Phase-Locking of Magnetoencephalography Mismatch-Negativity Data,Human Brain Mapping,Quebec,2011 (Poster).

Curso de curta duração lecionado Taught short course

1.	R, Fonseca-Pinto. Introdução ao Processamento de Biosinais, 2016 (Especialização), promovido por Universidade Feredal de Minas Gerais - UEFFTO. Duração: 5 horas. Local: Laboratório de Biomecânica, Cidade: Belo Horizonte, Tipo de participação: Docente.

Organização de evento Event organization

1.	R, Fonseca-Pinto; Faria, Paula; Mendes, Ana I. Métodos Matemáticos em Engenharia,2016 (Conferência / Organização).

Outra produção técnica Other technical production

1.	R, Fonseca-Pinto. Member of Technical Program Committee in The 2nd International Conference on Biomedical and Biological Engineering BBE2017,2017.

Orientações Orientations

Participação no júri de Graus Académicos Academic Degrees jury participation

Participação em eventos Event participation

Participação editorial em revistas Magazine editorial participation

Orientações Orientations

Tese de Doutoramento Phd Thesis

Em curso Ongoing

1.	Luis Filipe Nunes Bento, Contributo para a Monitorização do Sistema Nervoso Autonomo para a abordagem do doente com intabilidade hemodinâmica em ambiente de cuidados intensivos, 2015. Tese (Medicina) - Universidade Nova de Lisboa (Co-orientador).

Dissertação de Mestrado Master degree dissertation

Concluídas Completed

1.	Andreia Espírito Santo, Caraterização Funcional cardíaca por Fonocardiografia, 2016. Dissertação (Sistemas de Informação Médica) - Instituto Politécnico de Leiria (Orientador).

2.	Hugo Parreiras, Sistema de registo do controlo autonómico da variabilidade cardíaca, 2011. Dissertação (Engenharia Eletrotécnica) - Instituto Politécnico de Leiria (Orientador).

Em curso Ongoing

1.	Sara Igrejas, Area Interdisciplinar Integrada, 2012. Dissertação (Mestrado em Educação e Tecnologias em Matemática) - Instituto Politécnico de Leiria (Orientador).

Trabalho de conclusão de curso de Bacharelato/Licenciatura Bachelor/Licenciate degree conclusion work

Concluídas Completed

1.	Sara Janela, Nádia Augusto, Mariana Marçal, Avaliação funcional do pédiabético em diabéticos tipo 2, 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Licenciatura em Fisioterapia) - Instituto Politécnico de Leiria (Orientador).

Participação no júri de Graus Académicos Academic Degrees jury participation

Mestrado Master degree

1.	Fonseca-Pinto R. Participação no júri de Diana Margarida Oliveira Duarte. Metodologias para o cálculo de tempo de trânsito de pulso, 2016.  Dissertação (Sistemas de Informação Médica) - Instituto Politécnico de Leiria.

2.	Fonseca-Pinto R; Pedro Assunção; Caseiro, P.. Participação no júri de Hugo Parreiras. Sistema de registo do controlo autonómico da variabilidade cardíaca, 2012.  Dissertação (Engenharia Eletrotécnica) - Instituto Politécnico de Leiria.

Participação em eventos Event participation

Participação como Keynote Speaker Participation as Keynote Speaker

1.

Workshop on Modeling and Simulations of Cardiovascular Diseases and Cancer, 2017 (Workshop). Nome do evento: Workshop on Modeling and Simulations of Cardiovascular Diseases and Cancer November 13-15, 2017, ; Nome da Instituição: UTAustin | Portugal ; Cidade do evento: Lisbon / Lisbon Academy of Sciences, Portugal.

Outro tipo de participação Other kind of participation

1.	Eureka SD, 2016 (Outra). Nome do evento: Erasmus SD; Cidade do evento: Mar del Plata / Argentina.

2.	Erasmus LLP, 2015 (Outra). Nome do evento: Erasmus ; Nome da Instituição: Università di Bologna; Cidade do evento: Bologna / IRCCS Istituto delle Scienze Neurologiche di Bologna; Dipartimento di Scienze Biomediche e Neuromotorie.

3.	Erasmus LLP , 2008 (Outra). Nome do evento: Mobilidade Erasmus Docentes; Nome da Instituição: Esrasmus.

Participação editorial em revistas Magazine editorial participation

1.	Fonseca-Pinto R. International Journal of Bioinformatics and Biomedical Engineering, desde 2015/07/17, Função ou tipo de participação: Corpo editorial.
2.	Fonseca-Pinto R. International Journal of Life Science and Engineering, desde 2015/03/17, Função ou tipo de participação: Corpo editorial, Editora: Public Science Framework.
3.	Fonseca-Pinto R. Advances in Biomedical Science and Engineering, desde 2014/08/17, Função ou tipo de participação: Corpo editorial, Editora: Scientific Online Publishing.
4.	Fonseca-Pinto R. International Journal of Biometrics and Bioinformatics (IJBB), desde 2010/08/17, Função ou tipo de participação: Corpo editorial, Editora: CSC Journals.

Produção científica Scientific production

Produção técnica Technical production

Dados complementares data

Total

Produção científica Scientific production

35

Livros e capítulos Books and book chapters

2

Capítulos de livros publicados Published book chapters

2

Artigos científicos em revistas Papers in periodics

16

Com arbitragem científica With scientific refereeing

13

Sem arbitragem científica Without scientific refereeing

3

Trabalhos em eventos Papers in conference proceedings

16

Com arbitragem científica With scientific refereeing

15

Sem arbitragem científica Without scientific refereeing

1

Outros tipos de produção científica Other scientific production

1

Total

Produção técnica Technical production

8

Outros tipos de produção técnica Other technical production

8

Total

Dados complementares (Additional data)

15

Orientações Orientations

5

Participação no Júri de Graus Académicos Academic Degrees jury participation

2

Participação em Eventos Event participation

4

Participação editorial em revistas Magazine editorial participation

4

Luis Alberto da Silva Cruz