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Os Conselhos Científicos da FCT desempenham uma função de natureza consultiva e de apoio à atividade da FCT. Têm uma atuação diferenciada em função das respetivas áreas científicas e de desenvolvimento tecnológico. São membros destes Conselhos personalidades de reconhecido mérito nas respetivas áreas científicas.
Todos os anos a FCT abre concursos públicos para financiamento de propostas apresentadas por infra-estruturas, instituições, equipas de investigação ou indivíduos. O financiamento de propostas é sempre precedido por um rigoroso processo de avaliação, levado a cabo por peritos em Painéis de Avaliação nacionais e/ou internacionais.
A FCT convida os membros da comunidade científica de todas as áreas do conhecimento para Manifestação de Interesse em integrar: