On 12 Jan 2012, Carlos Cordeiro was appointed group leader of the Enzymology Group
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About Carlos Cordeiro
Investigador Auxiliar, Investigador do Centro de Química e Bioquímica (CQB) da Universidade de Lisboa
Habilitações Académicas
Doutoramento em Bioquímica (Processos de Oxidaçao-Reduçao), UL, 1996; Licenciatura em Bioquímica, FCUL, 1990
Actividade Docente /Teaching
Complementos de Análise Bioquímica (Mestrado em Bioquímica)
Interesses Científicos
Enzimologia in vivo: Desenvolvimento de métodos para estudos cinéticos de enzimas e vias metabólicas in vivo, combinando métodos cinéticos clássicos e análise de curvas de progressão. Desenvolveu a permeabilização selectiva da membrana celular da levedura com digitonina, viabilizando este tipo de estudos. Investiga o sistema dos glioxalases em levedura e em Leishmania a nível cinético e estrutural (cristalografia de raios-X).
Glicação de proteínas e doenças neurodegenerativas: A glicação de proteínas é o elemento unificador em patologias conformacionais como a doença de Alzheimer, Parkinson e Andrade. Utilisa a levedura como tubo de ensaio vivo para a expressão de proteínas relacionadas com estas patologias (b-amiloide, a-sinucleína e transtirretina). Desenvolveu métodos analíticos para o doseamento do metilglioxal e de produtos avançados de glicação (HPLC e LC-MS).
FTICR-MS em Proteómica: Os métodos de ionisação MALDI e ESI tornaram possível a análise de moléculas biológicas como as proteínas por espectrometria de massa. Uma das principais consequências foi a emergência da proteómica, a identificação e quantificação de proteínas em larga escala. O significado biológico desta informaçao requer a combinaçao da biologia de sistemas com a proteómica (http://gtpb.igc.gulbenkian.pt/PathProt). Uma investigaçao em curso é a pesquisa de alvos terapêuticos em Leishmania. Investiga actualmente o uso da massa exacta na identificação de proteínas e métodos de top-down para a caracterizaçao de proteínas. Responsável pela gestão do FTICR-MS (http://ftms.fc.ul.pt) do NÓ da FCUL da Rede Nacional de Espectrometria de Massa (http://rnem.fc.ul.pt).
Scientific Interests
In vivo enzymology: Developing methods for enzyme and metabolic pathway analysis in vivo, combining classic approaches with time course analysis. Developed a new method for selective yeast cell membrane permeabilization using digitonin. Research on the glyoxalase pathway in yeast and Leishmania at kinetic and structural levels (X-ray crystalography).
Protein glycation and neurodegenerative diseases: Protein glycation is the unifying element in conformational pathologies such as Alzheimer, Parkinson and Andrade. Using yeast as a living test tube to express human proteins (b-amyloid, a- synuclein and transthyretin) with different glycation phenotypes a proteome wide research of these protein effects in living cells is being conducted.
FTICR-MS in proteomics: MALDi and ESI ionization methods made possible the analysis of biological molecules, such as proteins, by mass spectrometry. One of the main consequences was the emergence of proteomics, the large scale identification and quantification of proteins coded by a given genome. To harness the biological significance of this information a novel approach is being developed, combining systems biology with proteomics (http://gtpb.igc.gulbenkian.pt/PathProt). An ongoing application is the search for therapeutic targets in Leishmania. Presently investigates the use of accurate mass for protein identification and top-down methods for protein characterization. Manages the FTICR-MS (http://ftms.fc.ul.pt) of the FCUL Node of Portuguese Mass Spectrometry Network (http://rnem.fc.ul.pt).
Projectos em Curso / On-going Projects
- Protein glycation and transthyretin amyloidogenesis in yeast: A model system of neurodegenerative amyloid diseases, PTDC/QUI/70610/2006 – Team Leader
- Pathways proteomics in Leishmania: Mapping the functional proteome towards novel therapeutic opportunities, PTDC/SAU-MIC/115178/2009 – Team Leader
- Analysis of the role of N-terminal acetyltransferases during Drosophila development, PTDC/QUI-BIQ/113027/2009 – Team Member
- Structural effects of metal ion chelation on human Tau 2N-4R and Abeta42: A step to further elucidate the role of metals on Alzheimerz’s disease, PTDC/QUI-QUI/105153/2008 – Team Member
Publicações Relevantes / Selected Publications
A non-invasive method based on saliva to characterize transthyretin in familial amyloidotic polyneuropathy patients using FT-ICR high-resolution MS, da Costa G, Guerreiro A, Correia CF, Gomes RJ, Freire A, Monteiro E, Barroso E, Coelho AV, Outeiro TF, Freire AP, Cordeiro C., Proteomics Clin Appl., 4, 674-678, 2010
Cloning, expression, purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of glyoxalase I from Leishmania infantum, Barata L, Sousa Silva M, Schuldt L, da Costa G, Tomás AM, Ferreira AE, Weiss MS, Ponces Freire A, Cordeiro C., Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 66, 5711-574, 2010
Identification and quantitative analysis of human transthyretin variants in human serum by Fourier transform ion-cyclotron resonance mass spectrometry., da Costa G, Gomes R, Correia CF, Freire A, Monteiro E, Martins A, Barroso E, Coelho AV, Outeiro TF, Ponces Freire A, Cordeiro C., Amyloid, 16, 201-207, 2009
Protein glycation in vivo: functional and structural effects on yeast enolase., Gomes RA, Oliveira LM, Silva M, Ascenso C, Quintas A, Costa G, Coelho AV, Sousa Silva M, Ferreira AE, Ponces Freire A, Cordeiro C., Biochem J. 416, 317-326, 2008
Catalysis and structural properties of Leishmania infantum glyoxalase II: trypanothione specificity and phylogeny., Silva MS, Barata L, Ferreira AE, Romão S, Tomás AM, Freire AP, Cordeiro C., Biochemistry, 47, 195-204, 2008