Cooperação Transnacional

ERA-NET PathoGenoMics

A FCT é parceira da rede PathoGenoMics(PGM), uma ERA-NET que teve início em 2004 e contou com a participação de 15 parceiros de 10 países europeus (Portugal, Alemanha, Áustria, Finlândia, França, Hungria, Israel, Letónia, Portugal, Eslovénia e Espanha), os quais cooperaram para promover e financiar investigação transnacional em genómica de microrganismos causadores de doença em humanos (com especial ênfase em estudos genómicos de bactérias e fungos) e para a implementação do Espaço Europeu de Investigação (EEI).

A PGM lançou três concursos transnacionais (2006, 2008 e 2010) com um orçamento total de 46 M€. Uma parte do orçamento disponível para os concursos lançados foi dedicada a consórcios em que todos os Investigadores Principais eram jovens investigadores (mínimo de 2/máximo 9 anos pós-Doutoramento). Foram submetidas a concurso 144 Pré-propostas das quais 34 propostas foram financiadas, o que corresponde a uma taxa de sucesso de 23,6 %. Dos consórcios financiados 11 contêm equipas portuguesas, 1 dos consórcios é coordenado por um jovem investigador português e tem a participação de uma outra equipa portuguesa. A FCT participou nos três concursos com financiamento total de aproximadamente 1,37 M€.

	Concursos
	2006	2008	2010
Projetos submetidos – Total	44	50	50
Projetos submetidos – PT	11	9	15
Parcerias estabelecidas	217	286	253
Países/Regiões	8	9	8
Projetos financiados – Total	12	13	9
Projetos financiados – PT	4	3	5
Financiamento – Total	16,6 M€	16,3 M€	9,0 M€
Financiamento – PT	0,46 M€	0,42 M€	0,49 M€
Parcerias estabelecidas	85	77	49
Taxa Sucesso – Total	27 %	26 %	18 %
Taxa Sucesso – PT	36 %	33 %	33 %

Projetos Financiados com Participação Portuguesa

CONCURSO 2010

• Analysis of the cellular mechanisms underlying the early response of the host to stress induced by Listeria infection. Projeto liderado em Portugal por Didier Cabanes (IBMC), com um orçamento total para 3 anos de 100 000 €.

• Helicobacter pylori diversity in pathogenesis, antibiotic resistance, and evasion from natural and vaccine-induced immune responses. Projeto liderado em Portugal por José Carlos Machado (IPATIMUP), com um orçamento total para 3 anos de 100 000 €.

• Global analysis of antisense regulatory mechanisms in Staphylococcus aureus. Projeto liderado em Portugal por Susana Domingos (ITQB), com um orçamento total para 3 anos de 87 500€.

• Characterisation of host cell pathways altered by effectors of Brucella, Chlamydia, and Coxiella: identification of novel therapeutic targets. Projeto com coordenação portuguesa de Jaime Mota (ITQB) e com a participação de outra equipa de investigação nacional liderada por João Paulo Domingues (INSA), com um orçamento total para 3 anos de 200 000 €.

CONCURSO 2008

• ADHRES-Signature Project. Projeto liderado em Portugal por Isabel Sá-Correia (IST), com um orçamento total para 3 anos de 93 432 €.

• Pathogenomic of increased Clostridium difficile virulence. Projeto liderado em Portugal por Adriano Henriques (ITQB), com um orçamento total para 3 anos de 181 800 €.

• Development, prevention and early diagnostic detection of Clostridium difficile-associated pseudomembranous colitis-an interdisciplinary network. Projeto liderado em Portugal por Miguel Godinho Lifewizz Lda., com um orçamento total para 3 anos de 142 000 €.

CONCURSO 2006

• Parasite and host genetic diversity in Helicobacter infections. Projeto liderado em Portugal por José Carlos Machado (IPATIMUP), com um orçamento total para 3 anos de 95 000 €.

• Large scale screening of potential key factors involved in the commensalism/virulence transition of Enterococcus faecali. Projeto liderado em Portugal por Maria de Fátima Silva Lopes (ITQB), com um orçamento total para 3 anos de 86 435 €.

• A global RNAi approach to unravel eukaryotic host functions that modulate bacterial infections. Projeto liderado em Portugal por Céu Figueiredo (IPATIMUP), com um orçamento total para 3 anos de 180 000 €.

• Spatio-temporal analysis of Listeria-host protein interactions. Projeto liderado em Portugal por Didier Cabanes (IBMC), com um orçamento total para 3 anos de 112 962 €.

Prémios

Um dos objetivos da PGM foi o de promover e incentivar a formação de recursos humanos em genómica de microrganismos causadores de doença em humanos. Neste âmbito, entre 2004 e 2012 foram abertos 6 concursos para premiar as melhores teses de Doutoramento nesta área. Cada estudante selecionado recebeu um prémio de 2000 € e foi-lhe oferecida a participação num congresso internacional com apresentação oral do trabalho de Doutoramento. Durante este período a PGM premiou 18 teses de doutoramento, 3 das quais de investigadores portugueses:

• João Paulo Gomes (2007): “Contribution for the understanding of biological differences among Chlamydia trachomatis serovars using genomics and transcriptomics”.
• Cristina Dias Rodrigues (2008): “Revealing Host Factors Important for Hepatocyte Infection by Plasmodium”.
• Alexandra Isabel Cardoso Nunes (2010): “Genomic and Transcriptomic Features of Chlamydia trachomatis: Tracking the Basis for the Ecological Success”.

Bases de dados e outras iniciativas

A PGM desenvolveu várias outras iniciativas para promover e estimular a colaboração e troca de ideias entre académicos, clínicos e empreendedores, como:
• Base de dados de Investigadores
• Base de dados de PMEs
• Mapa dos sequenciadores da próxima geração